间皮素CAR及其用途制造技术

技术编号:33702008 阅读:12 留言:0更新日期:2022-06-06 08:13
本公开的主题提供多肽组合物,其包含靶向间皮素的嵌合抗原受体(CAR);和程序性死亡1的显性负形式(PD

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】间皮素CAR及其用途
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2019年5月16日提交的美国临时申请号:62/848,983和2020年2月13日提交的美国临时申请号:62/975,966的优先权,其各自的内容通过引用以其整体并入,并且要求每个所要求的优先权。
[0003]序列表
[0004]本申请包含序列表,该序列表是通过EFS

Web以ASCII格式提交的,在此通过引用整体并入。ASCII副本创建于2020年5月13日,命名为0727341041SL_ST25.TXT,大小为144,318字节。


[0005]本公开主题提供用于增强对癌症和病原体的免疫应答的方法和组合物。它涉及特异性靶向人间皮素的嵌合抗原受体(CAR),以及包含这类CAR的免疫应答细胞。本公开的靶向间皮素的CAR具有增强的免疫激活特性,包括抗肿瘤活性,同时具有最小化CAR诱导的毒性和免疫原性的特征。

技术介绍

[0006]基于细胞的免疫治疗是一种具有治愈癌症潜力的疗法。可以通过引入编码对选择的抗原特异性的人工或合成抗原受体(称为嵌合抗原受体(CAR))的遗传物质对T细胞和其他免疫细胞进行修饰以靶向肿瘤抗原。使用CAR的靶向T细胞疗法最近在治疗一些血液系统恶性肿瘤方面取得临床成功。然而,将表达CAR的T细胞疗法用于实体瘤存在一些障碍,必须克服这些障碍才能实现临床益处。恶性细胞适应产生免疫抑制微环境以保护自己免受免疫识别和清除。这种肿瘤微环境对涉及刺激免疫反应的治疗方法提出挑战,例如靶向T细胞疗法。实体瘤也可能被限制在阻碍有效T细胞运输、缺乏激动性共刺激配体的表达和/或表达T细胞功能负调节因子的解剖区间内。因此,成功清除实体瘤需要有效的肿瘤渗透和克服肿瘤引起的免疫抑制。此外,实体瘤对选择能够通过强力的T细胞根除肿瘤且对非肿瘤组织的毒性最小或可耐受的最佳免疫靶标抗原提出挑战。
[0007]因此,需要设计用于治疗癌症(特别是实体瘤)的CAR的能够以最小的毒性和免疫原性诱导有效的肿瘤根除的新的治疗策略。

技术实现思路

[0008]本公开的主题提供多肽组合物,其包含(a)特异性靶向间皮素(例如,人间皮素)的嵌合抗原受体(CAR);(b)显性负形式的程序性死亡1(PD

1 DN);包含此类多肽组合物的免疫应答细胞,以及这些多肽组合物和免疫应答细胞的用途,例如,用于治疗癌症。
[0009]本公开的主题提供多肽组合物。在某些实施方式中,多肽组合物包含:i)嵌合抗原受体(CAR)和ii)显性负形式的程序性死亡1(PD

1DN),其中CAR包含(a)胞外抗原结合结构域和(b)包含修饰的CD3ζ多肽的胞内信号传导结构域,所述CD3ζ多肽包含ITAM2变体和
ITAM3变体,其中ITAM2变体和ITAM3变体中的每一个都包含两个功能丧失突变。
[0010]在某些实施方式中,胞外抗原结合结构域包含:重链可变区,其包含含有SEQ ID NO:76所示氨基酸序列的CDR1,含有SEQ ID NO:77所示氨基酸序列的CDR2,含有SEQ ID NO:78所示氨基酸序列的CDR3;和轻链可变区,其包含含有SEQ ID NO:79所示氨基酸序列的CDR1,含有SEQ ID NO:80所示氨基酸序列的CDR2,含有SEQ ID NO:81所示氨基酸序列的CDR3。
[0011]在某些实施方式中,PD

