MAdCAM靶向的免疫耐受制造技术

用于赋予位点特异性或局部免疫赦免(诸如靶向表达MAdCAM的细胞)的方法和化合物。本文公开了提供位点特异性免疫赦免的方法和治疗化合物。在一些实施方式中，治疗化合物包括工程化的多特异性化合物，例如工程化的双特异性分子，例如工程化的双特异性抗体分子。例如工程化的双特异性抗体分子。例如工程化的双特异性抗体分子。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】MAdCAM靶向的免疫耐受
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2019年5月20日提交的美国临时申请号62/850,172的优先权，其通过援引以整体并入本文。
[0003]本申请还涉及于2018年8月23日提交的美国临时申请号62/721,644、于2018年5月24日提交的美国临时申请号62/675,972、于2017年12月6日提交的美国临时申请号62/595,357、于2017年12月6日提交的美国临时申请号62/595,348、于2018年8月23日提交的美国非临时申请号16/109,875、于2018年8月23日提交的美国非临时申请号16/109,897、于2018年5月24日提交的美国非临时申请号15/988,311、于2018年5月24日提交的PCT申请号PCT/US2018/034334以及于2018年11月28日提交的PCT/US2018/062780，其各自通过援引以整体并入本文。


[0004]本文提供的实施方式涉及例如用于局部或靶向免疫赦免的方法和组合物。

技术介绍

[0005]有害的免疫应答的实例(例如在移植组织的排斥中或在自身免疫性疾患中)构成了全世界数百万人的主要健康问题。器官移植的长期结果通常以慢性排斥和移植器官的最终衰竭为特征。已知超过20种自身免疫性疾患，基本上影响身体的每个器官，并且仅在北美就影响超过5000万人。在这两种情况下用于对抗致病性免疫应答的广泛活性免疫抑制药物都有严重的副作用。

技术实现思路

[0006]本文公开了提供位点特异性免疫赦免的方法和治疗化合物。本文公开的实施方式通过援引并入本部分。
[0007]在一些实施方式中，治疗化合物包括工程化的多特异性化合物，例如工程化的双特异性分子，例如工程化的双特异性抗体分子，包括：
[0008]1)选自以下的特异性靶向部分：
[0009]a)供体特异性靶向部分，其例如优先结合供体靶标(同与接受者抗原的结合相比优先)，并且可用于为来自供体的移植组织(例如器官)提供位点特异性免疫赦免；或
[0010]b)组织特异性靶向部分，其例如优先地结合受试者靶组织(与受试者非靶组织相比优先)，并且可用于为遭受不必要的免疫攻击的受试者组织(例如，在自身免疫性疾患中)提供位点特异性免疫赦免；和
[0011]2)选自以下的效应物结合/调节部分：
[0012](a)免疫细胞抑制性分子结合/调节部分(在本文中称为ICIM结合/调节部分)；
[0013](b)免疫抑制性免疫细胞结合/调节部分(在本文中称为IIC结合/调节部分)；
[0014](c)作为治疗化合物的一部分促进免疫抑制性局部微环境的效应物结合/调节部
分，例如通过在靶标附近提供抑制或最小化免疫系统对靶标的攻击的物质(在本文中称为SM结合/调节部分)；或
[0015](d)免疫细胞刺激分子结合/调节部分(在本文中称为ICSM结合/调节部分)，其中ICSM通过例如阻断共刺激分子与其反结构之间的相互作用来抑制免疫激活。
[0016]效应物结合/调节部分可以属于类别a、b和c中的多于一类。例如，如下所示的，CTLA4结合分子属于类别a和b两者。
[0017]在一些实施方式中，治疗化合物包括ICIM结合/调节部分。在一些实施方式中，ICIM结合/调节分子结合并激动抑制性分子，例如抑制性免疫检查点分子，或以其他方式抑制或降低免疫细胞(例如细胞毒性T细胞、B细胞、NK细胞或骨髓细胞例如中性粒细胞或巨噬细胞)的活性。
[0018]在一些实施方式中，治疗化合物包括工程化的多特异性化合物，例如工程化的双特异性分子，例如工程化的双特异性抗体分子，包括：
