分诊方法技术

本发明专利技术涉及指定遭受感染，特别是呼吸道感染的受试者的不良后果风险的方法。染的受试者的不良后果风险的方法。染的受试者的不良后果风险的方法。

【技术实现步骤摘要】
分诊方法


[0001]本专利技术涉及作为体液样品中的生物标志物而用于感染患者，特别是用于识别对感染产生不良反应的高风险患者的无细胞核小体。
[0002]专利技术背景流行性感冒每年爆发一次，遍及世界各地，导致大约三百万到五百万例严重疾病和大约290,000至650,000例死亡。近来，新的感染即COVID-19的出现和迅速发展已经升级为大流行状态。有些感染导致急性呼吸道综合征（ARS）或严重急性呼吸道综合征（SARS），这是需要药物治疗的潜在致命疾病进展。感染暴发和大流行令国际卫生保健服务(international health care services)极度紧张，因此对患者进行分诊以识别最有可能需要医院干预的那些人员的方法对于帮助医疗服务提供者(health care providers)确定患者的优先顺序、挽救生命和更有效地应对医疗服务的更高要求至关重要。
[0003]Holdenrieder等人, Int. J. Cancer (2001) 95: 114
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120先前描述了检测患有良性和恶性疾病的患者血清样品中的核小体水平。就其组蛋白修饰、组蛋白变体、DNA修饰和加合物含量而言，已经研究了循环无细胞核小体的表观遗传组成作为癌症中的基于血液的生物标志物，参见WO 2005/019826、WO 2013/030577、WO 2013/030579和WO 2013/084002。
[0004]在本领域中仍然需要提供简单的、成本有效的方法来识别和优先考虑在感染时可能预后不良的个体。
>[0005]附图概述图1. 取自两名健康志愿者的EDTA血浆和肝素血浆样品中的中性粒细胞胞外陷阱（NET）衍生核小体的免疫测定结果。该EDTA样品含有少量NET衍生核小体材料。相反，肝素诱导NET形成，并且肝素血浆样品含有高水平的诱导的NET衍生核小体。
[0006]图2. 取自两名健康志愿者的EDTA血浆和肝素血浆样品中的NET衍生核小体的生物分析仪电泳结果。该EDTA样品含有低水平的单核小体和NET衍生核小体材料。相反，肝素诱导NET形成，并且肝素血浆样品含有低水平的单核小体（在大约60秒处的峰），但含有高水平的诱导的NET衍生核小体（在大约110秒处的宽峰）。在大约43秒和大约110秒处的窄峰代表为参考目的而添加的DNA样品。
[0007]专利技术概述根据第一方面，提供了指定遭受感染的受试者的不良后果风险的方法，包括：（i）使获自该受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量无细胞核小体或其组分的水平；和（ii）利用检测到的无细胞核小体水平来指定所述受试者的不良后果可能性。
[0008]根据进一步的方面，提供了指定遭受感染的受试者中的医学并发症的发展或进展的风险的方法，包括：（i）使获自该受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量无细胞核小体或其组分的水平；和
（ii）利用检测到的无细胞核小体水平来指定所述受试者中医学并发症发展或进展的可能性。
[0009]根据进一步的方面，提供了选择需要用于感染的医学并发症的医学治疗的遭受感染的受试者的方法，包括：（i）使获自该受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量无细胞核小体或其组分的水平；和（ii）利用检测到的无细胞核小体水平来指示所述受试者中需要治疗的医学并发症的存在、进展或发展。
[0010]在优选实施方案中，该感染是呼吸道流行性感冒或冠状病毒感染，并且医学并发症是ARS或SARS或肺炎。因此，在一个实施方案中，提供了检测需要用于肺炎、ARS或SARS的医学治疗的受试者的方法，包括：（i）使获自该受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量无细胞核小体或其组分的水平；和（ii）利用无细胞核小体的水平作为该受试者需要用于肺炎、ARS或SARS的医学治疗的指标。
[0011]在优选实施方案中，该感染是呼吸道流行性感冒或冠状病毒感染，并且医学并发症是ARS或SARS或肺炎。
[0012]根据本专利技术的进一步的方面，提供了监测受试者中的感染的方法，包括：（i）使获自该受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量无细胞核小体或其组分的水平；（ii）重复对获自该受试者的体液样品中无细胞核小体或其组分的水平的检测或测量一次或多次；（iii）利用无细胞核小体或其组分的水平的任何变化来监测受试者中感染的进展。
[0013]专利技术详述核小体在细胞死亡时的染色质断裂时释放到循环中。许多感染，如病毒感染，通过多种机制（细胞结合和进入、胞内体TLR3激活和基因表达）引发细胞死亡，由此提高血液中循环核小体的数量（Danthi等人, Annu. Rev. Virol. (2016) 3: 533
