本发明专利技术公开了一种新型分子标志物在乳腺癌诊断或预后评估中的应用。具体地公开了分子标志物lncRNA LIVAR和/或检测所述分子标志物的物质在乳腺癌诊断、辅助诊断、筛查、预后评估、风险评估中的应用，及其作为靶点在预防或治疗乳腺癌中的应用。LIVAR在乳腺癌患者中的表达水平显著上调，且LIVAR的高表达与较差的乳腺癌(包括三阴性乳腺癌)预后显著相关。实验表明，抑制LIVAR的表达可明显抑制乳腺癌细胞迁移和/或侵袭能力，并能显著抑制乳腺癌细胞的增殖。表明其可以作为乳腺癌治疗的靶点，抑制LIVAR表达的物质可以用于制备治疗乳腺癌的药物，检测LIVAR的物质可以用于乳腺癌的诊断或预后。或预后。
【技术实现步骤摘要】
一种新型分子标志物在乳腺癌诊断或预后评估中的应用
[0001]本专利技术属于生物技术和医学诊断领域，涉及一种新型分子标志物在乳腺癌诊断或预后评估中的应用，具体涉及一种与乳腺癌相关的长非编码RNA之筛选方法及其用途。
技术介绍
[0002]全基因组转录组研究表明蛋白质编码区仅占人类基因组序列的2％，90％以上的序列被转录成不控制蛋白质合成的非编码RNA(ncRNA)。长非编码RNA(lncRNAs)是一类长度超过200个核苷酸的转录物，其特点是类型多、作用模式多和数量多，具有空间和时间特异性，可在多种层面调节基因的表达，参与多种生物学过程，如增殖、凋亡、转移、代谢和耐药性等。越来越多的证据显示，lncRNA表达量的异常及其遗传多态性与肿瘤的发生、发展密切相关，因此lncRNA有望成为新型肿瘤诊断标志物和治疗靶点，用于肿瘤诊断、治疗和复发的监测等。
[0003]根据全球癌症统计报告(Global Cancer Observatory)所公布2020年的数据中，乳腺癌已成为发病率最高的癌症类型。国家癌症中心2022年2月发布的全国癌症报告显示乳腺癌居我国癌症发病的第四位，更是女性癌症发病的首位，年发病率亦稳步上升。根据雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、人表皮生长因子受体2(HER2)和KI67的表达情况，可将乳腺癌患者分为4种亚型：管腔细胞A(Luminal A)、管腔细胞B(Luminal B)、HER2阳性和三阴性乳腺癌(TNBC)。其中三阴性乳腺癌(ER、PR及HER2均阴性)缺乏激素受体，在乳腺癌病例中约占15％，对靶向治疗和内分泌治疗不敏感。70％以上的三阴性乳腺癌患者在手术后3年内出现复发，导致预后不佳。鉴于此，寻找和鉴定敏感、特异的新型乳腺癌分子标志物及其检测方法来诊断或辅助诊断乳腺癌，对于指导临床治疗与判断预后具有重要的意义，有着广泛的应用前景。
技术实现思路
[0004]本专利技术的目的是提供一种可用于乳腺癌预后评估、诊断、辅助诊断、筛查、风险评估和/或术后复发或转移风险评估的分子标志物，和/或，提供一种乳腺癌治疗靶点。所要解决的技术问题不限于所描述的技术主题，本领域技术人员通过以下描述可以清楚地理解本文未提及的其它技术主题。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术首先提供了分子标志物和/或检测所述分子标志物的物质的下述任一种应用：
[0006]A1)在乳腺癌诊断或制备用于乳腺癌诊断的产品中的应用；
[0007]A2)在乳腺癌辅助诊断或制备用于乳腺癌辅助诊断的产品中的应用；
[0008]A3)在乳腺癌筛查或制备用于乳腺癌筛查的产品中的应用；
[0009]A4)在乳腺癌预后评估或制备用于乳腺癌预后评估的产品中的应用；
[0010]A5)在评估乳腺癌风险或制备用于评估乳腺癌风险的产品中的应用；
[0011]A6)在评估乳腺癌术后复发或转移风险或制备用于评估乳腺癌术后复发或转移风
险的产品中的应用；
[0012]A7)在预防或治疗乳腺癌或制备预防或治疗乳腺癌的药物中的应用；
[0013]A8)在预防或治疗三阴性乳腺癌或制备预防或治疗三阴性乳腺癌的药物中的应用；
[0014]A9)在抑制乳腺癌细胞增殖或制备抑制乳腺癌细胞增殖的试剂或药物中的应用；
[0015]A10)在抑制乳腺癌细胞迁移、转移、扩散和/或侵袭或制备抑制乳腺癌细胞迁移、转移、扩散和/或侵袭的试剂或药物中的应用；
[0016]所述分子标志物可为lncRNA(长非编码RNA)，名称可为LIVAR(liver cell viabilityassociated lncRNA)，所述lncRNA LIVAR可为下述任一种：
[0017]B1)核苷酸序列是SEQ ID No.1的RNA；
[0018]B2)来源于人且与B1)具有80％以上的同一性的多核苷酸；
[0019]优选地，所述乳腺癌可为三阴性乳腺癌。
[0020]进一步地，所述lncRNA LIVAR在乳腺癌患者中的表达水平显著上调，且LIVAR的高表达与较差的乳腺癌预后显著相关。所述lncRNA LIVAR可以作为分子标志物用于乳腺癌的诊断、辅助诊断、筛查、预后评估、风险评估或术后复发或转移风险评估等分子诊断领域。
[0021]进一步地，编码lncRNA LIVAR的基因为LIVAR基因，所述LIVAR基因的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。
