胞苷脱氨酶活性的生物标记物及其应用制造技术

技术编号:37985039 阅读:28 留言:0更新日期:2023-06-30 09:59
本发明专利技术公开了胞苷脱氨酶活性的生物标记物及其应用。将长非编码RNA(lncRNA)NEAT1和MALAT1在的表达水平以及在这两个lncRNA序列中个别APOBEC3B特异的RNA位点的编辑程度的测定实现对细胞和组织样本中APOBEC3B酶活性的评估。评估。

【技术实现步骤摘要】
胞苷脱氨酶活性的生物标记物及其应用


[0001]本专利技术属于生物医学领域,具体地,本专利技术涉及胞苷脱氨酶活性的生物标记物及其应用。

技术介绍

[0002]高度的异质性是肿瘤与其他恶性疾病的最大区别,也是其难以治愈的源头。大量的肿瘤基因组学研究显示,肿瘤能利用达尔文式的进化在细胞层面上完成选择、竞争和适应,从而实现肿瘤发生、微环境适应、浸润、转移以及耐药性的产生。
[0003]研究结果表明,由酶介导的核酸遗传物质突变是造成肿瘤基因组异质性的主要途径之一,而DNA/RNA脱氨酶APOBEC家族(Apolipoprotein B mRNA editing catalytic polypeptide

like)则是这一过程的作用酶。
[0004]APOBEC家族酶能作用于单链DNA中的脱氧胞苷,通过脱氨基反应将其转化为脱氧尿苷从而在DNA层面上产生包含C>T突变在内的多种突变。在肿瘤细胞中,异常激活的APOBEC家族酶推动了异质性的积累,并通过促进分支进化产生难以治愈的耐药性克隆。在临床研究中通过大本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种胞苷脱氨酶APOBEC3B酶活性标志物或其检测试剂的用途,其特征在于,用于制备一诊断试剂或试剂盒,所述诊断试剂或试剂盒用于检测胞苷脱氨酶APOBEC3B酶活性;其中,所述胞苷脱氨酶APOBEC3B酶活性标志物选自下组:lncRNA NEAT1、lncRNA MALAT1、或其组合。2.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述的检测试剂用于检测lncRNA NEAT1上的选自下组的RNA编辑位点(以GRCh38参考基因组坐标)是否发生C

U变化:chr11:65425652,chr11:65444937,chr11:65428056,chr11:65441080,chr11:65431271,chr11:65436573,chr11:65436866,chr11:65442018,chr11:65443866,或其组合;和/或,所述的检测试剂用于检测lncRNA MALAT1的选自下组的编辑位点(以GRCh38参考基因组坐标)是否发生C

U变化:chr11:65498061,chr11:65498321,chr11:65498990,chr11:65499884,chr11:65500618,chr11:65500772,chr11:65501742,chr11:65504613,或其组合。3.如权利要求1所述的用途,其特征在于,使用荧光定量PCR检测lncRNA NEAT1、lncRNA MALAT1、或其组合的表达水平,以检测胞苷脱氨酶APOBEC3B酶活性。4.如权利要求3所述的用途,其特征在于,使用所述荧光定量PCR检测时,至少使用一对特异性扩增lncRNA NEAT1和lncRNA MALAT1的引物,所述引物选自下组:NEAT1_1

F(SEQ ID NO:1):5'

GGCACAAGTTTCACAGGCCTACATGGG

3';NEAT1_1

R(SEQ ID NO:2):5'

GCCAGAGCTGTCCGCCCAGCGAAG

3';NEAT1_2

F(SEQ ID NO:3):5'

GGAGCCAACCTGCCCTGAAT

3';NEAT1_2

R(SEQ ID NO:4):5'

CCACAGGCTACCCTCTGCTC

3';MALAT1

F(SEQ ID NO:5):5'

CTTCCCTAGGGGATTTCAGG

3';MALAT1

R(SEQ ID NO:6):5'

GCCCACAGGAACAAGTCCTA

3'。5.一种用于检测胞苷脱氨酶APOBEC3B酶活性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:(i)胞苷脱氨酶APOBEC3B酶活性标志物的RNA或其检测试剂;其中,所述胞苷脱氨酶APOBEC3B酶活性标志物选自下组:lncRNA NEAT1、lncRNA MALAT1、或其组合;和任选的(ii)胞苷脱氨酶APOBEC3B酶、其促进剂、其抑制剂、或其组合。6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述的lncRNA NEAT1上的编辑位点选自下组(以GRCh38参考基因组坐标):chr11:65425652,chr11:65444937,chr11:65428056,chr11:65441080,chr11:65431271,chr11:65436573,chr11:65436866,chr11:...

【专利技术属性】
技术研发人员:张弛赵鑫王美牛延革
申请(专利权)人:上海生物制品研究所有限责任公司
类型:发明
国别省市:

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