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53）。此外，感染可以诱导NETosis，由此翻译后组蛋白修饰，如组蛋白H3和H4的超瓜氨酸化（Wang Y等人, J. Cell Biol. (2009)184(2): 205
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213），促进了染色质的去浓缩，其一起释放到循环中作为对感染的一线应答。但是，细胞外核小体和中性粒细胞胞外陷阱（NETs）如果没有被快速清除的话会导致严重的并发症。例如，核小体与肾小球膜结合与狼疮中的肾损伤有关（Kalaaji等人, Kidney Int. (2007) 71(7): 665-672），而NETs已经显示在病毒性肺炎过程中加剧了肺损伤（Ashar等人, Am. J. Pathol. (2018) 188(1): 135-148）。实际上，宿主定向（host directed）的NET毒性与呼吸窘迫、狭窄气道阻塞、上皮细胞损伤、炎症应答和血栓形成相关（Marcos等人, Nat. Med. (2010) 16: 1018
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23；Hoeksema等人, Future Microbiol. (2016) 11: 441
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53）。
[0014]大多数感染流行性感冒或冠状病毒的受试者均经历轻微的疾病。但是，一些人口亚组，包括年龄超过60岁的老年人和患有基础疾病如糖尿病、慢性肺病特别是慢性心脏疾病的人，处于包括ARS、SARS、肺炎和死亡的严重影响的风险中。流行性感冒或冠状病毒感染
导致包括肺炎的并发症的确切机制尚不清楚，但认为是由对病毒感染的超免疫反应引起的，其中过量的NETs造成肺的急性损伤，导致肺炎，并在最坏的情况下导致死亡。
[0015]本专利技术利用提高的无细胞核小体（包括NETs）水平来预测疾病的严重程度和传染病的后果。
[0016]因此，根据第一方面，提供了指定遭受感染的受试者的不良后果风险的方法，包括：（i）使获自该受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量无细胞核小体或其组分的水平；和（ii）利用检测到的无细胞核小体水平来指定所述受试者的不良后果可能性。
[0017]在一个实施方案中，提供了指定遭受感染的受试者的不良后果风险的方法，包括：（i）使获自该受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量中性粒细胞胞外陷阱材料或其组分的水平；和（ii）利用检测到的中性粒细胞胞外陷本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1. 结合剂在制备试剂盒中的用途，该试剂盒用于指定遭受感染的受试者的不良后果风险的方法，该方法包括：（i）使获自所述受试者的体液样品与结合剂接触以检测或测量无细胞核小体或其组分的水平；和（ii）利用检测到的无细胞核小体水平来指定所述受试者的不良后果可能性。2.如权利要求1中限定的用途，其中所述感染是病毒、细菌、真菌或微生物感染。3.如权利要求1或权利要求2中限定的用途，其中所述感染是呼吸道感染。4.如权利要求3中限定的用途，其中所述呼吸道感染选自：流行性感冒、肺炎和严重急性呼吸综合征（SARS）。5.如权利要求1至4任一项中限定的用途，其中所述体液样品是血液、血清或血浆样品。6.如权利要求1至5任一项中限定的用途，其中所述无细胞核小体是中性粒细胞胞外陷阱的一部分或衍生自中性粒细胞胞外陷阱。7.如权利要求1至6任一项中限定的用途，其中所述无细胞核小体的组分包含所述无细胞核小体的表观遗传特征。8.如权利要求7中限定的用途，其中所述表观遗传特征是组蛋白同种型，如核心核小体的组蛋白同种型，特别是组蛋白H3同种型。9.如权利要求8中限定的用途，其中所述组蛋白同种型是H3.1。10. 如权利要求7中限定的用途，其中所述表观遗传特征是组蛋白翻译后修饰（PTM），如核心核小体的组蛋白PTM，特别是组蛋白H3或H4 PTM。11.如权利要求10中限定的用途，其中所述组蛋白PTM选自瓜氨酸化或核糖基化。12.如权利要求1至11任一项中限定的用途，其中使用免疫测定、免疫化学、质谱、色谱、染色质免疫沉淀或生物传感器方法检测或测量无细胞核小体或其组分的水平。13.如权利要求1至12任一项中限定的用途，其中检测或测量的方法包括使体液样品与包含检测无细胞核小体或其组分的结合剂的固相接触，和检测与所述结合剂的结合。14.如权利要求1至1...

【专利技术属性】
技术研发人员：JV米卡莱夫，ME埃克莱斯顿，
申请(专利权)人：比利时意志有限责任公司，
类型：发明
国别省市：