【技术实现步骤摘要】
人小脑蛋白配体和包含其的双官能化合物
[0001]本申请是申请日为2018年1月31日、申请号为201880022865.4、专利技术名称为“人小脑蛋白配体和包含其的双官能化合物”的中国专利技术专利申请的分案申请。
[0002]相关申请的交叉引用
[0003]本公开要求2017年1月31日提交的美国临时申请号62/452,972的优先权,该临时申请以引用方式整体并入本文。
[0004]以引用方式并入
[0005]作为美国专利申请公布号2017/0065719公布的2016年8月5日提交的美国专利申请序列号15/230,354;2017年11月1日提交的美国专利申请序列号15/801,243;2016年7月11日提交的美国专利申请15/206,497;2016年7月13日提交的美国专利申请15/209,648;2017年10月11日提交的美国专利申请序列号15/730,728;2017年12月1日提交的美国专利申请序列号15/829,541;2018年1月26日提交的美国专利申请序列号15/881,318;作为美国专利申请公布号2015/0291562公布的2015年4月14日提交的美国专利申请序列号14/686,640;作为美国专利申请公布号2016/0058872公布的2015年7月6日提交的美国专利申请序列号14/792,414;作为美国专利申请公布号2014/0356322公布的2014年7月11日提交的美国专利申请序列号14/371,956;以及作为美国专利申请公布号2016/0272639公布的2016年3月
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种人小脑蛋白E3泛素连接酶结合化合物,所述化合物具有选自以下的化学结构:
其中:W独立地选自CH2、CHR、C=O、SO2、NH和N
‑
烷基;Q1、Q2、Q3、Q4、Q5各自独立地表示被独立地选自R
’
、N或N
‑
氧化物的基团取代的碳C或N;R1选自不存在、H、OH、CN、C1
‑
C3烷基、C=O;R2选自下组:不存在、H、OH、CN、C1
‑
C3烷基、CHF2、CF3、CHO、C(=O)NH2;R3选自不存在、H、烷基(例如,C1
‑
C6或C1
‑
C3烷基)、取代的烷基(例如,取代的C1
‑
C6或C1
‑
C3烷基)、烷氧基(例如,C1
‑
C6或C1
‑
C3烷氧基)、取代的烷氧基(例如,取代的C1
‑
C6或C1
‑
C3烷氧基);R4选自H、烷基、取代的烷基;R5和R6各自独立地是H、卤素、C(=O)R
’
、CN、OH、CF3;X是C、CH、C=O或N;X1是C=O、N、CH或CH2;R
’
选自H、卤素、胺、烷基(例如,C1
‑
C3烷基)、取代的烷基(例如,取代的C1
‑
C3烷基)、烷氧基(例如,C1
‑
C3烷氧基)、取代的烷氧基(例如,取代的C1
‑
C3烷氧基)、NR2R3、C(=O)OR2、任选被取代的苯基;n是0
‑
4;并且是单键或双键。2.一种具有以下化学结构的双官能化合物:CLM―L―PTM,或者其药学上可接受的盐、对映体、立体异构体、溶剂化物、多晶型物或前药,其中:所述PTM是包含蛋白质靶向部分的小分子;所述L是共价连接所述CLM和所述PTM的键或化学连接部分;并且所述CLM是小分子人小脑蛋白E3泛素连接酶结合部分,其结合或靶向人小脑蛋白E3泛素连接酶并且具有选自由以下各项组成的组的化学结构:
其中:W独立地选自CH2、CHR、C=O、SO2、NH和N
‑
烷基;Q1、Q2、Q3、Q4、Q5各自独立地表示被独立地选自R
’
、N或N
‑
氧化物的基团取代的碳C或N;R1选自不存在、H、OH、CN、C1
‑
