一种与瓯江彩鲤体表体色相关的结构变异分子标记、特异引物及其应用制造技术

本发明专利技术属于分子标记辅助育种技术领域，具体公开了一种与瓯江彩鲤体表体色相关的结构变异分子标记、特异引物及其应用。在白色品系“粉玉”瓯江彩鲤Scarb1基因上游启动子区域(起始密码子ATG上游652bp处)有355bp的DNA片段插入，而纯合红色品系“全红”瓯江彩鲤无此355bp的DNA片段插入，该DNA片段即为所述的结构变异分子标记，其序列如SEQ ID NO:1所示。所述结构变异分子标记的特异引物如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。利用所述特异引物对待测红色品系瓯江彩鲤的基因组DNA进行PCR扩增，并对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳图谱的条带大小即可判定红色品系瓯江彩鲤是纯合型还是杂合型。本发明专利技术能够辅助瓯江彩鲤的遗传育种工作，实现低成本且准确高效的红色品系瓯江彩鲤保种和选育。保种和选育。保种和选育。

【技术实现步骤摘要】
一种与瓯江彩鲤体表体色相关的结构变异分子标记、特异引物及其应用


[0001]本专利技术属于分子标记辅助育种
，具体涉及一种与瓯江彩鲤体表体色相关的结构变异分子标记、特异引物及其应用。

技术介绍

[0002]瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)是浙江省瓯江流域广泛养殖的一种地方性鲤鱼种类，体色鲜艳，具有食用和观赏双重价值，已有1200余年的当地养殖历史。自1999年以来，以体色和生长等性状为选育指标，进行了“全红”(全身体表为红色)、“大花”(红色体表镶嵌大块黑色斑块)、“麻花”(红色体表镶嵌小的黑色斑点)、“粉玉”(全身体表为白色)和“粉花”(白色体表镶嵌大块黑色斑块)5个配套选育系的构建和选育，其体色纯度和生长速度、形态性状等均已取得了明显的选育效果。
[0003]在我国市场上，消费者明显偏爱体色为红色的瓯江彩鲤，“红色”成为了瓯江彩鲤的一种“包装性状”，红色瓯江彩鲤市场占有率高，售价也相对较高。然而，对于瓯江彩鲤的体色性状而言，红色对于白色在遗传上为显性性状。当纯合“全红”与“粉玉”瓯江彩鲤杂交后，子本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与瓯江彩鲤体表体色相关的结构变异分子标记，其特征在于：所述结构变异分子标记是瓯江彩鲤Scarb1基因起始密码子ATG上游652bp处的插入或缺失的355bp的DNA片段，其序列如SEQ ID NO:1所示。2.根据权利要求1所述的与瓯江彩鲤体表体色相关的结构变异分子标记，其特征在于：白色品系瓯江彩鲤表现为所述结构变异分子标记的插入，纯合红色品系瓯江彩鲤表现为所述结构变异分子标记的缺失。3.权利要求1所述的结构变异分子标记的特异引物，其特征在于：所述特异引物的序列为：正向引物：5'
‑
GCGCTCCAAAAGAATCCTAAGC
‑
3'；反向引物：5'
‑
ACGCCTCCTACAGCTAGATAGA
‑
3'。4.权利要求1所述的结构变异分子标记在鉴定红色品系瓯江彩鲤遗传纯度中的应用。5.根据权利要求4所述的结构变异分子标记的应用，其特征在于：应用方法包括以下步骤：(1)收集待测红色品系瓯江彩鲤个体尾鳍样品，提取基因组DNA；(2)采用权利要求3所述的特异引物对基因组DNA进行PCR扩增；(3)将PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测，并根据电...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈晓雯，王军，柯景，王成辉，
申请(专利权)人：上海海洋大学，
类型：发明
国别省市：