【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】编码AP
‑
1转录因子的密码子优化的核苷酸序列
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本
PCT
申请要求
2021
年2月
25
日提交的美国临时申请号
63/153,879
;
2021
年
10
月
28
日提交的美国临时申请号
63/263,231
;和
2022
年2月
11
日提交的美国临时申请号
63/309,380
的优先权权益,所述临时申请各自以引用的方式整体并入本文
。
[0003]对经由
EFS
‑
WEB
以电子方式提交的序列表的引用
[0004]在本申请中提交的电子提交的序列表
(
名称:
4385_068PC03_Seqlisting_ST25.txt
,大小:
99,232
字节;以及创建日期:
2022
年2月
22
日
)
的内容通过引用以其整体并入本文
。
[0005]本公开的主题总体上涉及与编码
AP
‑1转录因子的密码子优化的核苷酸序列有关的多核苷酸
、
多肽
、
细胞
、
载体
、
用途和试剂盒
。
[0006]专利技术背景r/>[0007]癌症免疫疗法依赖于利用
T
细胞
(
感染和患病细胞的免疫系统的主要杀伤细胞
)
攻击和杀伤肿瘤细胞
。
然而,免疫细胞靶向和杀死肿瘤细胞的能力受到肿瘤微环境中存在的各种免疫应答抑制剂的存在的抑制
。
因此,虽然
CAR T
细胞在治疗某些癌症方面取得了各种成功
(
例如,
KYMRIAH
TM
(tisagenlecleucel
,
Novartis)
和
YESCARTA
TM
(axicabtagene ciloleucel
,
Kite/Gilead)
已获得
FDA
批准
)
,但挑战仍然存在
。
例如,
CAR T
细胞免疫疗法的成功通常受限于接受者体内
CAR T
扩增程度,这通常需要大量细胞输注
。
此外,已经观察到转移的
CAR T
细胞的耗竭和持久性丧失,从而导致临床功效丧失和潜在复发
。
[0008]因此,仍然需要在癌症患者中具有可接受的安全性谱和高功效的新的改进的治疗选择
。
技术实现思路
[0009]本文提供了一种多核苷酸,其包含:
a)
与
SEQ ID NO:1
中所示的核酸序列具有至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
b)
与
SEQ ID NO:2
中所示的核酸序列具有至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
c)
与
SEQ ID NO:4
中所示的核酸序列具有至少约
30
%
、
至少约
40
%
、
至少约
50
%
、
至少约
60
%
、
至少约
70
%
、
至少约
80
%
、
至少约
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
d)
与
SEQ ID NO:5
中所示的核酸序列具有至少
79
%
、
至少
80
%
、
至少
81
%
、
至少
82
%
、
至少
83
%
、
至少
84
%
、
至少
85
%
、
至少
86
%
、
至少
87
%
、
至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
e)
与
SEQ ID NO:6
中所示的核酸序列具有至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
f)
与
SEQ ID NO:7
中所示的核酸序
列具有至少<本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含
a.
与
SEQ ID NO:1
中所示的核酸序列具有至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或至少约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
b.
与
SEQ ID NO:2
中所示的核酸序列具有至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
c.
与
SEQ ID NO:4
中所示的核酸序列具有至少约
30
%
、
至少约
40
%
、
至少约
50
%
、
至少约
60
%
、
至少约
70
%
、
至少约
80
%
、
至少约
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
d.
与
SEQ ID NO:5
中所示的核酸序列具有至少
79
%
、
至少
80
%
、
至少
81
%
、
至少
82
%
、
至少
83
%
、
至少
84
%
、
至少
85
%
、
至少
86
%
、
至少
87
%
、
至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
e.
与
SEQ ID NO:6
中所示的核酸序列具有至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
f.
与
SEQ ID NO:7
中所示的核酸序列具有至少
82
%
、
至少
83
%
、
至少
84
%
、
至少
85
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
g.
与
SEQ ID NO:8
中所示的核酸序列具有至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;
h.
与
SEQ ID NO:9
中所示的核酸序列具有至少
55
%
、
至少约
55
%
、
至少约
60
%
、
至少约
65
%
、
至少约
70
%
、
至少约
75
%
、
至少约
80
%
、
至少约
85
%
、
至少约
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;或
i.
与
SEQ ID NO:10
中所示的核酸序列具有至少
85
%
、
至少
86
%
、
至少
87
%
、
至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少约
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%
、
至少约
99
%或约
100
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。2.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:1
中所示的核酸序列具有至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。3.
如权利要求2所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:1
中所示的核酸序列
。4.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:2
中所示的核酸序列具有至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。5.
如权利要求4所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:2
中所示的核酸序列
。6.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:4
中所示的核酸序列具有至少约
30
%
、
至少约
40
%
、
至少约
50
%
、
至少约
60
%
、
至少约
70
%
、
至少约
80
%
、
至少约
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中
所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。7.
如权利要求6所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:4
中所示的核酸序列
。8.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:5
中所示的核酸序列具有至少
79
%
、
至少
80
%
、
至少
81
%
、
至少
82
%
、
至少
83
%
、
至少
84
%
、
至少
85
%
、
至少
86
%
、
至少
87
%
、
至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。9.
如权利要求8所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:5
中所示的核酸序列
。10.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:6
中所示的核酸序列具有至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。11.
如权利要求
10
所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:6
中所示的核酸序列
。12.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:7
中所示的核酸序列具有至少
82
%
、
至少
83
%
、
至少
84
%
、
至少
85
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。13.
如权利要求
12
所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:7
中所示的核酸序列
。14.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:8
中所示的核酸序列具有至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。15.
