用于碎片化核酸检测的组合物及其应用制造技术

技术编号:41329148 阅读:23 留言:0更新日期:2024-05-13 15:07
本发明专利技术涉及一种用于碎片化核酸检测的组合物及其应用,属于基因检测技术领域。该组合物包括:第一文库接头序列、第二文库接头序列、桥接寡核苷酸序列、靶核酸特异性引物和DNA聚合酶,第一文库接头序列和第二文库接头序列与靶核酸序列两端连接,桥接寡核苷酸序列包含与第一文库接头序列和第二文库接头序列配对的序列,第一文库接头序列和第二文库接头序列可在桥接寡核苷酸序列作用下环化,从而形成包含第一文库接头序列、靶核酸序列和第二文库接头序列的文库环,靶核酸特异性引物可配对至含有相应靶核酸序列的文库环上进行滚环扩增。采用该组合物能够对血液样本等含有高度碎片化样本进行检测,并获得较优的检测性能。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因检测,特别是涉及用于碎片化核酸检测的组合物及其应用


技术介绍

1、根据《world health statistics2021》和《2022中国卫生健康统计年鉴》,感染类疾病是人类死亡的重要原因。核酸检测因其兼具极高的灵敏度和特异性,已经在感染病原鉴定中发挥越来越重要的作用。传统的实时定量pcr(qpcr)技术等方法,虽具备廉价、快速等优势,但也有病原覆盖范围小等缺点。宏基因组学(mngs)技术具有无需预设全覆盖的优势,但受到样本宿主影响、成本高、流程复杂等缺点也限制了其应用。靶向超多重扩增子测序技术(mpcr-seq)填补了二者中间的空白地带,以相对廉价的成本,覆盖临床90%以上的常见病原,流程简单,成为病原检测的重要手段。

2、经典的mpcr-seq技术,基于pcr引物对靶病原的特异性扩增,从而富集病原序列,最后通过测序读取序列进行比对后鉴定病原,其原理如图1所示。

3、目前实践发现,以上经典的mpcr-seq技术对呼吸道的肺泡灌洗液、痰液等样本有比较好的研究和应用。但是对于血液样本,基于扩增子方法的技术无法本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于碎片化核酸检测的组合物,其特征在于,包括:第一文库接头序列、第二文库接头序列、桥接寡核苷酸序列、靶核酸特异性引物和DNA聚合酶,所述第一文库接头序列和第二文库接头序列用于分别与靶核酸序列两端连接,所述桥接寡核苷酸序列包含与所述第一文库接头序列和第二文库接头序列配对的序列,且所述第一文库接头序列和第二文库接头序列可在所述桥接寡核苷酸序列作用下环化,从而形成包含第一文库接头序列、靶核酸序列和第二文库接头序列的文库环,所述靶核酸特异性引物可配对至含有相应靶核酸序列的文库环上,所述DNA聚合酶可对配对的所述靶核酸特异性引物进行滚环扩增。

2.根据权利要求1所述的用于碎片化...

【技术特征摘要】

1.一种用于碎片化核酸检测的组合物,其特征在于,包括:第一文库接头序列、第二文库接头序列、桥接寡核苷酸序列、靶核酸特异性引物和dna聚合酶,所述第一文库接头序列和第二文库接头序列用于分别与靶核酸序列两端连接,所述桥接寡核苷酸序列包含与所述第一文库接头序列和第二文库接头序列配对的序列,且所述第一文库接头序列和第二文库接头序列可在所述桥接寡核苷酸序列作用下环化,从而形成包含第一文库接头序列、靶核酸序列和第二文库接头序列的文库环,所述靶核酸特异性引物可配对至含有相应靶核酸序列的文库环上,所述dna聚合酶可对配对的所述靶核酸特异性引物进行滚环扩增。

2.根据权利要求1所述的用于碎片化核酸检测的组合物,其特征在于,所述靶核酸序列的长度≤100bp,优选≤60bp,更优选≤50bp,进一步优选≤40bp,例如≤30bp、≤20bp、≤10bp;

3.根据权利要求1所述的用于碎片化核酸检测的组合物,其特征在于,所述第一文库接头序列、第二文库接头序列通过ta连接的方式与靶核酸序列连接。

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【专利技术属性】
技术研发人员:关瑞麟吴婉婷金雪洁曾伟奇许腾李永军王小锐
申请(专利权)人:广州微远基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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