病原微生物宏基因组生信分析参考品及其制备方法和应用技术

本发明专利技术涉及一种病原微生物宏基因组生信分析参考品及其制备方法和应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：建立丰度分布模型：收集临床样本的宏基因组检测数据，建立自变量为测序序列数目因变量为相对丰度的高斯回归模型；标准化高通量测序数据生成：获取参考基因组序列，模拟生成每种微生物物种预定读长和预定测序错误率的高通量序列数据；Gamma

【技术实现步骤摘要】
病原微生物宏基因组生信分析参考品及其制备方法和应用


[0001]本专利技术涉及基因检测
，特别是涉及一种病原微生物宏基因组生信分析参考品及其制备方法和应用。

技术介绍

[0002]病原微生物宏基因组技术不依赖于传统的微生物培养，能够快速、无偏差检测临床样本中多种微生物，该项技术解决了临床极大的病原学诊断问题，越来越多的医院将此项技术落地和转化。
[0003]但该检测方法由于整体流程复杂，目前仍然缺乏规范化的评价准则和适用的参考品。尤其对于宏基因组学中引起最广泛讨论的生物信息学分析流程，需要一套具有代表性和科学性的生物信息学分析性能确认参考品及其制备的相应技术，仍处于缺失的状态。
[0004]为此，国内外已有科学家进行了一些研究，得到了一些制备宏基因组模拟数据的软件和算法。但由于病原宏基因组技术检测出的结果包含临床样本中的致病原、人体微生态定植菌群和试剂工程菌等复杂的成分，仅通过简单地模拟是无法实现真正对病原宏基因组生物信息流程的性能确认。

技术实现思路

[0005]基于此，有必要针对上述问题，提供一种病原微本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种病原微生物宏基因组生信分析参考品的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：建立丰度分布模型：收集临床样本的宏基因组检测数据，按照样本类型，针对各微生物物种，分别建立自变量为测序序列数目、因变量为相对丰度的高斯回归模型，得到各微生物物种的丰度高斯分布模型，并获得每种微生物的均值和方差；标准化高通量测序数据生成：获取上述各微生物物种的参考基因组序列，模拟生成每种微生物物种预定读长和预定测序错误率的高通量序列数据，即为标准化高通量测序数据；Gamma
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泊松分布模型：以Gamma
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泊松分布模型方式拟合所述临床样本的宏基因组检测数据，获得模型参数，并建立Gamma
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泊松分布模型；参考品制备：以上述Gamma
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泊松分布模型随机产生一组模拟样本序列数据，并根据所述丰度高斯分布模型生成每一种微生物的序列数，再从所述标准化高通量测序数据中。2.根据权利要求1所述的病原微生物宏基因组生信分析参考品的制备方法，其特征在于，所述样本类型为：肺泡灌洗液、痰液、血浆和脑脊液。3.根据权利要求1所述的病原微生物宏基因组生信分析参考品的制备方法，其特征在于，所述微生物物种包括：致病病原微生物、人体微生态定植菌群和试剂工程菌。4.根据权利要求1所述的病原微生物宏基因组生信分析参考品的制备方法，其特征在于，所述预定读长为：50bp，75bp，150bp和300bp；所述标准化高通量测序数据的深度为10X。5.根据权利要求1所述的病原微生物宏基因组生信分析参考品的制...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨启文，朱盈，贾沛瑶，喻玮，杨斌，刘慧芳，韩士瑞，
申请(专利权)人：广州微远基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：