使用颤螺旋菌科微生物胞外囊泡治疗疾病和障碍的组合物和方法技术

本文提供了与可以用作治疗剂的获得自颤螺旋菌科细菌的微生物胞外囊泡(mEV)相关的方法和药物组合物。法和药物组合物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用颤螺旋菌科微生物胞外囊泡治疗疾病和障碍的组合物和方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求以下的权益：于2020年6月11日提交的美国临时申请号：63/037,771，该申请的全部内容通过引用并入本文。

技术实现思路

[0003]本文提供了与颤螺旋菌科细菌和/或来自颤螺旋菌科细菌的微生物胞外囊泡(mEV)在治疗和/或预防疾病或健康障碍(例如，癌症、自身免疫性疾病、炎性疾病、菌群失调和/或代谢疾病)中的用途有关的方法和组合物。如本文所披露的，某些类型的mEV，例如，获得自颤螺旋菌科细菌的分泌型微生物胞外囊泡(smEV)或经加工的微生物胞外囊泡(pmEV)具有治疗效果并且适用于治疗和/或预防疾病或健康障碍(例如，癌症、自身免疫性疾病、炎性疾病、菌群失调和/或代谢疾病)。
[0004]在一些实施例中，本文提供的药物组合物含有来自一种或多种颤螺旋菌科来源，例如一种或多种颤螺旋菌科菌株的mEV(例如smEV和/或pmEV)。在一些实施例中，本文提供的药物组合物含有来自一种颤螺旋菌科来源，例如一种颤螺旋菌科菌株的mEV。可基于细菌的特性(例如，生长特征、产量、在测定或受试者中调节免疫应答的能力)来选择用作mEV的来源的颤螺旋菌科菌株。包含mEV的药物组合物可以含有smEV、pmEV或两者的组合。在一些实施例中，颤螺旋菌科菌株是普氏栖粪杆菌(例如，普氏栖粪杆菌菌株A)、马西里福涅拉氏菌(例如，马西里福涅拉氏菌菌株A)、Harryflintia acetispora(例如，Harryflintia acetispora菌株A)、阿加萨杆菌属物种(例如，阿加萨杆菌属物种菌株A)、Acutalibacter sp.(例如，Acutalibacter sp.菌株A)、黑罗特克斯欧里何米尼斯菌(黑罗特克斯欧里何米尼斯菌菌株A)、或变异罕见小球菌(例如，变异罕见小球菌菌株A)。
[0005]在某些方面，本文提供了包含来自普氏栖粪杆菌的菌株的mEV(例如smEV和/或pmEV)的药物组合物。在一些实施例中，普氏栖粪杆菌菌株是与普氏栖粪杆菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126792)的核苷酸序列(例如，基因组序列、16S序列、CRISPR序列)包含至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、或至少99％序列同一性(例如，至少99.5％序列同一性、至少99.6％序列同一性、至少99.7％序列同一性、至少99.8％序列同一性、至少99.9％序列同一性)的菌株。在一些实施例中，普氏栖粪杆菌菌株是普氏栖粪杆菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126792)。
[0006]在某些方面，本文提供了包含来自马西里福涅拉氏菌的菌株的mEV的药物组合物。在一些实施例中，马西里福涅拉氏菌菌株是与马西里福涅拉氏菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126696)的核苷酸序列(例如，基因组序列、16S序列、CRISPR序列)包含至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、或至少99％序列同一性(例如，至少99.5％序列同一性、至少99.6％序列同一性、至少99.7％序列同一性、至少99.8％序列同一性、至少99.9％序列同一性)的菌株。在一些实施例中，马西里福涅拉氏菌菌株是马西里福涅拉氏菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126696)。
[0007]在某些方面，本文提供了包含来自Harryflintia acetispora的菌株的mEV的药物组合物。在一些实施例中，Harryflintia acetispora菌株是与Harryflintia acetispora菌株A(ATCC保藏号PTA
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126694)的核苷酸序列(例如，基因组序列、16S序列、CRISPR序列)包含至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、或至少99％序列同一性(例如，至少99.5％序列同一性、至少99.6％序列同一性、至少99.7％序列同一性、至少99.8％序列同一性、至少99.9％序列同一性)的菌株。在一些实施例中，Harryflintia acetispora菌株是Harryflintia acetispora菌株A(ATCC保藏号PTA
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126694)。
[0008]在某些方面，本文提供了包含来自阿加萨杆菌属物种的菌株的mEV的药物组合物。在一些实施例中，阿加萨杆菌属物种菌株是与阿加萨杆菌属物种菌株A(ATCC保藏号PTA
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125892)的核苷酸序列(例如，基因组序列、16S序列、CRISPR序列)包含至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、或至少99％序列同一性(例如，至少99.5％序列同一性、至少99.6％序列同一性、至少99.7％序列同一性、至少99.8％序列同一性、至少99.9％序列同一性)的菌株。在一些实施例中，阿加萨杆菌属物种菌株是阿加萨杆菌属物种菌株A(ATCC保藏号PTA
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125892)细菌。
[0009]在某些方面，本文提供了包含来自Acutalibacter sp.的菌株的mEV的药物组合物。在一些实施例中，Acutalibacter sp.菌株是与Acutalibacter sp.菌株A(ATCC保藏号PTA
