一种蛋白酶基因甲基化作为脑卒中早期诊断的潜在标志物制造技术

本发明专利技术公开了一种蛋白酶基因甲基化作为脑卒中早期诊断的潜在标志物。本发明专利技术提供了甲基化HTRA1基因以及HTRA1在血液中的表达程度作为标志物在制备产品中的应用；所述产品具有如下任一功能：(1)辅助诊断脑卒中；(2)在临床症状之前预警卒中。本发明专利技术发现血液HTRA1甲基化以及HTRA1在血液中的表达程度可作为脑卒中预警和早期诊断的潜在标志物。本发明专利技术对于提高脑卒中诊疗效果均有重要的科学意义和临床应用价值。用价值。

【技术实现步骤摘要】
一种蛋白酶基因甲基化作为脑卒中早期诊断的潜在标志物


[0001]本专利技术涉及医学领域，特别涉及一种蛋白酶基因甲基化作为脑卒中早期诊断的潜在标志物。

技术介绍

[0002]脑卒中是由于脑部供血动脉突然破裂或管腔的阻塞或狭窄，导致脑部的局部血液循环障碍而产生的一系列症状的临床疾病[Lindgren A.Stroke genetics:a review and update[J].Journal of Stroke,2014,16(3):114]。2016年全球25岁及以上人群患脑卒中的终生风险约为25％，中国人群患脑卒中风险高达39.3％，其中男性为41.1％，女性为36.7％[Collaborators GBDLRoS,Feigin VL,Nguyen G,Cercy K,Johnson CO,Alam T,et al.Global,regional,and country-specific lifetime risks of stroke,1990and 2016.N Engl J Med.2018；379:2429-2437]。《中国心血管本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.甲基化HTRA1基因作为标志物在制备产品中的应用；所述产品具有如下任一功能：(1)辅助诊断脑卒中；(2)在临床症状之前预警卒中。2.用于检测HTRA1基因甲基化水平的物质在制备产品中的应用；所述产品具有如下任一功能：(1)辅助诊断脑卒中；(2)在临床症状之前预警卒中。3.用于检测HTRA1基因甲基化水平的物质和储存有数学模型建立方法和/或使用方法的介质在制备产品中的应用；所述产品具有如下任一功能：(1)辅助诊断脑卒中；(2)在临床症状之前预警卒中；所述数学模型按照包括如下步骤的方法获得：(A1)分别检测n1个A类型样本和n2个B类型样本的HTRA1基因甲基化水平；(A2)取步骤(A1)获得的所有样本的HTRA1基因甲基化水平数据，按照A类型样本和B类型样本的分类方式，通过二分类逻辑回归法建立数学模型；所述数学模型的使用方法包括如下步骤：(B1)检测待测样本的HTRA1基因甲基化水平；(B2)将步骤(B1)获得的所述待测样本的HTRA1基因甲基化水平数据代入所述数学模型，得到检测指数；然后比较检测指数和阈值的大小，根据比较结果确定所述待测样本是A类型样本还是B类型样本；所述A类型样本和所述B类型样本为如下中的任一种：(C1)未来2年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C2)未来1.5年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C3)未来1.32年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C4)未来1年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照。4.储存有数学模型建立方法和/或使用方法的介质在制备产品中的应用；所述产品具有如下任一功能：(1)辅助诊断脑卒中；(2)在临床症状之前预警卒中；所述数学模型按照包括如下步骤的方法获得：(A1)分别检测n1个A类型样本和n2个B类型样本的HTRA1基因甲基化水平；(A2)取步骤(A1)获得的所有样本的HTRA1基因甲基化水平数据，按照A类型样本和B类型样本的分类方式，通过二分类逻辑回归法建立数学模型；所述数学模型的使用方法包括如下步骤：(B1)检测待测样本的HTRA1基因甲基化水平；(B2)将步骤(B1)获得的所述待测样本的HTRA1基因甲基化水平数据代入所述数学模型，得到检测指数；然后比较检测指数和阈值的大小，根据比较结果确定所述待测样本是A类型样本还是B类型样本；所述A类型样本和所述B类型样本为如下中的任一种：