C3烷基、C=O;R2选自下组:不存在、H、OH、CN、C1
‑
3烷基、CHF2、CF3、CHO、C(=O)NH2;R3选自不存在、H、烷基(例如,C1
‑
C6或C1
‑
C3烷基)、取代的烷基(例如,取代的C1
‑
C6或C1
‑
C3烷基)、烷氧基(例如,C1
‑
C6或C1
‑
C3烷氧基)、取代的烷氧基(例如,取代的C1
‑
C6或C1
‑
C3烷氧基);R4选自H、烷基、取代的烷基;R5和R6各自独立地是H、卤素、C(=O)R
’
、CN、OH、CF3;X是C、CH、C=O或N;X1是C=O、N、CH或CH2;R
’
选自H、卤素、胺、烷基(例如,C1
‑
C3烷基)、取代的烷基(例如,取代的C1
‑
C3烷基)、烷氧基(例如,C1
‑
C3烷氧基)、取代的烷氧基(例如,取代的C1
‑
C3烷氧基)、NR2R3、C(=O)OR2、任选被取代的苯基;n是0
‑
4;并且是单键或双键。3.如权利要求2所述的双官能化合物,其中所述CLM经由W、X、R1、R2、R3、R4、R
’
、Q1、Q2、Q3、Q4和Q5连接至所述PTM、化学接头基团(L)或它们的组合。4.如权利要求2或3所述的双官能化合物,其中所述PTM是结合Brd4、Tau蛋白、雌激素受体(ER)或雄激素受体(AR)的部分。5.如权利要求2至4中任一项所述的双官能化合物,其中所述化合物还包含通过接头基团连接的第二E3泛素连接酶结合部分。6.如权利要求5所述的双官能化合物,其中所述第二E3泛素连接酶结合部分结合或靶向选自由希佩尔
‑
林道蛋白(VLM)、人小脑蛋白(CLM)、小鼠双微体同源物2(MLM)和凋亡抑制蛋白(ILM)组成的组的E3泛素连接酶。7.如权利要求2至6中任一项所述的双官能化合物,其中所述CLM由选自由以下各项组成的组的化学结构表示:
其中Rn包含官能团或原子。8.如权利要求2至7中任一项所述的双官能化合物,其中所述CLM由选自以下的化学结构表示:
9.如权利要求2至8中任一项所述的化合物,其中接头(L)包含由下式表示的化学结构单元:
‑
(A
L
)q
‑
其中:(A
L
)
q
是连接至所述CLM、所述PTM或它们的组合中的至少一者的基团;q是大于或等于1的整数;每个A
L
独立地选自由以下各项组成的组:键、CR
L1
R
L2
、O、S、SO、SO2、NR
L3
、SO2NR
L3
、SONR
L3
、CONR
L3
、NR
L3
CONR
L4
、NR
L3
SO2NR
L4
、CO、CR
L1
=CR
L2
、C≡C、SiR
L1
R
L2
、P(O)R
L1
、P(O)OR
L1
、NR
L3
C(=NCN)NR
L4
、NR
L3
C(=NCN)、NR
L3
C(=CNO2)NR
L4
、任选地被0
‑
6个R
L1
和/或R
L2
基团取代的C3‑
11
环烷
基、任选地被0
‑
6个R
L1
和/或R
L2
基团取代的C3‑
11
杂环基、任选地被0
‑
6个R
L1
和/或R
L2
基团取代的芳基、任选地被0
‑
6个R
L1
和/或R
L2
基团取代的杂芳基,其中R
L1
或R
L2
各自独立地任选与其他基团连接,以形成任选地被0
‑
4个R
L5
基团取代的环烷基和/或杂环基部分;并且R
L1
、R
L2
、R
L3
、R
L4
和R
L5
各自独立地是H、卤素、C1‑8烷基、OC1‑8烷基、SC1‑8烷基、NHC1‑8烷基、N(C1‑8烷基)2、C3‑
11
环烷基、芳基、杂芳基、C3‑
11
杂环基、OC1‑8环烷基、SC1‑8环烷基、NHC1‑8环烷基、N(C1‑8环烷基)2、N(C1‑8环烷基)(C1‑8烷基)、OH、NH2、SH、SO2C1‑8烷基、P(O)(OC1‑8烷基)(C1‑8烷基)、P(O)(OC1‑8烷基)2、CC
