一种癌症鉴别标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种癌症鉴别标志物及其应用。本发明专利技术要求保护一种试剂盒，包括用于检测RASGEF1C基因甲基化水平的物质；所述试剂盒可用于区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺恶性肿瘤、甲状腺良性肿瘤和不同亚型/不同分期的甲状腺恶性肿瘤；区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同亚型/不同分期。本发明专利技术揭示了相较于甲状腺良性肿瘤，甲状腺癌患者组织中RASGEF1C基因的低甲基化现象，本发明专利技术对提高甲状腺癌早期诊疗效果和降低甲状腺癌死亡率，以及指导制定合理的临床治疗方案均有重要的科学意义和临床应用价值。学意义和临床应用价值。

【技术实现步骤摘要】
一种癌症鉴别标志物及其应用


[0001]本专利技术涉及医学领域，特别涉及一种癌症鉴别标志物及其应用。

技术介绍

[0002]甲状腺癌(Thyroid cancer)为一种很常见的内分泌系统恶性肿瘤，包括甲状腺乳头状癌、滤泡性甲状腺癌、未分化甲状腺癌和髓样癌。其中，乳头状癌(Papillary thyroid cancer,PTC)最为常见，可所有甲状腺恶性肿瘤的90％以上[Xing,Mingzhao；Haugen,Bryan R；Schlumberger,Martin(2013).Progress in molecular
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based management of differentiated thyroid cancer.The Lancet,381(9871),1058
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1069.]。根据统计，成人甲状腺结节的患病率大约为5
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10％，其中60岁以上人群最为严重，可高达50
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70％[Guth S,Theune U,Aberle J,et al.Very high prevalence of thyroid nodules detected by high frequency(13MHz)ultrasound examination.Eur J Clin Invest 2009；39:699
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706.]。影像学检查是一种比较普遍的甲状腺诊断方法，该方法大多依靠医生经验判断，存在一定结果误差，而且影像学对人身体有一定的辐射伤害。细针穿刺活检也是一种临床上常见的甲状腺癌诊断技术，该方法根据穿刺物的细胞学形态对结节的良恶性进行评估。由于甲状腺良恶性肿瘤的细胞学特征常发生重叠，因此约有10
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30％的细针穿刺诊断为不明确细胞学结果[Cibas ES,Ali SZ.The 2017Bethesda System for Reporting Thyroid Cytopathology.Thyroid.2017；27(11):1341
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6.]。不确定的穿刺结果可导致约60％的患者遭受过度治疗或者漏诊[Stewart R,Leang YJ,Bhatt CR,Grodski S,Serpell J,Lee JC.Quantifying the differences in surgical management of patients with definitive and indeterminate thyroid nodule cytology.Eur J Surg Oncol.2020；46(2):252
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7.]。这不仅增加了患者的经济和身心负担，还占据了大量的公共卫生资源，导致医疗保健系统的巨额财务成本。因此，鉴别甲状腺良恶性肿瘤将有利于临床医师采取更精准的治疗方案，具有重要的临床和公共卫生意义。
[0003]表观遗传学是一种不涉及DNA序列改变但是却可遗传的基因表达调控方式，并且能够遗传给下一代[Nicoglou A,Merlin F.Epigenetics:A way to bridge the gap between biological fields.Stud Hist Philos Biol Biomed Sci.2017；66:73
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82]。DNA甲基化是表观遗传调控的重要方式之一，指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5
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碳位共价键结合一个甲基基团[Bird A.Perceptions of epigenetics.Nature.2007；447:396
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398]。大量的研究表明，DNA甲基化能够引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因的表达[Moore LD,Le T,Fan G.DNA methylation and its basic function.Neuropsychopharmacology.2013；38:23
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38]。
[0004]DNA甲基化标志物是现阶段一种最佳的肿瘤体外早诊分子标志物，目前临床上关于甲状腺癌诊断标志物的灵敏度和特异性还很有限，尤其是缺乏早期诊断的标志物，因此更为敏感、特异的早期分子标记物亟待发掘。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是提供一种癌症鉴别标志物及其应用。
[0006]第一方面，本专利技术要求保护一种试剂盒。
[0007]本专利技术要求保护的试剂盒包括用于检测RASGEF1C基因甲基化水平的物质；所述试剂盒的用途为如下中的至少一种：
[0008](1)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺恶性肿瘤；
[0009](2)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同亚型的甲状腺恶性肿瘤；
[0010](3)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同分期的甲状腺恶性肿瘤；
[0011](4)区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同亚型；
[0012](5)区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同分期。
[0013]进一步地，(2)和(4)中所述不同亚型可为病理分型，如组织学分型。
[0014]进一步地，(3)和(5)中所述不同分期可为临床分期。
[0015]在本专利技术的具体实施方式中，(2)中所述区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同亚型的甲状腺恶性肿瘤具体可为如下任一种：区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺乳头状癌、区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺滤泡癌、区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺髓样癌、区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺未分化癌。
[0016]在本专利技术的具体实施方式中，(3)中所述区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同分期的甲状腺恶性肿瘤具体可为如下任一种：区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和Ⅰ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和Ⅱ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和Ⅲ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和Ⅳ期甲状腺恶性肿瘤。