[0019]1)特异性靶向部分，例如供体特异性靶向部分(其结合供体靶标并且可用于为来自供体的移植组织例如器官提供位点特异性免疫赦免)或组织特异性靶向部分(其结合受试者组织靶标并且可用于为遭受有害的免疫攻击(例如在自身免疫性疾患中)的受试者组织提供位点特异性免疫赦免)；和
[0020]2)效应物结合/调节部分，包括ICIM结合/调节部分，其与免疫细胞上的效应物分子，例如抑制性受体，例如PD
‑
1结合，其中，在特异性靶向部分与其靶标结合并且ICIM结合/调节部分与免疫细胞上的效应物分子的结合后，免疫细胞活性(例如免疫细胞发动免疫攻击的能力)下调，例如，通过依赖于免疫细胞上效应物分子聚集的抑制性信号。在一些实施方式中，工程化的多特异性化合物包括额外的结合部分使得其结合超过两种特异性分子，诸如但不限于3种或4种。
[0021]在一些实施方式中，治疗化合物包括ICIM结合/调节部分并具有以下特性中的一种或两种：(a)当治疗化合物与其靶标结合时免疫细胞的下调水平大于当治疗化合物未与其靶标结合时；以及(b)当与免疫细胞上的细胞表面抑制性受体例如PD
‑
1接合时，治疗化合物不抑制或基本上不抑制细胞表面抑制性受体结合内源性配体的能力。
[0022]在一些实施方式中，当治疗化合物与其靶标结合时免疫细胞的下调水平大于治疗化合物未与其靶标结合时。在实施方式中，靶标结合的治疗化合物的下调水平等于或大于未与其靶标结合时所见的水平的1.5倍、2倍、4倍、8倍或10倍。在实施方式中，当治疗化合物未与靶结合时，它不或不显著下调免疫细胞。因此，抑制性受体例如PD
‑
1的无差别或有害的激动被最小化或消除。例如，当治疗化合物与免疫细胞结合但未与靶向部分结合时，治疗化合物与抑制性免疫检查点分子的接合不会导致下调或不会导致显著下调，例如，治疗化合物结合的免疫细胞上的抑制性受体未聚集或未充分聚集以产生足以下调或显著抑制免疫细胞的抑制性信号。
[0023]在实施方式中，当与免疫细胞上的细胞表面抑制性受体例如PD
‑
1接合时，治疗化合物不抑制或基本上不抑制细胞表面抑制性受体结合内源性配体的能力。在一些实施方式中，治疗化合物可以结合PD
‑
1上的PD
‑
L1/2结合位点。因此，抑制性受体例如PD
‑
1的无差别或有害的拮抗被最小化或消除。在实施方式中，治疗化合物与免疫细胞上的抑制性受体例如PD
‑
1的结合不妨碍或基本上不妨碍抑制性受体结合天然配体例如PD
‑
L1的能力。在实施
方式中，治疗化合物与免疫细胞上的免疫抑制性受体例如PD
‑
1的结合比在没有治疗化合物的情况下所见的天然配体例如PD
‑
L1的结合减少小于50、40、30、20、10或5％。
[0024]在一些实施方式中，治疗化合物包括ICIM结合/调节部分，并且当以治疗有效剂量向受试者给药时，不会导致不可接受的全身免疫抑制水平，如果在一种类型的所有免疫细胞(例如所有T细胞)中抑制性受体的无差别激动发生，或全身免疫激活达到不可接受的水平，则这是可能的，如果治疗化合物拮抗抑制性受体与其本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种与MadCAM结合的抗体，其中，所述抗体包括表6或表7中提供的一个或多个序列。2.根据权利要求1所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段包括：(i)包括重链CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区，其中所述重链CDR1序列具有表6或表7中所示的任一CDR1序列的氨基酸序列；所述重链CDR2具有表6或表7中所示的任一CDR2序列的氨基酸序列，并且所述重链CDR3具有表6或表7中所示的任一CDR3序列的氨基酸序列，或任何前述的变体；和(ii)包括轻链CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区，其中所述轻链CDR1序列具有表6或表7中所示的任一CDR1序列的氨基酸序列；所述轻链CDR2具有表6或表7中所示的任一CDR2序列的氨基酸序列，并且所述轻链CDR3具有表6或表7中所示的任一CDR3序列的氨基酸序列，或任何前述的变体。3.根据权利要求1
‑
