与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术提供了与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记及其应用，属于分子生物学技术领域，所述SNP分子标记，包括第一分子标记和/或第二分子标记；所述第一分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO：1所示，第34位为多态性位点，具有A/G多态性；所述第二分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO：2所示，第282位为多态性位点，具有C/T多态性。本发明专利技术的SNP分子标记能用于鉴定犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度或选育恐惧行为和/或分离焦虑行为程度低或程度高的犬，为缩短犬种繁育的时间以及减少犬种行为判断成本。行为判断成本。行为判断成本。

【技术实现步骤摘要】
与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于分子生物学
，具体涉及与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]家犬，简称犬或狗，是人类最亲密的朋友，长期与人类共享生活环境和食物资源。尽管在大多数情况下犬都十分温顺，但在面对犬认为可能产生危险的刺激时，犬会产生恐惧的情绪，伴随恐惧产生的行为反应大多是为了生存，但是过度的恐惧可能会造成行为问题，从而影响犬与人类之间的相处。家犬的恐惧反应各不相同，从退缩、靠近主人、将尾巴置于低处或夹在两腿之间，到吠叫、咆哮甚至咬人等行为，这些严重的恐惧行为和/或分离焦虑行为也会对人类造成严重的问题。对家犬来说，恐惧行为和/或分离焦虑行为可以粗略地分为社会性恐惧和非社会性恐惧。社会恐惧包括对陌生人和陌生犬的恐惧，而非社会恐惧包括对不同物体或情况的恐惧，如对新情况、噪音、高度、光滑或湿滑的地板的恐惧。超过60％的家犬在新的环境中都表现过恐惧反应。分离焦虑行为是指犬在与主人分离时的吠叫或破坏性行为，通常伴有或带有焦虑的行为，是一种较为常见的行为问题。
[0003]目前，关于犬行为的研究已有不少报道，但现有技术中针对品种犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为主要通过行为测试或调查问卷方式获得家犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为打分，从而判断该犬是否存在恐惧行为和/或分离焦虑行为、或以上两种行为的高低强弱。而针对恐惧行为和/或分离焦虑行为的遗传机制研究并无相关报道，不能在分子层面有效鉴别犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度。