1 DN包含:(a)包含配体结合区的程序性死亡1(PD

1)的胞外结构域的至少一部分,和(b)第一跨膜结构域。
[0012]在某些实施方式中,PD

1 DN的第一跨膜结构域包含CD8多肽、CD28多肽、CD3ζ多肽、CD4多肽、4

1BB多肽、OX40多肽、CD166多肽、CD166多肽、CD8a多肽、CD8b多肽、ICOS多肽、ICAM

1多肽、CTLA

4多肽、CD27多肽、CD40/My88肽、NKGD2肽、或其组合。在某些实施方式中,PD

1 DN的第一跨膜结构域包含CD8多肽。在某些实施方式中,PD

1 DN的第一跨膜结构域中包含的CD8多肽包含SEQ ID NO:86的氨基酸137至207。在某些实施方式中,PD

1 DN缺少胞内结构域。在某些实施方式中,PD

1 DN包含SEQ ID NO:48的氨基酸21至165和SEQ ID NO:86的氨基酸137至207。
[0013]在某些实施方式中,CAR的胞外抗原结合结构域以约1nM至约25nM的EC50值特异性结合人间皮素。在某些实施方式中,CAR的胞外抗原结合结构域以约20nM的EC50值特异性结合人间皮素。
[0014]在某些实施方式中,CAR的胞外抗原结合结构域包含单链可变片段(scFv)、任选交联的Fab、或F(ab)2。在某些实施方式中,CAR的胞外抗原结合结构域包含人scFv。在某些实施方式中,CAR的胞外抗原结合结构域识别间皮素表达水平为约1000或更多间皮素结合位点/细胞的人间皮素。
[0015]在某些实施方式中,所述重链可变区包含与SEQ ID NO:82所示氨基酸序列具有至少约80%、至少约81%、至少约82%、至少约83%、至少约84%、至少约85%、至少约86%、至少约87%、至少约88%、至少约89%、至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%、或至少约100%同源性或同一性的氨基酸序列。在某些实施方式中,所述重链可变区包含SEQ ID NO:82所示氨基酸序列。
[0016]在某些实施方式中,所述轻链可变区包含与SEQ ID NO:83所示氨基酸序列具有至少约80%、至少约81%、至少约82%、至少约83%、至少约84%、至少约85%、至少约86%、至少约87%、至少约88%、至少约89%、至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%、或至少约100%同源性或同一性的氨基酸序列。在某些实施方式中,所述轻链可变区包含SEQ ID NO:83所示氨基酸序列。
[0017]在某些实施方式中,所述重链可变区包含与SEQ ID NO:82所示氨基酸序列具有至少约80%、至少约81%、至少约82%、至少约83%、至少约84%、至少约85%、至少约86%、至少约87%、至少约88%、至少约89%、至少约90%、至少约91%、至少约92%、至少约93%、至少约94%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%、或至少约100%同源性或同一性的氨基酸序列,并且所述轻链可变区包含与SEQ ID NO:83所示氨基酸序列
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种多肽组合物,其包括:i)嵌合抗原受体(CAR),其包括:(a)胞外抗原结合结构域,其包括:重链可变区,其包含由SEQ ID NO:76所示氨基酸序列组成的CDR1、由SEQ ID NO:77所示氨基酸序列组成的CDR2、和由SEQ ID NO:78所示氨基酸序列组成的CDR3;以及轻链可变区,其包含由SEQ ID NO:79所示氨基酸序列组成的CDR1、由SEQ ID NO:80所示氨基酸序列组成的CDR2、和由SEQ ID NO:81所示氨基酸序列组成的CDR3,(b)胞内信号传导结构域,其包含修饰的CD3ζ多肽,所述修饰的CD3ζ多肽包含ITAM2变体和ITAM3变体,其中所述ITAM2变体和ITAM3变体中的每一个均包含两个功能丧失突变;和ii)程序性死亡1的显性负形式(PD

1DN),其包括:(a)程序性死亡1(PD

1)的胞外结构域的至少一部分,其包含配体结合区,和(b)第一跨膜结构域。2.根据权利要求1所述的多肽组合物,其中所述CAR的胞外抗原结合结构域以约1nM至约25nM的EC50值特异性结合人间皮素。3.根据权利要求1或2所述的多肽组合物,其中所述CAR的胞外抗原结合结构域包含单链可变片段(scFv)、任选交联的Fab、或F(ab)2。4.根据权利要求3所述的多肽组合物,其中所述CAR的胞外抗原结合结构域包含人scFv。5.根据权利要求1

4中任一项所述的多肽组合物,其中所述CAR的胞外抗原结合结构域识别间皮素表达水平为约1000或更多间皮素结合位点/细胞的人间皮素。6.根据权利要求1

5中任一项所述的多肽组合物,其中所述重链可变区包含与SEQ ID NO:82所示氨基酸序列具有至少约80%同源性或同一性的氨基酸序列。7.根据权利要求1

6中任一项所述的多肽组合物,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:82所示氨基酸序列。8.根据权利要求1

7中任一项所述的多肽组合物,其中所述轻链可变区包含与SEQ ID NO:83所示氨基酸序列具有至少约80%同源性或同一性的氨基酸序列。9.根据权利要求1

8中任一项所述的多肽组合物,其中所述轻链可变区包含SEQ ID NO:83所示氨基酸序列。10.根据权利要求1

9中任一项所述的多肽组合物,其中所述重链可变区包含与SEQ ID NO:82所示氨基酸序列具有至少约80%同源性或同一性的氨基酸序列,所述轻链可变区包含与SEQ ID NO:83所示氨基酸序列具有至少约80%同源性或同一性的氨基酸序列。11.根据权利要求1

10中任一项所述的多肽组合物,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:82所示氨基酸序列,且所述轻链可变区包含SEQ ID NO:83所示氨基酸序列。12.根据权利要求1