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127006)的核苷酸序列(例如，基因组序列、16S序列、CRISPR序列)包含至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、或至少99％序列同一性(例如，至少99.5％序列同一性、至少99.6％序列同一性、至少99.7％序列同一性、至少99.8％序列同一性、至少99.9％序列同一性)的菌株。在一些实施例中，Acutalibacter sp.菌株是Acutalibacter sp.菌株A(ATCC保藏号PTA
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127006)。
[0010]在某些方面，本文提供了包含来自黑罗特克斯欧里何米尼斯菌的菌株的mEV的药物组合物。在一些实施例中，黑罗特克斯欧里何米尼斯菌菌株是与黑罗特克斯欧里何米尼斯菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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127005)的核苷酸序列(例如，基因组序列、16S序列、CRISPR序列)包含至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、或至少99％序列同一性(例如，至少99.5％序列同一性、至少99.6％序列同一性、至少99.7％序列同一性、至少99.8％序列同一性、至少99.9％序列同一性)的菌株。在一些实施例中，黑罗特克斯欧里何米尼斯菌菌株是黑罗特克斯欧里何米尼斯菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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127005)。
[0011]在某些方面，本文提供了包含来自变异罕见小球菌的菌株的mEV的药物组合物。在一些实施例中，变异罕见小球菌菌株是与变异罕见小球菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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127004)的核苷酸序列(例如，基因组序列、16S序列、CRISPR序列)包含至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、或至少99％序列同一性(例如，至少9本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种药物组合物，该药物组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的分离的药物组合物微生物胞外囊泡(mEV)(例如，治疗有效量的来自颤螺旋菌科细菌的mEV)。2.如权利要求1所述的药物组合物，其中该药物组合物的至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、或至少99％是mEV。3.一种药物组合物，该药物组合物包含分离的mEV或用于治疗癌症的治疗有效量。4.一种药物组合物，该药物组合物包含分离的mEV或用于治疗菌群失调的治疗有效量。5.一种药物组合物，该药物组合物包含分离的mEV或用于治疗自身免疫性疾病的治疗有效量。6.一种药物组合物，该药物组合物包含分离的mEV或用于治疗炎性疾病的治疗有效量。7.一种药物组合物，该药物组合物包含分离的mEV或用于治疗代谢疾病的治疗有效量。8.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的菌株的mEV，该颤螺旋菌科细菌的菌株与普氏栖粪杆菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126792)的核苷酸序列包含至少99％的基因组、16S和/或CRISPR序列同一性。9.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自该普氏栖粪杆菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126792)的mEV。10.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的菌株的mEV，该颤螺旋菌科细菌的菌株与马西里福涅拉氏菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126696)的核苷酸序列包含至少99％的基因组、16S和/或CRISPR序列同一性。11.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自该马西里福涅拉氏菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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126696)的mEV。12.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的菌株的mEV，该颤螺旋菌科细菌的菌株与Harryflintia acetispora菌株A(ATCC保藏号PTA
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126694)的核苷酸序列包含至少99％的基因组、16S和/或CRISPR序列同一性。13.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自该Harryflintia acetispora菌株A(ATCC保藏号PTA
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126694)的mEV。14.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的菌株的mEV，该颤螺旋菌科细菌的菌株与阿加萨杆菌属物种菌株A(ATCC保藏号PTA
