微生物标志物在制备多囊卵巢综合征检测产品中的应用制造技术

本发明专利技术提供一种微生物标志物在制备多囊卵巢综合征检测产品中的应用，从研究样本的口腔、肠道中同时筛选得到与多囊卵巢综合征具有关联性的微生物，将其作为微生物标志物，所述微生物标志物包括10种微生物组合。本发明专利技术解决了现有技术中PCOS发病机制不清，基于临床检查本身的PCOS临床诊断的一套甚至多套判断规则较为复杂，缺少灵敏度和特异度均较高的用于制备PCOS检测产品中的微生物标志物的技术问题。备PCOS检测产品中的微生物标志物的技术问题。备PCOS检测产品中的微生物标志物的技术问题。

【技术实现步骤摘要】
微生物标志物在制备多囊卵巢综合征检测产品中的应用


[0001]本专利技术属于微生物检测领域，具体涉及微生物标志物在制备多囊卵巢综合征检测产品中的应用。

技术介绍

[0002]多囊卵巢综合征(PCOS)是常见的生殖内分泌代谢性疾病，临床表现包括月经稀发或闭经、不孕、多毛、痤疮、超重和肥胖等。PCOS患者生殖功能障碍与糖代谢异常并存，严重影响患者的月经、生育、生命质量及远期健康。因持续无排卵，可能发生子宫内膜不典型增生甚至子宫内膜癌。PCOS患者常超重或肥胖,常见慢性炎症反应及胰岛素抵抗，发生糖尿病、代谢综合征和心血管疾病的风险明显增加。PCOS非常常见，依据诊断标准的不同，大致影响5％
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10％的育龄期女性。但至今PCOS的发病机制尚不清楚，目前比较公认的观点是，PCOS是一种多因素作用的复杂性疾病。由于发病核心机制不清，严重影响对PCOS的有效诊治。
[0003]在人体内，肠道微生物是构成人体微生物组的重要组成部分，也被称为人体第二基因组。近年来多项研究表明，肠道菌群失调与糖尿病等多种胰岛素抵抗相关疾病有着密切联系。在2012年，Tremellen等(Tremellen K,Pearce K.Dysbiosis of Gut Microbiota(DOGMA)
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a novel theory for the development of Polycystic Ovarian Syndrome.Med Hypotheses.2012,1:104
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112.)提出一种关于PCOS发病机制的假设：认为肠道微生物的失衡，可以导致宿主免疫系统的活化，引发慢性炎症反应，并损害胰岛素受体功能，导致胰岛素抵抗状态的产生，由此产生的高胰岛素能够干扰卵泡发育，同时驱动卵巢的卵泡膜细胞产生过量的雄激素，从而产生PCOS的经典症状。因此对于PCOS患者的肠道微生物进行深入研究，揭示PCOS与肠道微生物的关系以及可能的发生机理，可能有助于进一步了解PCOS的发病机制，并对PCOS的治疗产生影响。
[0004]近年来多项科学研究表明，微生物组与PCOS间有着非常密切的联系。早期的研究技术基于qPCR、DEEG及扩增子等，主要是关注PCOS患者的肠道微生物基础构成。2017年Pedro JT等人(Torres PJ,Siakowska M,Banaszewska B,et al.Gut Microbial Diversity in Women with Polycystic Ovary Syndrome Correlates with Hyperandrogenism.JClin Endocrinol Metab.2018,103(1):1
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15.)基于扩增子技术，研究了PCOS患者和健康人群在肠道微生物物种多样性及构成上的差异，显示在PCOS人群中肠道微生物物种多样性显著降低，并与高雄激素水平负相关。同样在2017年，Liu R等人(Liu R,Zhang C,Shi Y,et al.Dysbiosis of Gut Microbiota Associated with Clinical Parameters in Polycystic Ovary Syndrome.Front Microbiol.2017,8:1
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12.)基于扩增子技术，研究了PCOS患者与体重正常人对照，并将PCOS患者分为肥胖和非肥胖进行对比，结果显示在PCOS患者中，拟杆菌、埃希氏菌/志贺氏菌和链球菌属的细菌显著上升，并与瘦素水平负相关，与睾酮和体重指数(BMI)呈正相关，同时观察到PCOS患者中AKK菌(Akkermansia muciniphila，肠道中一种可降解黏蛋白的细菌)和瘤胃球菌科显著下降。
[0005]现有技术这些研究基本从qPCR、DEEG及扩增子研究技术出发，分析PCOS人群和健康人群的肠道微生物基本构成的差异，尚缺乏从基因、功能、代谢产物等层面对PCOS人群肠道微生物进行的整体探讨。

