巴音布鲁克羊的育种方法及所用巴音布鲁克羊毛色性状的Indel分子标记技术

本发明专利技术公开了巴音布鲁克羊的育种方法及所用巴音布鲁克羊毛色性状的Indel分子标记，涉及分子标记技术领域。本发明专利技术具体公开了巴音布鲁克羊育种的方法，所述方法包括选择基因型为II的黑头巴音布鲁克羊作为亲本进行育种，所述II是巴音布鲁克羊基因组DNA中含有核苷酸序列是SEQ ID No.1的DNA片段的纯合型。该方法可以可以快速鉴定出突变纯合子和杂合子的黑头巴音布鲁克羊，在育种过程中，剔除杂合子，可加快毛色一致，遗传稳定的巴音布鲁克羊育种进程。程。

【技术实现步骤摘要】
巴音布鲁克羊的育种方法及所用巴音布鲁克羊毛色性状的Indel分子标记


[0001]本专利技术涉及分子标记
，具体地涉及一种巴音布鲁克羊的育种方法及所用巴音布鲁克羊毛色性状的Indel分子标记。

技术介绍

[0002]巴音布鲁克羊，俗称茶腾大尾羊、巴音布鲁克大尾羊、巴音布鲁克黑头羊。主要分布于巴州的和静县、和硕县、焉耆县、博湖县、轮台县和库尔勒市等。巴音布鲁克羊头颈部毛色以黑色居多，头颈部为黄色的个体较少，体躯为白色。由于无序杂交等工作的影响，巴音布鲁克羊出现了一定的退化，基于此，针对巴音布鲁克羊开展了提纯复壮的工作，需要选育毛色一致的群体，常规育种手段选育并固定一种绵羊毛色需设计专门的育种方案，并经历几个世代的选育才能固定，育种周期长，技术难度大。针对毛色性状的分子标记位点实施标记辅助选择，能够有效提高育种效率，选育出毛色一致、稳定遗传的巴音布鲁克羊群体。全基因组关联分析已经成为鉴定与绵羊毛色性状相关的分子标记最有效技术手段之一(James et al,2013,Li et al.,2014,Gebreselassie et al.,2020)，Indel(insertion/deletion)分子标记是在全基因组重测序的基础上开发的，是等位基因位点上插入或缺失一段短序列产生的多态性变异。基于全基因组重测序的Indel标记，具有在基因组内分布广、密度高、多态性强、检测容易、分型系统简单、遗传稳定的优点。目前已应用于动植物群体遗传分析和分子标记辅助育种等。