‑
C1‑8烷基、CCH、CH=CH(C1‑8烷基)、C(C1‑8烷基)=CH(C1‑8烷基)、C(C1‑8烷基)=C(C1‑8烷基)2、Si(OH)3、Si(C1‑8烷基)3、Si(OH)(C1‑8烷基)2、COC1‑8烷基、CO2H、卤素、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1‑8烷基、SO2N(C1‑8烷基)2、SONHC1‑8烷基、SON(C1‑8烷基)2、CONHC1‑8烷基、CON(C1‑8烷基)2、N(C1‑8烷基)CONH(C1‑8烷基)、N(C1‑8烷基)CON(C1‑8烷基)2、NHCONH(C1‑8烷基)、NHCON(C1‑8烷基)2、NHCONH2、N(C1‑8烷基)SO2NH(C1‑8烷基)、N(C1‑8烷基)SO2N(C1‑8烷基)2、NH SO2NH(C1‑8烷基)、NH SO2N(C1‑8烷基)2、NH SO2NH2。10.如权利要求2至9中任一项所述的双官能化合物,其中L选自由以下各项组成的组:
‑
N(R)
‑
(CH2)
m
‑
O(CH2)
n
‑
O(CH2)
o
‑
O(CH2)
p
‑
O(CH2)
q
‑
O(CH2)
r
‑
OCH2
‑
,
‑
O
‑
(CH2)
m
‑
O(CH2)
n
‑
O(CH2)
o
‑
O(CH2)
p
‑
O(CH2)
q
‑
O(CH2)
r
‑
OCH2
‑
,
‑
O
‑
(CH2)
m
‑
O(CH2)
n
‑
O(CH2)
o
‑
O(CH2)
p
‑
O(CH2)
q
‑
O(CH2)
r
‑
O
‑
;
‑
N(R)
‑
(CH2)
m
‑
O(CH2)
n
‑
O(CH2)
o
‑
O(CH2)
p
‑
O(CH2)
q
‑
O(CH2)
r
‑
O
‑
;
‑
(CH2)
m
‑
O(CH2)
n
‑
O(CH2)
o
‑
O(CH2)
p
‑
O(CH2)
q
‑
O(CH2)
r
‑
O
‑
;(CH2)
m
‑
O(CH2)
n
‑
O(CH2)
o
‑
O(CH2)
p
‑
O(CH2)
q
‑
O(CH2)
r
‑
OCH2
‑
;
其中接头的m、n、o、p、q和r独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20;当数为零时,不存在N
‑
O或O
‑
O键所述接头的R是H、甲基和乙基;所述接头的X是H和F
其中接头的m可以是2、3、4、5
其中接头的每个n和m可以独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20。11.如权利要求2至9中任一项所述的双官能化合物,其中L选自由以下各项组成的组:
其中每个m和n独立地选自0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20。12.如权利要求2至9中任一项所述的双官能化合物,其中接头(L)选自由以下各项组成的组:
其中每个m、n、o、p、q和r独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、
18、19或20。13.如权利要求2至9中任一项所述的双官能化合物,其中接头(L)选自由以下各项组成的组:
14.如权利要求2至9中任一项所述的双官能化合物,其中接头(L)选自:
其中:上述结构中的“X”可以是具有2至14个原子的直链,并且所述链可含有杂原子,例如氧;并且上述结构中的“Y”可以是O、N、S(O)
n
(n=0、1、2)。15.如权利要求2至8中任一项所述的双官能化合物,其中接头(L)包含选自以下的结
构:其中:W