[0022]进一步地，所述lncRNA LIVAR可为人源的。
[0023]本文中，同一性是指核苷酸序列的同一性。可使用国际互联网上的同源性检索站点测定核苷酸序列的同一性，如NCBI主页网站的BLAST网页。例如，可在高级BLAST2.1中，通过使用blastp作为程序，将Expect值设置为10，将所有Filter设置为OFF，使用BLOSUM62作为Matrix，将Gap existence cost，Per residue gap cost和Lambda ratio分别设置为11，1和0.85(缺省值)并进行检索以对核苷酸序列的同一性进行计算，然后即可获得同一性的值(％)。
[0024]本文中，所述80％以上的同一性可为至少80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％的同一性。
[0025]上述应用中，所述检测所述分子标志物的物质可包括通过逆转录
‑
聚合酶链反应、实时荧光定量PCR技术、转录组测序技术、Northern blot、原位杂交技术、基因芯片技术、Nanopore测序技术或PacBio测序技术检测所述分子标志物的试剂和/或仪器。
[0026]上述应用中，所述检测所述分子标志物的物质可为检测所述lncRNA LIVAR表达水平的试剂和/或仪器。
[0027]进一步地，所述检测所述lncRNA LIVAR表达水平的试剂包括特异性识别lncRNALIVAR的探针，和/或，特异性扩增lncRNA LIVAR的引物。
[0028]进一步地，所述检测所述lncRNA LIVAR表达水平的试剂包括特异性识别LIVAR基因的探针，和/或，特异性扩增LIVAR基因的引物。
[0029]所述探针可为DNA探针、RNA探针、cDNA探针、cRNA探针或寡核苷酸探针。
[0030]本专利技术还提供了用于乳腺癌诊断、辅助诊断、筛查、预后评估、风险评估或术后复发或转移风险评估的试剂盒，所述试剂盒可包括本文中任一所述检测所述分子标志物的物
质。
[0031]进一步地，所述试剂盒的检测样本可为血液样本(如全血、血浆、血清)、组织样本、唾液样本、痰液样本、体液样本等但不限于此。
[0032]所述试剂盒的各种试剂组分可以存在于分开的容器中，或者可以全部或部分预组合成试剂混合物。
[0033]本专利技术还提供了抑制所述分子标本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.分子标志物和/或检测所述分子标志物的物质的下述任一种应用：A1)在乳腺癌诊断或制备用于乳腺癌诊断的产品中的应用；A2)在乳腺癌辅助诊断或制备用于乳腺癌辅助诊断的产品中的应用；A3)在乳腺癌筛查或制备用于乳腺癌筛查的产品中的应用；A4)在乳腺癌预后评估或制备用于乳腺癌预后评估的产品中的应用；A5)在评估乳腺癌风险或制备用于评估乳腺癌风险的产品中的应用；A6)在评估乳腺癌术后复发或转移风险或制备用于评估乳腺癌术后复发或转移风险的产品中的应用；A7)在预防或治疗乳腺癌或制备预防或治疗乳腺癌的药物中的应用；A8)在预防或治疗三阴性乳腺癌或制备预防或治疗三阴性乳腺癌的药物中的应用；A9)在抑制乳腺癌细胞增殖或制备抑制乳腺癌细胞增殖的试剂或药物中的应用；A10)在抑制乳腺癌细胞迁移、转移、扩散和/或侵袭或制备抑制乳腺癌细胞迁移、转移、扩散和/或侵袭的试剂或药物中的应用；所述分子标志物为lncRNA，所述lncRNA为下述任一种：B1)核苷酸序列是SEQ ID No.1的RNA；B2)来源于人且与B1)具有80％以上的同一性的多核苷酸；优选地，所述乳腺癌为三阴性乳腺癌。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测所述分子标志物的物质包括通过逆转录
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聚合酶链反应、实时荧光定量PCR技术、转录组测序技术、Northern blot、原位杂交技术、基因芯片技术、Nanopore测序技术或PacBio测序技术检测所述分子标志物的试剂和/或仪器。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述检测所述分子标志物的物质为检测权利要求1中所述lncRNA表达水平的试剂和/或仪器。4.用于乳腺癌诊断、辅助诊断、筛查、预后评估、风险评估或术后复发或转移风险评估的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求1
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3中任一所述检测所述分子标志物的物质。5.抑制权利要求1中所述分子标志物表...
【专利技术属性】
技术研发人员：许乃寒，彭期安，张昊伟，张雅鸥，谢伟东，
申请(专利权)人：清华大学深圳国际研究生院，
类型：发明
国别省市：
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