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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物技术和分子标记,具体涉及一种位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记及应用。
技术介绍
1、瘦肉率是猪遗传改良的重要目标之一。通过选择具有高瘦肉率的父母猪,可以逐代改良猪的遗传基因,使后代具有更高的瘦肉率。几十年来,人们通过传统的选育方法来提高瘦肉率以获得优秀的种猪,使得这个性状得到一定程度上的改良。但瘦肉率是复杂的数量性状,受多基因调控。因此,通过传统的选育方法来改良这个性状,耗时长且收效甚微。
2、随着高通量测序技术的发展,通过检测猪全基因组上的单核苷酸多态(singlenucleotide polymorphisms,snp)结合全基因组关联分析(genome-wide associationstudy,gwas)技术,可鉴别到影响数量性状的snp位点。因此,在猪的育种进程中利用gwas鉴别到的snp进行分子标记辅助选择技术改良猪的瘦肉率,将进一步加快瘦肉型种猪的育种进程,显著提高生猪养殖的经济效益。
3、杜洛克猪是杜长大商品猪的终端父本。对于商业猪养殖业来说,杜洛克猪的改良是提高生产性能和经济效益的关键因素之一。改善核心群杜洛克猪的瘦肉率性状有助于确保更多的优势遗传给后代,从而增强整个养殖业的竞争力。因此,对核心群杜洛克猪的瘦肉率性状进行改良,能够较大程度的将改良得到的优势遗传给商品猪后代,增强商品猪的生产竞争力,从而提高养殖场的经济效益。
技术实现思路
1、为了克服现有技术的不足和缺点,本专利技术的首要目的在于提供一种
2、本专利技术的另一目的在于提供上述位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记的应用。
3、本专利技术的再一目的在于提供一种鉴定上述位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记的引物对。
4、本专利技术的第四个目的在于提供上述引物对的应用。
5、本专利技术的第五个目的在于提供一种猪的遗传改良方法。
6、本专利技术的目的通过下述技术方案实现:
7、一种位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记,其snp位点对应于国际猪参考基因组11.1版本4号染色体上第74748396bp处的t>c突变;
8、所述的位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记的核苷酸序列如seqid no.1所示,其中序列中的m是t或c,导致猪瘦肉率性状的不同;
9、所述的位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记的snp位点为seq idno:1序列标注位置为123位的c123-t123的核苷酸突变(位于该序列片段第123核酸单碱基突变,命名为:g.74748396t>c);
10、所述的位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记在鉴定杜洛克猪瘦肉率性状和遗传育种中应用;
11、一种检测猪瘦肉率性状的方法,包含如下步骤:
12、检测位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记,所述的snp分子标记的snp位点单核苷酸是t还是c;
13、利用上述位于猪4号染色体上与瘦肉率相关的snp分子标记筛选高瘦肉率性状的猪品种的方法,包含如下步骤:
14、检测上述位于猪4号染色体上与瘦肉率相关的snp分子标记,所述分子标记的snp位点单核苷酸是t还是c,淘汰c保留t;
15、所述的猪为杜洛克其合成系;
16、所述的猪优选为加系杜洛克及其合成系;
17、一种用于鉴定上述位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记的引物对,包含引物primer-f和primer-r,其核苷酸序列如下:
18、上游引物primer-f:5’-ctgagccccagcaaagaaca-3’;
19、下游引物primer-r:5’-gttgttggagcccaggtcaa-3’;
20、所述的引物对在鉴定影响种猪瘦肉率性状中的应用;
21、所述的引物对在猪分子标记辅助育种中的应用;
22、所述的引物对在提高种猪瘦肉率中的应用;
23、一种猪的遗传改良的方法,包含如下步骤:
24、确定种猪核心群中种猪的上述位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记,并根据所述分子标记做出相应的选择:种猪的继代选育国际猪参考基因组11.1版本4号染色体上第74748396bp处的tt基因型的种猪个体,淘汰该点的ct基因型和cc基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因t的频率,从而增提高后代猪的瘦肉率;
25、所述的猪为杜洛克其合成系;
26、所述的猪优选为加系杜洛克及其合成系;
27、本专利技术相对于现有技术具有如下的优点及效果:
28、(1)本专利技术研究并确定影响瘦肉率相关的分子标记位于猪的4号染色体的核苷酸序列上,验证其对猪瘦肉率性状的影响效应,最终建立对瘦肉率性状进行快速改良的分子标记辅助选择育种技术,极大地改善了杜洛克及其合成系的选育进程,适应种猪市场的需求,提高了种猪的价格,为企业降低了育种成本,提高核心竞争力。通过优选该snp的优势等位基因,能够逐代增加优势等位基因频率,提高种猪瘦肉率,间接提高种猪肉质,加快猪遗传改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。
29、(2)本专利技术提供一种鉴定上述位于猪4号染色体上与瘦肉率相关的snp分子标记的引物对,通过该引物对,可建立高效准确的分子标记辅助育种技术,快速准确的对性状进行选育,加快育种进程。
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1.一种位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的SNP分子标记,其特征在于其SNP位点对应于国际猪参考基因组11.1版本4号染色体上第74748396bp处的T>C突变;
2.权利要求1所述的位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的SNP分子标记在鉴定杜洛克猪瘦肉率性状和遗传育种中的应用。
3.一种检测猪瘦肉率性状的方法,其特征在于包含如下步骤:
4.根据权利要求3所述的检测猪瘦肉率性状的方法,其特征在于:
5.一种用于鉴定上述位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的SNP分子标记的引物对,其特征在于包含引物primer-F和primer-R,其核苷酸序列如下:
6.权利要求5所述的引物对在鉴定影响种猪瘦肉率性状中的应用。
7.权利要求5所述的引物对在猪分子标记辅助育种中的应用。
8.权利要求5所述的引物对在提高种猪瘦肉率中的应用。
9.一种猪的遗传改良的方法,其特征在于包含如下步骤:
10.根据权利要求9所述的猪的遗传改良的方法,其特征在于:
【技术特征摘要】
1.一种位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记,其特征在于其snp位点对应于国际猪参考基因组11.1版本4号染色体上第74748396bp处的t>c突变;
2.权利要求1所述的位于猪4号染色体上与猪瘦肉率相关的snp分子标记在鉴定杜洛克猪瘦肉率性状和遗传育种中的应用。
3.一种检测猪瘦肉率性状的方法,其特征在于包含如下步骤:
4.根据权利要求3所述的检测猪瘦肉率性状的方法,其特征在于:
5.一种用于鉴定上述位...
【专利技术属性】
技术研发人员:郑恩琴,吴珍芳,杨杰,李亚军,邱益彬,吴杰,李紫聪,蔡更元,张泽宾,马福才,
申请(专利权)人:华南农业大学,
类型:发明
国别省市:
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