妇科内分泌疾病相关微生物标志物的筛选方法、系统及应用技术方案

本发明专利技术提供妇科内分泌疾病相关微生物标志物的筛选方法、系统及应用，筛选方法包括如下步骤：S1、微生物标本采集及处理，从研究样本的口腔和肠道中收集微生物标本，所述研究样本包括妇科内分泌疾病患者样本和健康者样本；S2、对微生物标本进行菌群信息分析，获得微生物菌群特征及微生物属普变化情况；S3、基于微生物属谱变化情况，筛选和鉴定与妇科内分泌疾病具有关联性的通用微生物组衍生特征；S4、构建动物模型，建立口腔

【技术实现步骤摘要】
妇科内分泌疾病相关微生物标志物的筛选方法、系统及应用


[0001]本专利技术属于微生物检测领域，具体涉及妇科内分泌疾病相关微生物标志物的筛选方法、系统及应用。

技术介绍

[0002]妇科内分泌疾病是一种妇科疾病，也是一种内分泌疾病。妇科疾病是关于内外生殖系统发生的炎症、肿瘤、外伤等。妇科内外生殖系统中的一个重要器官是卵巢，卵巢有可能长肿瘤，有可能发生外伤，也有可能产生炎症，而卵巢的一个重要功能是分泌各种各样的激素。故，妇科内分泌主要是研究与卵巢所产生的激素、以及由于激素产生的前后发生的排卵相关的一门学科。妇科内分泌疾病即包含了与生殖、与雌激素有关的病症。如，多囊卵巢综合症、卵巢早衰、更年期综合征、绝经后骨质疏松症、黄褐斑、乳房增生、乳腺癌，性早熟，闭经、月经失调，生长发育迟缓、不孕不育；以及另外一些顽固性便秘、脾气暴躁、肤色发暗、肥胖潮热，耳鸣眩晕、抑郁、失眠、易激动焦虑、神经过敏，血管痉挛头痛、乳房胀痛等。
[0003]在人体内，肠道微生物是构成人体微生物组的重要组成部分，也被称为人体第二基因组。近年来多项研究表明，肠道菌群失调与糖尿病等多种胰岛素抵抗相关疾病有着密切联系。目前也有很多研究表明肠道微生物的失衡与妇科内分泌疾病之间存在联系。如2017年Pedro JT等人(Torres PJ,Siakowska M,Banaszewska B,et al.Gut Microbial Diversity in Women with Polycystic Ovary Syndrome Correlates with Hyperandrogenism.J Clin Endocrinol Metab.2018,103(1):1
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15.)基于扩增子技术，研究了PCOS(多囊卵巢综合症)患者和健康人群在肠道微生物物种多样性及构成上的差异，显示在PCOS人群中肠道微生物物种多样性显著降低，并与高雄激素水平负相关。同样在2017年，Liu R等人(Liu R,Zhang C,Shi Y,et al.Dysbiosis of Gut Microbiota Associated with Clinical Parameters in Polycystic Ovary Syndrome.Front Microbiol.2017,8:1
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12.)基于扩增子技术，研究了PCOS患者与体重正常人对照，并将PCOS患者分为肥胖和非肥胖进行对比，结果显示在PCOS患者中，拟杆菌、埃希氏菌/志贺氏菌和链球菌属的细菌显著上升，并与瘦素水平负相关，与睾酮和体重指数(BMI)呈正相关，同时观察到PCOS患者中AKK菌(Akkermansia muciniphila，肠道中一种可降解黏蛋白的细菌)和瘤胃球菌科显著下降。
[0004]现有技术多从分析患者人群和健康人群的肠道微生物基本构成的差异性出发，尚缺乏其他体系微生物菌群的多维度研究。口腔系统是连通人体内外的交通枢纽，为人体共生菌群非常重要的栖息位点，并且唾液微生物群是微生态系统的另一个主要组成部分，也可能对潜在的肠道病理产生不利影响。因此，通过研究口腔中微生物菌群与妇科内分泌疾病的联系，对未来妇科内分泌疾病的预防和及早治疗具有重要意义。
[0005]已有公开号为“CN111278995A”的中国专利申请，公开了“表征与微生物相关联的女性生殖系统有关状况的方法和系统”，具体公开了：确定与用户集合相关联的微生物数据集S110；和/或基于所述微生物数据集，执行与所述一种或多种女性生殖系统有关状况相关
联的表征过程S130，其中执行所述表征过程可以额外地或替代地包括针对一种或多种女性生殖系统有关状况执行女性生殖系统有关表征过程S135，和/或确定一种或多种疗法S140。一方面，该专利技术针对女性生殖系统相关状况，主要涉及宫颈癌的表征；另一方面，该专利技术提供的方案较为宽泛，样品收集位点广，难以精准获取与病症高度相关联的微生物菌群，尤其针对与卵巢分泌激素有关的病症，未能获得高度相关联的微生物菌群。