如权利要求
14
所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:8
中所示的核酸序列
。16.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:9
中所示的核酸序列具有至少
55
%
、
至少约
55
%
、
至少约
60
%
、
至少约
65
%
、
至少约
70
%
、
至少约
75
%
、
至少约
80
%
、
至少约
85
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。17.
如权利要求
16
所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:9
中所示的核酸序列
。18.
一种多核苷酸,所述多核苷酸包含与
SEQ ID NO:10
中所示的核酸序列具有至少
85
%
、
至少
86
%
、
至少
87
%
、
至少
88
%
、
至少
89
%
、
至少
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或至少约
99
%序列同一性的核苷酸序列;其中所述核苷酸序列编码
AP
‑1转录因子
。19.
如权利要求
18
所述的多核苷酸,其中所述核苷酸序列包含
SEQ ID NO:10
中所示的核酸序列
。20.
如权利要求1至
19
中任一项所述的多核苷酸,其中所述
AP
‑1转录因子包含与
SEQ ID NO:9
中所示的序列具有至少约
90
%
、
至少约
95
%
、
至少约
96
%
、
至少约
97
%
、
至少约
98
%或
至少约
99
%序列同一性的氨基酸序列
。21.
如权利要求1至
20
中任一项所述的多核苷酸,其还包含编码配体结合蛋白的核苷酸序列
。22.
如权利要求
21
所述的多核苷酸,其中所述配体结合蛋白包含嵌合抗原受体
(CAR)、T
细胞受体
(TCR)、
嵌合抗体
‑
T
细胞受体
(caTCR)、
嵌合信号传导受体
(CSR)、T
细胞受体模拟物
(TCR
模拟物
)
或其组合
。23.
如权利要求
22
所述的多核苷酸,其中所述
CAR
被设计为标准
CAR、
分体式
CAR、
关闭开关
CAR、
开启开关
CAR、
第一代
CAR、
第二代
CAR、
第三代
CAR
或第四代
CAR。24.
如权利要求
21
至
23
中任一项所述的多核苷酸,其中所述配体结合蛋白包含抗原结合结构域
、
跨膜结构域
、
共刺激结构域和
/
或细胞内信号传导结构域
。25.
如权利要求
24
所述的多核苷酸,其中所述抗原结合结构域特异性结合选自由以下组成的组的抗原:
AFP(
甲胎蛋白
)、
α
v
β6或另一种整联蛋白
、BCMA、Braf、B7
‑
H3、B7
‑
H6、CA9(
碳酸酐酶
9)、CCL
‑
1(C
‑
C
基序趋化因子配体
1)、CD5、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD30、CD33、CD38、CD40、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD45、CD47、CD56、CD66e、CD70、CD74、CD79a、CD79b、CD98、CD123、CD138、CD171、CD352、CEA(
癌胚抗原
)、
密封蛋白
18.2、
密封蛋白
6、c
‑
MET、DLL3(
δ
样蛋白
3)、DLL4、ENPP3(
外切核苷酸焦磷酸酶
/
磷酸二酯酶家族成员
3)、EpCAM、EPG
‑
2(
上皮糖蛋白
2)、EPG
‑
40、
肝配蛋白
B2、EPHa2(ephrine
受体
A2)、ERBB
二聚体
、
雌激素受体
、ETBR(
内皮素
B
受体
)、FAP
‑
α
(
成纤维细胞活化蛋白
α
)、
胎儿
AchR(
胎儿乙酰胆碱受体
)、FBP(
叶酸结合蛋白
)、FCRL5、FR
‑
α
(
叶酸受体
α
)、GCC(
鸟苷酸环化酶
C)、GD2、GD3、GPC2(
磷脂酰肌醇蛋白聚糖
2)、GPC3、gp100(
糖蛋白
100)、GPNMB(
糖蛋白
NMB)、GPRC5D(G
蛋白偶联受体
5D)、HER2、HER3、HER4、
乙型肝炎表面抗原
、HLA
‑
A1(
人白细胞抗原
Al)、HLA
‑
A2(
人白细胞抗原
A2)、HMW
‑
MAA(
人高分子量黑素瘤相关抗原
)、IGF1R(
胰岛素样生长因子1受体
)、Ig
κ
、Ig
λ
、IL
‑
22Ra(IL
‑
22
受体
α
)、IL
‑
13Ra2(IL
‑
13
受体
α
2)、KDR(
激酶插入结构域受体
)、LI
细胞粘附分子
(LI
‑
CAM)、Liv
‑
1、LRRC8A(
含有富亮氨酸重复序列的蛋白8家族成员
A)、Lewis Y、
黑素瘤相关抗原
(MAGE)
‑
A1、MAGE
‑
A3、MAGE
‑
A6、MART
‑
1(melan A)、
鼠巨细胞病毒
(MCMV)、MCSP(
黑素瘤相关硫酸软骨素蛋白聚糖
)、
间皮素
、
粘蛋白
1(MUC1)、MUC16、MHC/
肽复合物
(
例如,与衍生自
AFP、KRAS、HPV、NY
‑
ESO、MAGE
‑
A
和
WT1
的肽复合的
HLA
‑
A)、NCAM(
神经细胞粘附分子
)、Nectin
‑
4、NKG2D(
自然杀伤细胞家族2成员
D)
配体
、NY
‑
ESO、
癌胚抗原
、PD
‑
1、PD
‑
L1、PRAME(
黑素瘤优先表达抗原
)、
孕酮受体
、PSA (
前列腺特异性抗原
)、PSCA(
前列腺干细胞抗原
...
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