L1
和W
L2
各自独立地是具有0
‑
4个杂原子的4
‑
8元环,任选地被R
Q
取代,每个R
Q
独立地是H、卤素、OH、CN、CF3、C1‑
C6烷基(直链、支链,任选地被取代)、C1‑
C6烷氧基(直链、支链,任选地被取代),或者2个R
Q
基团与它们所附接的原子一起,形成含有0
‑
4个杂原子的4
‑
8元环系统;Y
L1
各自独立地是键、C1‑
C6烷基(直链、支链,任选地被取代)并且任选地一个或多个C原子替换为O;或C1‑
C6烷氧基(直链、支链,任选地被取代);n是0
‑
10;并且虚线指示与所述PTM或CLM部分的附接点。16.如权利要求2至8中任一项所述的双官能化合物,其中接头包含选自以下的结构:其中:W
L1
和W
L2
各自独立地是芳基、杂芳基、环基、杂环基、C1‑6烷基、双环、双芳基、双杂芳基或双杂环基,各自任选地被R
Q
取代,每个R
Q
独立地是H、卤素、OH、CN、CF3、羟基、硝基、C≡CH、C2‑6烯基、C2‑6炔基、C1‑
C6烷基(直链、支链,任选地被取代)、C1‑
C6烷氧基(直链、支链,任选地被取代)、OC1‑3烷基(任选被1个或多个
‑
F取代)、OH、NH2、NR
Y1
R
Y2
、CN,或者2个R
Q
基团与它们所附接的原子一起,形成含有0
‑
4个杂原子的4
‑
8元环系统;Y
L1
各自独立地是键、NR
YL1
、O、S、NR
YL2
、CR
YL1
R
YL2
、C=O、C=S、SO、SO2、C1‑
C6烷基(直链、支链,任选地被取代)并且任选地一个或多个C原子替换为O;C1‑
C6烷氧基(直链、支链,任选地被取代);Q
L
是具有0
‑
4个杂原子的3
‑
6元脂环或芳环,任选地桥连,任选地被0
‑
6个R
Q
取代,每个R
Q
独立地是H、C1‑6烷基(直链、支链,任选地被1个或多个卤素、C1‑6烷氧基取代),或者2个R
Q
基团与它们所附接的原子一起,形成含有0
‑
2个杂原子的3
‑
8元环系统);
R
YL1
、R
YL2
各自独立地是H、OH、C1‑6烷基(直链、支链,任选地被1个或多个卤素、C1‑6烷氧基取代),或者R1、R2与它们所附接的原子一起,形成含有0
‑
2个杂原子的3
‑
8元环系统);n是0
‑
10;并且虚线指示与所述PTM或CLM部分的附接点。17.如权利要求2至9中任一项所述的双官能化合物,其中接头(L)是包含1至10个乙二醇单元的任选地被芳基或苯基取代的聚乙烯氧基基团。18.如权利要求2至17中任一项所述的双官能化合物,其中所述PTM具有包含(A)、(B)、(C)、(D)、(E)或它们的组合中的至少一者的化学结构:(A)包含PTM
‑
I或PTM
‑
II的雌激素受体结合部分(EBM):其中:X
PTM
是O或C=O;X
PTM1
和X
PTM2
中的每一者独立地选自N或CH;R
PTM1
独立地选自OH、O(CO)R
PTM
、O
‑
低级烷基,其中R
PTM
是酯中的烷基或芳基;R
PTM2
和R
PTM4
独立地选自H、OH、卤素、CN、CF3、SO2‑
烷基、O
‑
低级烷基;R
PTM3
和R
PTM5
独立地选自H、卤素;PTM
‑
I在每个相应环上具有至少一个R
PTM2
和至少一个R
PTM3
;并且指示接头、所述CLM、CLM
’
或它们的组合中的至少一者的附接位点;(B)由以下化学结构表示的雌激素受体蛋白质靶向部分:
式(II
PTM
)其中:每个X
PTM
独立地是CH、N;指示接头、所述CLM、CLM
’
或它们的组合中的至少一者的附接位点;每个R
PTM1
独立地是OH、卤素、烷氧基、甲氧基、乙氧基、O(CO)R
PTM
,其中取代可以是单取代、二取代或三取代,并且所述R
PTM
