新Co/Zn/Cd外排系统组件变体及使用其生产L-赖氨酸的方法技术方案

技术编号:34877626 阅读:22 留言:0更新日期:2022-09-10 13:33
本公开涉及一种新Co/Zn/Cd外排系统组件变体、包含所述变体的谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)菌株以及使用所述菌株生产L

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】新Co/Zn/Cd外排系统组件变体及使用其生产L

赖氨酸的方法


[0001]本公开涉及一种新Co/Zn/Cd外排系统组件变体、包含所述变体的谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)菌株以及使用所述菌株生产L

赖氨酸的方法。

技术介绍

[0002]正在进行多种研究以开发出用于生产L

氨基酸和其他有用物质的高效微生物和发酵工艺技术。例如,主要使用目标物质特异性方法,在所述方法中编码参与L

赖氨酸生物合成的酶的基因的表达增加,或在所述方法中除去了生物合成不需要的基因(WO2008

082181 A1)。
[0003]但是,随着对L

赖氨酸的需求增加,仍然需要进行研究以有效增加L

赖氨酸生产能力。

技术实现思路

[0004]技术问题
[0005]本公开的一个目的为提供一种Co/Zn/Cd外排系统组件变体,其由SEQ ID NO:1表示的氨基酸序列组成,其中作为对应于SEQ ID NO:3的氨基酸序列的第130位的氨基酸的甘氨酸(Gly或G)被天冬氨酸(Asp或D)取代。
[0006]本公开的另一个目的为提供一种编码本公开的变体的多核苷酸。
[0007]本公开的又另一个目的为提供一种谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)菌株,其包含本公开的变体或编码所述变体的多核苷酸并且具有Lr/>‑
赖氨酸生产能力。
[0008]本公开的又另一个目的为提供一种用于生产L

赖氨酸的方法,其包括在培养基中培养包含本公开的变体或编码所述变体的多核苷酸并且具有L

赖氨酸生产能力的谷氨酸棒状杆菌菌株的步骤。
[0009]解决问题方法
[0010]将如下详细地描述本公开。同时,本公开中所公开的每个描述和实施方式均可应用于其他描述和实施方式。换句话讲,本公开中所公开的各种要素的所有组合均属于本公开的范围。此外,不可以认为本公开的范围受到以下所述的具体描述的限制。此外,在本说明书通篇,引用了许多论文和专利文件并指出了其引用文件。所引用的论文和专利文件中所公开的全部内容以引用的方式并入本说明书中,以更清楚地描述本专利技术所属的
的水平和本专利技术的内容。
[0011]本公开的一个方面提供了一种变体,其由SEQ ID NO:1表示的氨基酸序列组成,其中作为对应于SEQ ID NO:3的氨基酸序列的第130位的氨基酸的甘氨酸(Gly或G)被天冬氨酸(Asp或D)取代。
[0012]本公开的变体可具有由SEQ ID NO:1表示的氨基酸序列,包含所述氨基酸序列或基本上由所述氨基酸序列组成。
Genet.16:276

277)(版本5.0.0或之后版本)(包括GCG程序包(Devereux,J.等人,Nucleic Acids Research 12:387(1984))的Needleman程序中所执行的Needleman

Wunsch算法(Needleman和Wunsch,1970,J.Mol.Biol.48:443

453)、BLASTP、BLASTN、FASTA(Atschul,S.F.等人,J MOLEC BIOL 215:403(1990);Guide to Huge Computers,Martin J.Bishop编,Academic Press,San Diego,1994;以及CARILLO等人(1988)SIAM J Applied Math 48:1073)来确定。例如,可使用美国国家生物技术信息中心的BLAST或ClustalW确定同源性、类似性或同一性。
[0021]多核苷酸或多肽的同源性、类似性或同一性可如例如Smith和Waterman,Adv.Appl.Math(1981)2:482中所发表的通过使用例如GAP计算机程序诸如Needleman等人(1970),J Mol Biol.48:443比较序列信息来确定。概括地说,GAP程序可定义为通过两个序列中的较短序列中符号(即,核苷酸或氨基酸)的总数除以类似比对符号的数目所获得的值。GAP程序的默认参数可包括(1)二元比较矩阵(包括相同值为1且非同值为0)和Gribsko等人,(1986)Nucl.Acids Res.14:6745(或EDNAFULL(NCBI NUC4.4的EMBOSS版)取代矩阵)的加权比较矩阵,如Schwartz和Dayhoff编,Atlas Of Protein Sequence And Structure,National Biomedical Research Foundation,第353

358页(1979)中所公开;(2)每个空位的罚分为3.0并且每个空位的每个符号额外罚分0.10(或空位开放罚分为10,空位延伸罚分为0.5);以及(3)末端空位没有罚分。
[0022]作为本公开的实例,本公开的变体可以表现出Co/Zn/Cd外排系统组件活性。
[0023]在本公开中,术语“Co/Zn/Cd外排系统组件”是一种具有阳离子转运蛋白活性的多肽。具体地说,本公开的Co/Zn/Cd外排系统组件可以与阳离子转运蛋白互换使用。在本公开中,Co/Zn/Cd外排系统组件的序列可获自已知数据库NCBI的GenBank(例如,GenBank登录号WP_011014862.1)。具体地说,Co/Zn/Cd外排系统组件可以是由NCgl1992基因编码的表现出Co/Zn/Cd外排系统组件活性的多肽,但不限于此。
[0024]在本公开中,术语“对应于”是指多肽中所列出的位置处的氨基酸残基,或者与多肽中所列出的残基类似、相同或同源的氨基酸残基。鉴别对应位置处的氨基酸可为确定参考特定序列的序列中的特定氨基酸。如本文所用,“对应区域”通常是指相关蛋白或参考(reference)蛋白中类似或对应的位置。
[0025]例如,将任意氨基酸序列与SEQ ID NO:3比对(align),并且基于此,可以参考SEQ ID NO:3的氨基酸残基和对应氨基酸残基的数值位置对上述氨基酸序列的每个氨基酸残基进行编号。例如,如本公开中所述的序列比对算法可通过与查询序列(也称为“参考序列”)比较来确定氨基酸位置或修饰诸如取代、插入或缺失发生的位置。
[0026]针对此类比对,例如,可使用Needleman

Wunsch算法(Needleman和Wunsch,1970,J.Mol.Biol.48:443

453)、EMBOSS包的Needleman程序(EMBOSS:The European Molecular Biology Open Software Suite,Rice等人,2000,Trends Genet.16:276
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种Co/Zn/Cd外排系统组件变体,其由SEQ ID NO:1表示的氨基酸序列组成,其中,作为对应于SEQ ID NO:3的第130位的氨基酸的甘氨酸被天冬氨酸取代。2.一种多核苷酸,其编码根据权利要求1所述的变体。3.一种谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)菌株,其包含根据权利要求1所述的变体或编码所述变体的...

【专利技术属性】
技术研发人员:朴暠夽金柄秀李翰衡裵贤原卞效情许兰柳慧连金斐那孙晟光
申请(专利权)人:CJ第一制糖株式会社
类型:发明
国别省市:

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