2中任一项所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段包括：i)包括重链CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区，其中所述重链CDR1序列具有SEQ ID NO:90、359或135的氨基酸序列；所述重链CDR2具有SEQ ID NO:91、170或381的氨基酸序列，并且所述重链CDR3具有SEQ ID NO:92、360或382的氨基酸序列，或任何前述的变体；和(ii)包括轻链CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区，其中所述轻链CDR1序列具有SEQ ID NO:93、361或383的氨基酸序列；所述轻链CDR2具有SEQ ID NO:87、362或384的氨基酸序列，并且所述轻链CDR3具有SEQ ID NO:94、363或385的氨基酸序列，或任何前述的变体。4.根据权利要求1
‑
3中任一项所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段包括：i)包括重链CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区，其中所述重链CDR1序列具有SEQ ID NO:90的氨基酸序列，所述重链CDR2具有SEQ ID NO:91的氨基酸序列，并且所述重链CDR3具有SEQ ID NO:92的氨基酸序列，或任何前述的变体；和(ii)包括轻链CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区，其中所述轻链CDR1序列具有SEQ ID NO:93的氨基酸序列，所述轻链CDR2具有SEQ ID NO:87的氨基酸序列，并且所述轻链CDR3具有SEQ ID NO:94的氨基酸序列，或任何前述的变体。5.根据权利要求1
‑
2中任一项所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段包括：i)包括重链CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区，其中所述重链CDR1序列具有SEQ ID NO:135的氨基酸序列，所述重链CDR2具有SEQ ID NO:381的氨基酸序列，并且所述重链CDR3具有SEQ ID NO:382的氨基酸序列，或任何前述的变体；和(ii)包括轻链CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区，其中所述轻链CDR1序列具有SEQ ID NO:383的氨基酸序列，所述轻链CDR2具有SEQ ID NO:384的氨基酸序列，并且所述轻链CDR3具有SEQ ID NO:385的氨基酸序列，或任何前述的变体。6.根据权利要求1
‑
2中任一项所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段包括：i)包括重链CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区，其中所述重链CDR1序列具有SEQ ID NO:359的氨基酸序列，所述重链CDR2具有SEQ ID NO:170的氨基酸序列，并且所述重链CDR3
具有SEQ ID NO:360的氨基酸序列，或任何前述的变体；和(ii)包括轻链CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区，其中所述轻链CDR1序列具有SEQ ID NO:361的氨基酸序列，所述轻链LCDR2具有SEQ ID NO:362的氨基酸序列，并且所述轻链CDR3具有SEQ ID NO:363的氨基酸序列，或任何前述的变体。7.根据前述权利要求中任一项所述的抗体，其中，所述重链可变区和所述轻链可变区为scFv形式。8.根据权利要求3所述的抗体，其中，所述重链可变区和所述轻链可变区为scFv形式。9.根据权利要求4所述的抗体，其中，所述重链可变区和所述轻链可变区为scFv形式。10.根据权利要求5所述的抗体，其中，所述重链可变区和所述轻链可变区为scFv形式。11.根据权利要求6所述的抗体，其中，所述重链可变区和所述轻链可变区为scFv形式。12.根据权利要求7