技术实现思路

[0004]有鉴于此，本专利技术的目的在于提供与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记及其应用，基于本专利技术的SNP分子标记可以在分子层面有效鉴别犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度。
[0005]本专利技术提供了与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记，包括第一分子标记和/或第二分子标记；所述第一分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，第34位为多态性位点，具有A/G多态性；所述第二分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，第282位为多态性位点，具有C/T多态性。
[0006]优选的，所述第一SNP标记的多态性位点位于犬第10号染色体第7873071位；所述第二SNP标记的多态性位点位于犬第10号染色体第8183593位；存在C/T多态性；所述SNP分子标记基于家犬参考基因组canfam3.1。
[0007]本专利技术还提供了一种鉴定上述方案所述的SNP分子标记的引物组，所述引物组包括第一分子标记引物组和第二分子标记引物组；
[0008]所述第一分子标记引物组包括第一上游引物和第一下游引物；所述第一上游引物
的核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示；所述第一下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示；
[0009]所述第二分子标记引物组包括第二上游引物和第二下游引物；所述第二上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示；所述第二下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示。
[0010]本专利技术还提供了一种鉴定上述方案所述的SNP分子标记的试剂盒，包括上述方案所述的引物组。
[0011]本专利技术还提供了上述方案所述SNP分子标记作为检测靶标或者所述的引物组或者所述的试剂盒在鉴定犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度或者选育恐惧行为和/或分离焦虑行为程度低或程度高的犬中的应用。
[0012]优选的，所述恐惧行为和/或分离焦虑行为包括对陌生人的恐惧行为和/或焦虑行为、对陌生犬的恐惧行为和/或焦虑行为、非社会性恐惧行为和/或焦虑行为，以及与主人分离时的分离焦虑行为中的一种或几种。
[0013]优选的，所述犬包括大型犬、中型犬和小型犬；优选的，所述犬包括大丹犬、比格犬、西施犬、法国斗牛犬、哈多利系博美犬、吉娃娃、迷你贵宾、约克夏、杰克罗素梗、腊肠犬、可卡犬、沙皮犬、挪威猎鹿犬、罗威纳、英国斗牛犬、史宾格、史奇派克犬、巴哥犬、威尔士柯基、哈威那犬、西伯利亚雪橇犬、边境牧羊犬、喜乐蒂牧羊犬、灵缇犬、纽芬兰犬、骑士查理王犬、威玛猎犬、贵宾犬、比利时坦比连犬、欧亚犬、英国塞特犬、金毛寻回犬、德国短毛指示犬、芬兰狐狸犬、拉布拉多寻回犬、波士顿梗、边境梗、不列塔尼猎犬、新思舍科诱鸭巡回犬、德国牧羊犬、拳击犬、獒犬、澳大利亚牧羊犬、杜宾犬、哥顿塞特犬、伯恩山犬和爱尔兰猎狼犬。
[0014]本专利技术还提供了一种检测靶标在鉴定犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度或者选育恐惧行为和/或分离焦虑行为程度低或程度高的犬的方法，包括以下步骤：
[0015]检测待测犬基因中上述方案所述SNP分子标记在多态性位点处的基因；
[0016]当第一SNP分子标记的多态性位点为G和/或所述第二SNP分子标记的多态性位点为T时，判定犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为程度高；
[0017]或者，当第一SNP分子标记的多态性位点为A且所述第二SNP分子标记的多态性位点为C时，判定犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为程度低。
[0018]本专利技术还提供了上述方案所述SNP分子标记作为检测靶标在在兽医领域或犬繁育和训练中的应用。
[0019]本专利技术提供了一种与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记，包括第一分子标记和/或第二分子标记；所述第一分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，第34位为多态性位点，具有A/G多态性；所述第二分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，第282位为多态性位点，具有C/T多态性；所述第一SNP分子标记的多态性位点的基因为G的个体的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度显著高于基因为A的个体；所述第二SNP分子标记的多态性位点的基因为T的个体的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度显著高于基因型为C的个体。因此，本专利技术所述SNP分子标记能够用于鉴定犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度或者选育恐惧行为和/或分离焦虑行为程度低或程度高的犬，为缩短犬种繁育的时间以及减少犬种行为判断成本。
附图说明
[0020]图1是家犬对陌生人恐惧行为和/或焦虑行为的曼哈顿图，横坐标为染色体，纵坐标为软件计算出的位点与性状关联程度的
‑
log(P)值，每一个点代表一个SNP位点，如果位点的
‑
P值越小，那么
‑
log(P)值越大，表明这个点与犬对陌生人恐惧行为和/或焦虑行为之间越显著关联；
[0021]图2是家犬对陌生人恐惧行为和/或焦虑行为的QQ图，横坐标表示期望P值，纵坐标表示每个位点实际计算出的P值，位点位于标准线的上方，意味着我们的计算结果可信度较高；
[0022]图3是家犬对陌生犬恐惧行为和/或焦虑行为的曼哈顿图，横坐标为染色体，纵坐标为软件计算出的位点与性状关联程度的
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log(P)值，每一个点代表一个SNP位点，如果位点的
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P值越小，那么<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.与犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为相关的SNP分子标记，包括第一分子标记和/或第二分子标记；所述第一分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，第34位为多态性位点，具有A/G多态性；所述第二分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，第282位为多态性位点，具有C/T多态性。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述第一SNP标记的多态性位点位于犬第10号染色体第7873071位；所述第二SNP标记的多态性位点位于犬第10号染色体第8183593位；存在C/T多态性；所述SNP分子标记基于家犬参考基因组canfam3.1。3.一种鉴定权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物组，其特征在于：所述引物组包括第一分子标记引物组和第二分子标记引物组；所述第一分子标记引物组包括第一上游引物和第一下游引物；所述第一上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示；所述第一下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示；所述第二分子标记引物组包括第二上游引物和第二下游引物；所述第二上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示；所述第二下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示。4.一种鉴定权利要求1或2所述的SNP分子标记的试剂盒，包括权利要求3所述的引物组。5.权利要求1或2所述SNP分子标记作为检测靶标或者权利要求3所述的引物组或者权利要求4所述的试剂盒在鉴定犬的恐惧行为和/或分离焦虑行为的程度或者选育恐惧行为和/或分离焦虑行为程度低或程度高的犬中的应用。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在...

【专利技术属性】
技术研发人员：王璐，孙华，张亚平，严雨，
申请(专利权)人：云南大学，
类型：发明
国别省市：