11中任一项所述的多肽组合物,其中所述CAR的胞外抗原结合结构域包含重链可变区和轻链可变区之间的接头。13.根据权利要求1

12中任一项所述的多肽组合物,其中在所述胞外抗原结合结构域的N端共价连接一前导物。14.根据权利要求13所述的多肽组合物,其中所述前导物包含CD8多肽。15.根据权利要求14所述的多肽组合物,其中所述CD8多肽由SEQ ID NO:71所示氨基酸
序列组成。16.根据权利要求1

15中任一项所述的多肽组合物,其中PD

1的胞外结构域的所述至少一部分包含SEQ ID NO:48的氨基酸21至165。17.根据权利要求1

16中任一项所述的多肽组合物,其中PD

1DN的第一跨膜结构域包含CD8多肽、CD28多肽、CD3ζ多肽、CD4多肽、4

1BB多肽、OX40多肽、CD166多肽、CD166多肽、CD8a多肽、CD8b多肽、ICOS多肽、ICAM

1多肽、CTLA

4多肽、CD27多肽、CD40/My88肽、NKGD2肽、或其组合。18.根据权利要求17所述的多肽组合物,其中所述PD

1DN的第一跨膜结构域包含CD8多肽。19.根据权利要求18所述的多肽组合物,其中包含于所述PD

1DN的第一跨膜结构域中的CD8多肽包含SEQ ID NO:86的氨基酸137至207。20.根据权利要求1

28中任一项所述的多肽组合物,其中所述PD

1DN包含SEQ ID NO:48的氨基酸21至165和SEQ ID NO:86的氨基酸137至207。21.根据权利要求1

20中任一项所述的多肽组合物,其中所述两个功能丧失突变中的每一个都位于酪氨酸氨基酸残基处。22.根据权利要求1

21中任一项所述的多肽组合物,其中所述ITAM2变体包含SEQ ID NO:29所示氨基酸序列或由其组成。23.根据权利要求1

22中任一项所述的多肽组合物,其中所述ITAM3变体包含SEQ ID NO:33所示氨基酸序列或由其组成。24.根据权利要求1

23中任一项所述的多肽组合物,其中所述修饰的CD3ζ多肽包含天然ITAM1。25.根据权利要求24所述的多肽组合物,其中所述天然ITAM1包含SEQ ID NO:23所示氨基酸序列或由其组成。26.根据权利要求1

25中任一项所述的多肽组合物,其中所述修饰的CD3ζ多肽包含SEQ ID NO:35所示氨基酸序列或由其组成。27.根据权利要求1

26中任一项所述的多肽组合物,其中所述PD

1DN缺少胞内结构域。28.根据权利要求1

27中任一项所述的多肽组合物,其中所述CAR还包含第二跨膜结构域。29.权利要求28所述的多肽组合物,其中所述CAR的第二跨膜结构域包含CD8多肽、CD28多肽、CD3ζ多肽、CD4多肽、4

1BB多肽、OX40多肽、CD166多肽、CD166多肽、CD8a多肽、CD8b多肽、ICOS多肽、ICAM

1多肽、CTLA

4多肽、CD27多肽、CD40/My88肽、NKGD2肽、或其组合。30.根据权利要求28或29所述的多肽组合物,其中所述CAR的第二跨膜结构域包含CD28多肽。31.根据权利要求1

30中任一项所述的多肽组合物,其中所述CAR的胞内信号传导结构域还包含共刺激信号传导区。32.根据权利要求31所述的多肽组合物,其中所述共刺激信号传导区包含CD28多肽、4

1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、DAP

10多肽、CD27多肽、CD40/My88多肽、NKGD2多肽、或其组合。33.根据权利要求31或32所述的多肽组合物,其中所述共刺激信号传导区包含CD28多
肽。34.根据权利要求1

33中任一项所述的多肽组合物,其中所述CAR包含SEQ ID NO:56所示氨基酸序列。35.一种免疫应答细胞,其包含权利要求1

34中任一项所述的多肽组合物。36.根据权利要求35所述的免疫应答细胞,其中所述PD

1DN和/或所述CAR为重组表达。37.根据权利要求35或36所述的免疫应答细胞,其中所述PD

1DN和/或所述CAR由载体表达。38.根据权利要求35

37中任一项所述的免疫应答细胞,其中所述免疫应答细胞选自T细胞、自然杀伤(NK)细胞和从中可分化淋巴细胞的多能干细胞。39.根据权利要求38所述的免疫应答细胞,其中所述免疫应答细胞为T细胞。40.根据权利要求39所述的免疫应答细胞,其中所述T细胞选自细胞毒性T淋巴细胞(CTL)、调节性T细胞和自然杀伤T(NKT)细胞。41.根据权利要求38所述的免疫应答细胞,其中所述多能干细胞为胚胎干细胞或诱导多能干细胞。42.根据权利要求35

41中任一项所述的免疫应答细胞,其中所述免疫应答细胞是自体的。43.根据权利要求35

41中任一项所述的免疫应答细胞,其中所述免疫应答细胞是同种异体的。44.一种药物组合物,其包含有效量的权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:M
申请(专利权)人:纪念斯隆凯特琳癌症中心
类型:发明
国别省市:

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