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125892)的核苷酸序列包含至少99％的基因组、16S和/或CRISPR序列同一性。15.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自该阿加萨杆菌属物种菌株A(ATCC保藏号PTA
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125892)的mEV。16.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的菌株的mEV，该颤螺旋菌科细菌的菌株与Acutalibacter sp.菌株A(ATCC保藏号PTA
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127006)的核苷酸序列包含至少99％的基因组、16S和/或CRISPR序列同一性。17.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自该Acutalibacter sp.菌株A(ATCC保藏号PTA
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127006)的mEV。18.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的菌株的mEV，该颤螺旋菌科细菌的菌株与黑罗特克斯欧里何米尼斯菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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127005)的核苷酸序列包含至少99％的基因组、16S和/或CRISPR序列同一性。19.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自该黑罗特克
斯欧里何米尼斯菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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127005)的mEV。20.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自颤螺旋菌科细菌的菌株的mEV，该颤螺旋菌科细菌的菌株与变异罕见小球菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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127004)的核苷酸序列包含至少99％的基因组、16S和/或CRISPR序列同一性。21.如权利要求1至7中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含来自该变异罕见小球菌菌株A(ATCC保藏号PTA
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127004)的mEV。22.如权利要求1至21中任一项所述的药物组合物，其中该组合物活化先天抗原呈递细胞。23.如权利要求1至21中任一项所述的药物组合物，其中该组合物在胃肠道外具有一种或多种有益的免疫作用，例如，当口服施用时。24.如权利要求1至21中任一项所述的药物组合物，其中该组合物调节该受试者的胃肠道外的免疫作用，例如，当口服施用时。25.如权利要求1至24中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV由高产菌株产生。26.如权利要求25所述的药物组合物，其中该高产菌株从生物反应器生长的培养物产生至少3x 10
13
mEV/升。27.如权利要求1至26中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV包含pmEV，并且这些pmEV由已经γ辐照、UV辐照、热灭活、酸处理或氧喷射的细菌产生。28.如权利要求1至26中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV包含pmEV，并且这些pmEV由活细菌产生。29.如权利要求1至28中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含分泌型mEV(smEV)。30.如权利要求1至28中任一项所述的药物组合物，其中该组合物包含经加工的mEV(pmEV)。31.如权利要求1至30中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV被冻干(例如，冻干的产物进一步包含药学上可接受的赋形剂)。32.如权利要求1至31中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV经γ照射。33.如权利要求1至31中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV经UV照射。34.如权利要求1至31中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV经热灭活(例如，在50℃下两小时或在90℃下两小时)。35.如权利要求1至31中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV经酸处理。36.如权利要求1至31中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV经氧喷射(例如，以0.1vvm持续两小时)。37.如权利要求1至36中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV的剂量为约2x 106至约2x 10
16
个颗粒(例如，其中通过NTA(纳米颗粒跟踪分析)确定颗粒计数)。38.如权利要求1至36中任一项所述的药物组合物，其中这些mEV的剂量为约5mg至约900mg总蛋白(例如，其中总蛋白通过布拉德福德测定或BCA测定所确定)。39.如权利要求1至38中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物包含固体剂型。40.如权利要求39所述的药物组合物，其中该固体...

【专利技术属性】
技术研发人员：A，
申请(专利权)人：伊夫罗生物科学公司，
类型：发明
国别省市：