技术实现思路

[0006]为此，本专利技术提供微生物标志物在制备多囊卵巢综合征检测产品中的应用。解决现有技术中PCOS发病机制不清，基于临床检查本身的PCOS临床诊断的一套甚至多套判断规则较为复杂，缺少灵敏度和特异度均较高的用于制备PCOS检测产品中的微生物标志物的技术问题。
[0007]本专利技术提供的一个技术方案为微生物标志物在制备多囊卵巢综合征检测产品中的应用，从研究样本的口腔、肠道中同时筛选得到与多囊卵巢综合征具有关联性的微生物，将其作为微生物标志物，所述微生物标志物包括以下10种微生物：嗜血杆菌(Haemophilus)、萨特氏菌(Sutterella)、月形单孢菌属(Selenomonas)、二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga)、奥利杆菌(Oribacterium)、臭杆菌(Odoribacter)、细小单胞菌(Parvimonas)、帕鲁丁杆菌(Paludibacter)、Anaerotruncus、SHD
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231。
[0008]进一步，还包括以下7种微生物：普雷沃氏菌属(Prevotella)、链球菌(Streptococcus)、梭杆菌(Fusobacterium)、密螺旋体属(Treponema)、毛螺菌属(Lachnobacterium)、柯林斯菌属(Collinsella)和梭菌属(Clostridium 3)。
[0009]优选的，所述产品为用于诊断多囊卵巢综合征的试剂、试剂盒、芯片、高通量测序平台、风险预测模型或风险评估系统。
[0010]其中，所述试剂能够检测出上述微生物菌群，具体包括能够检测出上述微生物菌群的丰度或含量，所述试剂包括引物、探针、抗体等。
[0011]进一步的，用于诊断妇科内分泌疾病的试剂盒、芯片、高通量测序平台包含所述试剂。
[0012]优选的，所述风险预测模型的输入变量为所述微生物标志物的丰度。
[0013]本专利技术提供的另一个技术方案为基于口腔
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肠道微生物标志物的多囊卵巢综合征风险预测模型的构建方法，包括如下步骤：
[0014]S1、微生物标本的收集与处理；
[0015]S2、微生物标本的检测及分析，筛选出微生物标志物，所述微生物标志物包括以下10种微生物：嗜血杆菌(Haemophilus)、萨特氏菌(Sutterella)、月形单孢菌属(Selenomonas)、二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga)、奥利杆菌(Oribacterium)、臭杆菌(Odoribacter)、细小单胞菌(Parvimonas)、帕鲁丁杆菌(Paludibacter)、Anaerotruncus、SHD
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231；
[0016]S3、机器学习方法进行模型训练；
[0017]构建得到多囊卵巢综合征风险预测模型。
[0018]优选的，还包括以下7种微生物：普雷沃氏菌属(Prevo本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.微生物标志物在制备多囊卵巢综合征检测产品中的应用，其特征在于，将研究样本的口腔、肠道中均与多囊卵巢综合征具有关联性的微生物作为微生物标志物，所述微生物标志物包括以下10种微生物：嗜血杆菌(Haemophilus)、萨特氏菌(Sutterella)、月形单孢菌属(Selenomonas)、二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga)、奥利杆菌(Oribacterium)、臭杆菌(Odoribacter)、细小单胞菌(Parvimonas)、帕鲁丁杆菌(Paludibacter)、Anaerotruncus、SHD
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231。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述微生物标志物还包括以下7种微生物：普雷沃氏菌属(Prevotella)、链球菌(Streptococcus)、梭杆菌(Fusobacterium)、密螺旋体属(Treponema)、毛螺菌属(Lachnobacterium)、柯林斯菌属(Collinsella)和梭菌属(Clostridium3)。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述产品为用于诊断多囊卵巢综合征的试剂、试剂盒、芯片、高通量测序平台、风险预测模型或风险评估系统。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述风险预测模型的输入变量为所述微生物标志物的丰度。5.基于口腔
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肠道微生物标志物的多囊卵巢综合征风险预测模型的构建方法，其特征在于，包括如下步骤：S1、微生物标本的收集与处理；S2、微生物标本的检测及分析，筛选出微生物标志物，所述微生物标志物包括以下10种微生物：嗜血杆菌(Haemophilus)、萨特氏菌(Sutterella)、月形单孢菌属(Selenomonas)、二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga)、奥利杆菌(Oribacterium)、臭杆菌(Odoribacter)、细小单胞菌(Parvimonas)、帕鲁丁杆菌(Paludibacter)、Anaerotruncus、SHD
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231；S3、机器学习方法进行模型训练；构建得到多囊卵巢综合征风险预测模型。6.根据权利要求5所述的构建方法，其特征在于，所述微生物标志物还包括以下7种微生物：普雷沃氏菌属(Prevotella)、链球菌(Streptococcus)、梭杆菌(Fus...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈蓉，黄菲玲，黄奕轩，张鑫磊，周淼，
申请(专利权)人：北京携云启源科技有限公司，
类型：发明
国别省市：