技术实现思路

[0006]为此，本专利技术提供妇科内分泌疾病相关微生物标志物的筛选方法、系统及应用。解决现有技术中基于临床检查和判断的一套甚至多套判断规则较为复杂，缺少有效获得灵敏度和特异度均较高的用于制备妇科内分泌疾病检测产品中的微生物标志物的技术问题。
[0007]本专利技术提供的一个技术方案为妇科内分泌疾病相关微生物标志物的筛选方法，包括如下步骤：
[0008]S1、微生物标本采集及处理，从研究样本的口腔和肠道中收集微生物标本，所述研究样本包括妇科内分泌疾病患者样本和健康者样本；
[0009]S2、对微生物标本进行菌群信息分析，获得微生物菌群特征及微生物属普变化情况；
[0010]S3、基于微生物属谱变化情况，筛选和鉴定与妇科内分泌疾病具有关联性的通用微生物组衍生特征；
[0011]S4、构建动物模型，建立口腔
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肠道
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卵巢轴作用关系。
[0012]优选的，所述妇科内分泌疾病包括多囊卵巢综合征、早发性卵巢功能不全、子宫内膜异位症、不孕、高雄激素血症、绝经、围绝经期综合征和绝经后骨质疏松。
[0013]优选的，步骤S2中，所述菌群信息分析包括：
[0014]S2.1检测口腔和肠道微生物菌群的功能丰度；
[0015]S2.2分析口腔和肠道微生物菌群的多样性；
[0016]S2.3分析妇科内分泌疾病患者样本的口腔和肠道微生物菌群的失调情况。
[0017]优选的，所述步骤S2.1中，通过靶向测序分析、宏基因组测序分析、或qPCR(quantitative polymerase chainreaction)分析来检测口腔和肠道微生物菌群的功能丰度；
[0018]其中，所述靶向测序分析是16s rDNA测序分析。
[0019]优选的，所述步骤S2.2包括：分析与妇科内分泌疾病相关的口腔和肠道微生物群落结构，获得口腔和肠道中微生物标本的属水平的微生物菌群分布模式；分析隔室内和隔室之间的α和β多样性，获得研究样本的组间差异情况和微生物标本的组间差异情况。
[0020]优选的，所述步骤S2.3中，应用线性判别分析效应量，获得妇科内分泌疾病患者样本的口腔微生物、肠道微生物菌群的富集及缺损情况，以及口腔微生物、肠道微生物菌群的差异丰度与临床因素的关联性。
[0021]优选的，所述步骤S3中，包括采用机器学习方法进行模型训练。
[0022]优选的，所述步骤S4中，将科内分泌疾病患者样本的肠道微生物标本移植到实验受体中，采用口服接种，持续3
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4周，构建动物模型。
[0023]本专利技术提供的另一个技术方案为妇科内分泌疾病的预测系统或装置，其特征在
于，包括如下单元：
[0024](1)输入单元：所述输入单元用于将从受试者样本中获取得到的所述微生物标志物的丰度数据输入到处理单元中；
[0025](本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.妇科内分泌疾病相关微生物标志物的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：S1、微生物标本采集及处理，从研究样本的口腔和肠道中收集微生物标本，所述研究样本包括妇科内分泌疾病患者样本和健康者样本；S2、对微生物标本进行菌群信息分析，获得微生物菌群特征及微生物属普变化情况；S3、基于微生物属谱变化情况，筛选和鉴定与妇科内分泌疾病具有关联性的通用微生物组衍生特征；S4、构建动物模型，建立口腔
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肠道
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卵巢轴作用关系。2.根据权利要求1所述的筛选方法，其特征在于，所述妇科内分泌疾病包括多囊卵巢综合征、早发性卵巢功能不全、子宫内膜异位症、不孕、高雄激素血症、绝经、围绝经期综合征和绝经后骨质疏松。3.根据权利要求1所述的筛选方法，其特征在于，步骤S2中，所述菌群信息分析包括：S2.1检测口腔和肠道微生物菌群的功能丰度；S2.2分析口腔和肠道微生物菌群的多样性；S2.3分析妇科内分泌疾病患者样本的口腔和肠道微生物菌群的失调情况。4.根据权利要求3所述的筛选方法，其特征在于，所述步骤S2.1中，通过靶向测序分析、宏基因组测序分析、或qPCR(quantitative polymerase chain reaction)分析来检测口腔和肠道微生物菌群的功能丰度；其中，所述靶向测序分析是16s rDNA测序分析。5.根据权利要求3所述的筛选方法，其特征在于，所述步骤S2.2包括：分析与妇科内分泌疾病相关的口腔和肠道微生物群落结构，获得口腔和肠道中微生物标本的属水平的微生物...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈蓉，张鑫磊，黄奕轩，黄菲玲，周淼，
申请(专利权)人：北京携云启源科技有限公司，
类型：发明
国别省市：