是具有1至6个碳的烷基或环烷基或者芳基;每个R
PTM2
独立地是H、卤素、CN、CF3、直链或支链烷基、烷氧基、甲氧基、乙氧基,其中取代可以是单取代或二取代;每个R
PTM3
独立地是H、卤素,其中取代可以是单取代或二取代;并且R
PTM4
是H、烷基、甲基、乙基;(C)雄激素受体(AR)结合部分(ABM)包含选自由以下各项组成的组的结构:
其中:W1是芳基、杂芳基、双环或双杂环,各自独立地被1个或多个H、卤基、羟基、硝基、CN、C≡CH、C1‑6烷基(直链、支链,任选地被取代;例如任选地被1个或多个卤基、C1‑6烷氧基取代)、C1‑6烷氧基(直链、支链,任选地被取代;例如任选地被1个或多个卤基取代)、C2‑6烯基、C2‑6炔基或CF3取代;Y1、Y2各自独立地是NR
Y1
、O、S、SO2、杂芳基或芳基;Y3、Y4、Y5各自独立地是键、O、NR
Y2
、CR
Y1
R
Y2
、C=O、C=S、SO、SO2、杂芳基或芳基;Q是具有0
‑
4个杂原子的3
‑
6元环,其任选地被0
‑
6个R
Q
取代,每个R
Q
独立地是H、C1‑6烷基(直链、支链,任选地被取代;例如任选地被1个或多个卤基、C1‑6烷氧基取代)、卤素、C1‑6烷氧基,或者2个R
Q
基团与它们所附接的原子一起,形成含有0
‑
2个杂原子的3
‑
8元环系统);R1、R2、R
a
、R
b
、R
Y1
、R
Y2
各自独立地是H、C1‑6烷基(直链、支链,任选地被取代;例如任选地被1个或多个卤基、C1‑6烷氧基取代)、卤素、C1‑6烷氧基、环、杂环,或者R1、R2与它们所附接的原子一起,形成含有0
‑
2个杂原子的3
‑
8元环系统);W2是键、C1‑6烷基、C1‑6杂烷基、O、芳基、杂芳基、脂环、杂环、双杂环、联芳基或双杂芳基,各自任选地被1
‑
10个R
W2
取代;每个R
W2
独立地是H、卤基、C1‑6烷基(直链或支链,任选地被取代;例如任选地被1个或多个F取代)、
‑
OR
W2A
、C3‑6环烷基、C4‑6环杂烷基、C1‑6烷基(任选地被取代)、杂环(任选地被取代)、芳基(任选地被取代)或杂芳基(任选地被取代)、双环杂芳基或芳基、OC1‑3烷基(任选地被取代;例如任选地被1个或多个
‑
F取代)、OH、NH2、NR
Y1
R
Y2
、CN;R
W2A
是H、C1‑6烷基(直链、支链)或C1‑6杂烷基(直链、支链),各自任选地被环烷基、环杂烷基、芳基、杂环、杂芳基、卤基或OC1‑3烷基取代;并且虚线指示接头、所述CLM、CLM
’
或它们的组合中的至少一者的附接位点;(D)由式I
‑
XI中的至少一个表示的Tau蛋白靶向部分:
其中:A、B、C、D、E和F独立地选自任选地被取代的5或6元芳基或杂芳基环、任选地被取代的4至7元环烷基或杂环烷基,其中圆圈之间的接触指示环稠合;L
PTM
选自任选被一个或多个环(即,环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基)中断的键、烷基、烯基或炔基,或者一个或多个官能团,所述官能团选自下组:
‑
O
‑
、
‑
S
‑
、
‑
NR
1PTM
‑
、
‑
N=N
‑
、
‑
S(O)
‑
、
‑
SO2‑
、
‑
C(O)
‑
、
‑
NHC(O)
‑
、
‑
C(O)NH
‑
、
‑
NHSO2‑
、
‑
NHC(O)NH
‑
、
‑
NHC(O)O
...
【专利技术属性】
技术研发人员:安德鲁,
申请(专利权)人:阿尔维纳斯运营股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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