‑
11中任一项所述的抗体，其中，所述重链可变区和所述轻链可变区通过肽接头诸如甘氨酸/丝氨酸接头连接。13.根据权利要求1所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体包括表7中所示的V
K
序列。14.根据权利要求13所述的抗体，其中，所述V
K
序列包括SEQ ID NO:415、592或600的序列。15.根据权利要求1、13或14所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体包括表7中所示的V
H
序列。16.根据权利要求15所述的抗体，其中所述V
H
序列包括SEQ ID NO:414、591或599的序列。17.根据权利要求1所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体包括表7中所示的V
K
序列和表7中所示的V
H
序列。18.根据权利要求17所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体包括SEQ ID NO:415的V
K
或其变体和SEQ ID NO:414的V
H
序列或其变体。19.根据权利要求17所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体包括SEQ ID NO:592的V
K
或其变体和SEQ ID NO:591的V
H
序列或其变体。20.根据权利要求17所述的抗体，或其抗原结合片段，其中，所述抗体包括SEQ ID NO:600的V
K
或其变体和SEQ ID NO:599的V
H
序列或其变体。21.根据前述权利要求中任一项所述的抗体，其中，所述抗体与效应物分子连接或缔合。22.根据权利要求21所述的抗体，其中，所述效应物分子是IL
‑
2突变蛋白。23.根据权利要求22所述的抗体，其中，所述IL
‑
2突变蛋白包括以下中的一个或多个突变：E15Q、H16N、Q22E、D84N、E95Q、Q126E、N29S、Y31S、Y31H、K35R、T37A、K48E、N71R、L53I、L56I、L80I、L118I、V69A、Q74P、N88D、N88R、C125A或C125S。24.根据权利要求22或23所述的抗体，其中，所述IL
‑
2突变蛋白包括L53I、L56I、L80I或L118I突变。25.根据权利要求22
‑
24中任一项所述的抗体，其中，所述IL
‑
2突变蛋白包括N88D突变。26.根据权利要求22
‑
25中任一项所述的抗体，其中，所述IL
‑
2突变蛋白包括E15Q、H16N、Q22E、D84N、E95Q或Q126E突变。
27.根据权利要求22或23所述的抗体，其中，所述IL
‑
2突变蛋白包括N29S、Y31S、Y51H、K35R、T37A、K48E、V69A、N71R、Q74P、N88D、N88R、C125A或C125S突变。28.根据权利要求22
‑
27中任一项所述的抗体，其中，所述IL
‑
2突变蛋白与Fc肽融合或连接。29.根据权利要求28所述的抗体，其中，所述Fc肽包括在根据EU编号系统的L234、L235和G237或根据Kabat编号系统的L247、L248和G250的一个或多个位置处的突变。30.根据权利要求28所述的抗体，其中，所述Fc肽包括根据EU编号系统的L234A突变、L235A突变和/或G237A突变。31.根据权利要求21所述的抗体，其中，与所述效应物分子连接的所述抗体包括形成靶向效应物多肽的第一多肽链和第二多肽链，其中所述第一链包括具有下式的多肽：V
H
‑
H
c
‑
接头
‑
C1，其中V
H
是根据权利要求1
‑
20中任一项所述的抗体的重链可变结构域；H
c
是重链恒定结构域，诸如CH1
‑
CH2
‑
CH3结构域(SEQ ID NO:44)，所述接头是甘氨酸/丝氨酸接头，并且C1是与Fc蛋白融合或连接的IL
‑