(C1)未来2年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C2)未来1.5年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C3)未来1.32年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C4)未来1年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照。5.试剂盒，包括用于检测HTRA1基因甲基化水平的物质；所述试剂盒的用途为如下中的至少一种：(1)辅助诊断脑卒中；(2)在临床症状之前预警卒中；进一步地，所述试剂盒中还含有权利要求3或4中所述的储存有数学模型建立方法和/或使用方法的介质。6.系统，包括：(D1)用于检测HTRA1基因甲基化水平的试剂和/或仪器；(D2)装置，所述装置包括单元M和单元N；所述单元M用于建立数学模型，包括数据采集模块、数据分析处理模块和模型输出模块；所述数据采集模块用于采集(D1)检测得到的n1个A类型样本和n2个B类型样本的HTRA1基因甲基化水平数据；所述数据分析处理模块能够基于所述数据采集模块采集的n1个A类型样本和n2个B类型样本的HTRA1基因甲基化水平数据，按照A类型样本和B类型样本的分类方式，通过二分类逻辑回归法建立数学模型；所述模型输出模块用于输出所述数据分析处理模块建立的数学模型；所述单元N用于确定待测样本是A类型样本还是B类型样本，包括数据输入模块、数据运算模块、数据比较模块和结论输出模块；所述数据输入模块用于输入(D1)检测得到的待测者的HTRA1基因甲基化水平数据；所述数据运算模块用于将所述待测者HTRA1基因甲基化水平数据代入所述数学模型，计算得到检测指数；所述数据比较模块用于将所述检测指数与阈值进行比较；所述结论输出模块用于根据所述数据比较模块的比较结果输出所述待测样本是A类型样本还是B类型样本的结论；所述A类型样本和所述B类型样本为如下中的任一种：(C1)未来2年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C2)未来1.5年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C3)未来1.32年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照；(C4)未来1年内发生脑卒中的潜在患者和健康对照。7.细胞或机体内HTRA1基因甲基化水平在调控所述细胞或机体内HTRA1基因表达量中的应用；进一步地，在所述细胞或机体内，所述HTRA1基因甲基化水平越高，所述HTRA1基因表达量越低，和/或所述HTRA1基因甲基化水平越低，所述HTRA1基因表达量越高。8.根据权利要求1-7中任一所述的应用或试剂盒或系统，其特征在于：所述HTRA1基因
甲基化水平为HTRA1基因中如下(e1)-(e5)所示片段中全部或部分CpG位点的甲基化水平；所述甲基化HTRA1基因为HTRA1基因中如下(e1)-(e5)所示片段中全部或部分CpG位点甲基化；(e1)SEQ ID No.1所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；(e2)SEQ ID No.2所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；(e3)SEQ ID No.3所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；(e4)SEQ ID No.4所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；(e5)SEQ ID No.5所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；进一步地，所述“全部或部分CpG位点”为如下任一：(f1)SEQ ID No.1所示的DNA片段自5
’
端第164-165位所示CpG位点、SEQ ID No.1所示的DNA片段自5
’
端第255-256位所示CpG位点、SEQ ID No.1所示的DNA片段自5
’
端第265-266位所示CpG位点、SEQ ID No.1所示的DNA片段自5
’
端第282-283位所示CpG位点，或SEQ ID No.1所示的DNA片段自5
’
端第366-367位所示CpG位点；(f2)SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第90-91位所示CpG位点、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第155-156位所示CpG位点、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第217-218位所示CpG位点、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第226-227位所示CpG位点、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第234-235位和第239-240位所示CpG位点，或SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第263-264位和第269-270位所示CpG位点；(f3)SEQ ID No.3所示的DNA片段自5
’
...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨蓉西，沈冲，刘春兰，尹启明，
申请(专利权)人：南京腾辰生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：