[0017]在本专利技术的具体实施方式中，(4)中所述区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同亚型具体可为如下任一种：区分或辅助区分甲状腺乳头状癌和甲状腺滤泡癌、区分或辅助区分甲状腺乳头状癌和甲状腺髓样癌、区分或辅助区分甲状腺乳头状癌和甲状腺未分化癌、区分或辅助区分甲状腺滤泡癌和甲状腺髓样癌、区分或辅助区分甲状腺滤泡癌和甲状腺未分化癌、区分或辅助区分甲状腺髓样癌和甲状腺未分化癌。
[0018]在本专利技术的具体实施方式中，(5)中所述区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同分期具体可为如下任一种：区分或辅助区分Ⅰ期甲状腺恶性肿瘤和Ⅱ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助区分Ⅰ期甲状腺恶性肿瘤和Ⅲ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助区分Ⅰ期甲状腺恶性肿瘤和Ⅳ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助区分Ⅱ期甲状腺恶性肿瘤和Ⅲ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助区分Ⅱ期甲状腺恶性肿瘤和Ⅳ期甲状腺恶性肿瘤、区分或辅助本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种试剂盒，包括用于检测RASGEF1C基因甲基化水平的物质；所述试剂盒的用途为如下中的至少一种：(1)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和甲状腺恶性肿瘤；(2)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同亚型的甲状腺恶性肿瘤；(3)区分或辅助区分甲状腺良性肿瘤和不同分期的甲状腺恶性肿瘤；(4)区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同亚型；(5)区分或辅助区分甲状腺恶性肿瘤不同分期。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于：所述RASGEF1C基因甲基化水平为RASGEF1C基因中如下(A1)
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(A4)所示片段中的全部或部分CpG位点的甲基化水平：(A1)SEQ ID No.1所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；(A2)SEQ ID No.2所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；(A3)SEQ ID No.3所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段；(A4)SEQ ID No.4所示的DNA片段或与其具有80％以上同一性的DNA片段。3.根据权利要求1或2所述的试剂盒，其特征在于：所述全部或部分CpG位点为如下任一所示CpG位点：(B1)RASGEF1C基因中SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示4个DNA片段中的任意一个或多个CpG位点；(B2)RASGEF1C基因中SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ IDNo.2所示的DNA片段上的所有CpG位点；(B3)RASGEF1C基因中SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ IDNo.3所示的DNA片段上的所有CpG位点；(B4)RASGEF1C基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ IDNo.3所示的DNA片段上的所有CpG位点；(B5)RASGEF1C基因中SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位点、SEQ IDNo.2所示的DNA片段上的所有CpG位点和SEQ ID No.3所示的DNA片段上的所有CpG位点；(B6)RASGEF1C基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段中的全部CpG位点或任意11个或任意10个或任意9个或任意8个或任意7个或任意6个或任意5个或任意4个或任意3个或任意2个或任意1个CpG位点；(B7)RASGEF1C基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上如下6项所示CpG位点的全部或任意5项或任意4项或任意3项或任意2项或任意1项：第1项：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第356
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357位所示CpG位点；第2项：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第402
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403位和第408
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409位所示CpG位点；第3项：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第425
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426位所示CpG位点；第4项：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第473
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474位所示CpG位点；第5项：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第558
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559位所示CpG位点；第6项：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5
’
端第601
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602位所示CpG位点。4.根据权利要求1
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3中任一所述的试剂盒，其特征在于：所述用于检测RASGEF1C基因甲基化水平的物质包含用于扩增RASGEF1C基因全长或部分片段的引物组合；进一步地，所述部分片段为如下中至少一个片段：
(g1)SEQ ID No.1所示的DNA片段或其包含的DNA片段；(g2)SEQ ID No.2所示的DNA片段或其包含的DNA片段；(g3)SEQ ID No.3所示的DNA片段或其包含的DNA片段；(g4)SEQ ID No.4所示的DNA片段或其包含的DNA片段；(g5)与SEQ ID No.1所示的DNA片段或其包含的DNA片段具有80％以上同一性的DNA片段；(g6)与SEQ ID No.2所示的DNA片段或其包含的DNA片段具有80％以上同一性的DNA片段；(g7)与SEQ ID No.3所示的DNA片段或其包含的DNA片段具有80％以上同一性的DNA片段；(g8)与SEQ ID No.4所示的DNA片段或其包含的DNA片段具有80％以上同一性的DNA片段；更进一步地，所述引物组合为引物对A和/或引物对B和/或引物对C和/或引物对D；所述引物对A为引物A1和引物A2组成的引物对；所述引物A1为SEQ ID No.5或SEQ ID No.5的第11
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35位核苷酸所示的单链DNA；所述引物A2为SEQ ID No.6或SEQ ID No.6的第32
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56位核苷酸所示的单链DNA；所述引物对B为引物B1和引物B2组成的引物对；所述引物B1为SEQ ID No.7或SEQ ID No.7的第11
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35位核苷酸所示的单链DNA；所述引物B2为SEQ ID No.8或SEQ ID No.8的第32
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56位核苷酸所示的单链DNA；所述引物对C为引物...

【专利技术属性】
技术研发人员：狄飞飞，王俊，
申请(专利权)人：南京腾辰生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：