技术实现思路

[0003]本专利技术所要解决的技术问题是如何快速鉴定巴音布鲁克羊毛色进而加快巴音布鲁克羊选择育种进程。
[0004]为解决上述技术问题，本专利技术首先提供了一种巴音布鲁克羊育种的方法，所述方法包括选择基因型为II的黑头巴音布鲁克羊作为亲本进行育种，所述II是巴音布鲁克羊基因组DNA中含有核苷酸序列是SEQ ID No.1的DNA片段的纯合型。
[0005]SEQ ID No.1序列信息如下：
[0006]5`
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[0007]本专利技术还提供了一种Indel分子标记或检测所述Indel分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定巴音布鲁克羊毛色性状中的应用，所述Indel分子标记是SEQ ID No.2的第231位T和第232位G之间是否插入一个胸腺嘧啶脱氧核苷酸。
[0008]SEQ ID No.2序列信息如下：
[0009]5`
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[0010]本专利技术还提供了检测巴音布鲁克羊基因组中SEQ ID No.2的第231位和第232位之间是否插入一个胸腺嘧啶脱氧核苷酸的物质在鉴定或辅助鉴定巴音布鲁克羊毛色性状中的应用。
[0011]前文所述物质含有扩增包含所述巴音布鲁克羊毛色相关性状Indel分子标记在内的巴音布鲁克羊基因组DNA片段的PCR引物。
[0012]前文所述PCR引物为引物对，所述引物对由正向引物和反向引物组成，所述正向引物为与巴音布鲁克羊基因组DNA中SEQ ID No.1所示双链DNA的第32位的上游特异结合的单链DNA，所述反向引物为与巴音布鲁克羊基因组DNA中SEQ ID No.1所示双链DNA的第305位的下游特异结合的单链DNA。
[0013]具体而言，所述正向引物是核苷酸序列为SEQ ID No.3的单链DNA，所述反向引物是核苷酸序列为SEQ ID No.4的单链DNA。
[0014]本专利技术还提供了一种鉴定或辅助鉴定巴音布鲁克羊毛色相关性状的方法，所述方法包括以下步骤：
[0015](1)以待鉴定巴音布鲁克羊基因组DNA为模板，利用前述的任一所述PCR引物进行PCR扩增，得到PCR产物；
[0016](2)根据所述PCR产物含有前述的Indel分子标记的类型来鉴定巴音布鲁克羊的毛色性状。
[0017]所述毛色性状可为头部毛色。
[0018]上述方法中，所述Indel分子标记的类型可为插入纯合型(II)、野生型(DD)或杂合型(ID)，所述插入纯合型是指待鉴定巴音布鲁克羊基因组DNA中含有核苷酸序列是SEQ ID No.1的DNA片段的纯合型，野生型(DD)是指待鉴定巴音布鲁克羊基因组DNA中含有核苷酸序列是SEQ ID No.2的DNA片段的纯合型，所述杂合型(ID)是指待鉴定巴音布鲁克羊基因组DNA中含有核苷酸序列是SEQ ID No.1的DNA片段和核苷酸序列是SEQ ID No.2的DNA片段的杂合型。
[0019]上述方法中，所述鉴定巴音布鲁克羊的毛色相关性状可为所述InDel分子标记的类型为插入纯合型(II)的待鉴定巴音布鲁克羊的头颈部毛色为黑色，所述InDel分子标记的类型为杂合型(ID)的待鉴定巴音布鲁克羊的头颈部毛色为黑色，所述InDel分子标记的类型为野生型(DD)的待鉴定巴音布鲁克羊的头颈部毛色为黄色。
[0020]本专利技术还提供了一种检测Indel分子标记的物质在巴音布鲁克羊育种中的应用，所述Indel分子标记是SEQ ID No.2的第231位和第232位之间是否插入胸腺嘧啶脱氧核苷酸。
[0021]此外，本专利技术还提供了一种核苷酸序列为SEQ ID No.2的DNA和/或核苷酸序列为SEQ ID No本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.巴音布鲁克羊育种的方法，其特征在于，所述方法包括选择基因型为II的黑头巴音布鲁克羊作为亲本进行育种，所述II是巴音布鲁克羊基因组DNA中含有核苷酸序列是SEQ ID No.1的DNA片段的纯合型。2.Indel分子标记或检测所述Indel分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定巴音布鲁克羊毛色性状中的应用，所述Indel分子标记是SEQ ID No.2的第231位T和第232位G之间是否插入一个胸腺嘧啶脱氧核苷酸。3.检测巴音布鲁克羊基因组中SEQ ID No.2的第231位和第232位之间是否插入一个胸腺嘧啶脱氧核苷酸的物质在鉴定或辅助鉴定巴音布鲁克羊毛色性状中的应用。4.根据权利要求1
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3中任一所述的应用，其特征在于，所述物质含有扩增包含所述巴音布鲁克羊毛色相关性状Indel分子标记在内的巴音布鲁克羊基因组DNA片段的PCR引物。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述PCR引物为引物对，所述引物对由正向引物和反向引物组成，所述正向引物为与巴音布鲁克羊基因组DNA中SEQ ID No.1所示双链DNA的第32位的上游特异结合的单链DNA，...

【专利技术属性】
技术研发人员：张俐华，贺三刚，李文蓉，刘明军，李海英，梁龙，倪文浩，于丽娟，狄江，
申请(专利权)人：新疆畜牧科学院生物技术研究所新疆畜牧科学院中国澳大利亚绵羊育种研究中心，
类型：发明
国别省市：