2突变蛋白，其中所述Fc蛋白在所述IL
‑
2突变蛋白的N末端或C末端融合或连接；并且所述第二链包括具有式V
L
‑
L
c
的多肽，其中V
L
是根据权利要求1
‑
中任一项所述的抗体的轻链可变结构域，并且所述L
c
结构域是κ轻链恒定结构域。32.一种多肽，具有下式：Ab
‑
ConstantDomain
‑
接头A
‑
IL2Mutein
‑
接头B
‑
FcRegion，其中所述Ab是根据权利要求1
‑
20中任一项的重链可变区；所述ConstantDomain是IgG恒定结构域，诸如IgG1恒定结构域、IgG2恒定结构域、IgG3恒定结构域或IgG4；接头A是接头，诸如本文提供的那些，包括肽接头，IL2Mutein是IL
‑
2突变蛋白，诸如本文提供的那些；接头B是肽接头；并且FcRegion是Fc区，诸如本文提供的那些。33.根据权利要求32所述的多肽，其中，所述重链可变区是表7中提供的重链可变区，或其任何变体。34.根据权利要求32所述的多肽，其中，所述重链可变区是表7的克隆ID:6、75或79的重链可变区，或其任何变体。35.根据权利要求32所述的多肽，其中，所述重链可变区包括表7的6、75或79的重结构域的CDR，或其任何变体。36.根据权利要求32所述的多肽，其中，所述重链可变区包括SEQ ID NO:414、SEQ ID NO:591或SEQ ID NO:599的序列，或其任何变体。37.根据权利要求32所述的多肽，其中，所述重链可变区包括：SEQ ID NO:90的第一CDR、SEQ ID NO:91的第二CDR以及SEQ ID NO:92的第三CDR，或其任何变体；SEQ ID NO:359的第一CDR、SEQ ID NO:170的第二CDR以及SEQ ID NO:360的第三CDR，或其任何变体；或
SEQ ID NO:135的第一CDR、SEQ ID NO:381的第二CDR以及SEQ ID NO:382的第三CDR，或其任何变体。38.根据权利要求32
‑
38中任一项所述的多肽，其中，接头A包括(GGGGS)
n
或(GGGGA)
n
的序列，或其混合物，其中每个n独立地是1
‑
10。39.根据权利要求32所述的多肽，其中，所述IL
‑
2突变蛋白包括SEQ ID NO:32、33、34、35、36、37、38、39、40或41中任一个的序列。40.根据权利要求32
‑
39中任一项所述的多肽，其中，所述IL
‑
2突变蛋白包括T3A突变。41.根据权利要求32
‑
40中任一项所述的多肽，其中，接头B是接头，诸如肽接头，包括(GGGGS)
n
或(GGGGA)
n
的序列，或其混合物，其中每个n独立地是1
‑
10。42.根据权利要求32
‑
41中任一项所述的多肽，其中，所述FcRegion包括具有SEQ ID NO:21或SEQ ID NO:28的序列的肽。43.根据权利要求32
‑
42中任一项所述的多肽，其中，所述多肽包括具有式VL
‑
ConstantDomainLight的第二多肽，其中VL是根据权利要求1
‑
20中任一项所述的抗体的轻链可变结构域，并且所述ConstantDomainLight是IgG轻链恒定结构域。44.根据权利要求43所述的多肽，其中，VL包括SEQ ID NO:415、SEQ ID NO:592或SEQ ID NO:600的序列，或表7中提供的VL序列，或其任何变体。45.根据权利要求43所述的多肽，其中，所述VL包括：SEQ ID NO:93的第一CDR、SEQ ID NO:87的第二CDR以及SEQ ID NO:94的第三CDR；SEQ ID NO:361的第一CDR、SEQ ID NO:362的第二CDR以及SEQ ID NO:363的第三CDR；或SEQ ID NO:383的第一CDR、SEQ ID NO:384的第二CDR以及SEQ ID NO:385的第三CDR。46.根据权利要求42
‑
45中任一项所述的多肽，其中，所述ConstantDomainLight包括SEQ ID NO:45的序列。47.一种多肽，包括式IL2Mutein
‑
接头A
‑<...

【专利技术属性】
技术研发人员：N，
申请(专利权)人：潘迪恩运营公司，
类型：发明
国别省市：