治疗方法技术

本文提供了用于鉴定人淋巴细胞的肿瘤抗原以及用于鉴定癌症疗法的受试者的方法和组合物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】治疗方法相关申请的交叉引用本申请要求2018年10月29日提交的美国临时申请号62/752,288、2019年1月4日提交的美国临时申请号62/788,313以及2019年5月31日提交的美国临时申请号62/855,332的权益，所述临时申请各自的内容特此以引用的方式整体并入本文。
技术介绍
癌症的特征在于异常细胞的增殖。许多治疗包括昂贵且痛苦的外科手术和化学疗法。尽管对使用患者的自身免疫系统靶向癌性细胞的癌症疗法越来越感兴趣，但是此类疗法的成效有限。
技术实现思路
本专利技术的特征尤其是鉴定和/或选择用于起始、继续、修改和/或中止癌症疗法的癌症受试者的方法。因此，本公开的一个方面的特征是一种将受试者鉴定为癌症疗法的候选者的方法，所述方法包括：a)获得、提供或产生包含细菌细胞或珠粒的文库，所述细菌细胞或珠粒包含多种肿瘤抗原，其中所述文库的每个细菌细胞或珠粒包含不同的肿瘤抗原；b)使所述细菌细胞或珠粒与来自所述受试者的抗原呈递细胞(APC)接触，其中所述APC使所述细菌细胞或珠粒内化；c)在适于通过由一种或多种APC呈递的肿瘤抗原激活淋巴细胞的条件下，使所述APC与来自所述受试者的淋巴细胞接触；d)例如通过评估(例如，检测或测量)一种或多种免疫介质的表达和/或分泌水平(例如，相对于对照增加或降低的水平)来确定一种或多种淋巴细胞是被由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原激活还是对由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原没有应答；e)将一种或多种肿瘤抗原鉴定为刺激性抗原和/或抑制性抗原；以及f)产生代表所述受试者应答谱的刺激性抗原与抑制性抗原的数量的比率；以及g)将所述受试者应答谱与目标应答谱进行比较，以选择所述受试者作为用于起始、继续、修改、中止或不起始癌症疗法的候选受试者。在一些实施方案中，所述方法还包括通过包括以下的方法产生所述目标应答谱：h)使所述细菌细胞或珠粒与来自目标受试者的抗原呈递细胞(APC)接触，其中所述APC使所述细菌细胞或珠粒内化；i)在适于通过由一种或多种APC呈递的肿瘤抗原激活淋巴细胞的条件下，使所述APC与来自所述目标受试者的淋巴细胞接触；j)例如通过评估(例如，检测或测量)一种或多种免疫介质的表达和/或分泌水平(例如，相对于对照增加或降低的水平)来确定一种或多种淋巴细胞是被由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原激活还是对由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原没有应答；k)将一种或多种肿瘤抗原鉴定为刺激性抗原和/或抑制性抗原；以及l)产生代表所述目标应答谱的刺激性抗原与抑制性抗原的数量的比率。在一些实施方案中，所述目标应答谱来自表现出或先前表现出对癌症的至少一种有益应答的一个或多个目标受试者。在一些实施方案中，所述目标应答谱包括刺激性抗原的数量与抑制性抗原的数量的比率为至少100:1、50:1、20:1、10:1、5:1、2:1、1.5:1、1.4:1、1.2:1、1.1:1、0.9:1、0.8:1、0.7:1、0.6:1或0.5:1。在一些实施方案中，所述有益应答包括对癌症疗法或疗法组合的阳性临床应答。在一些实施方案中，所述有益应答包括对癌症的自发应答。在一些实施方案中，所述有益应答包括癌症的清除，例如与癌症的清除相关的一种或多种临床测量的水平。在一些实施方案中，所述有益应答包括例如在限定的时间段(例如，至少1周、2周、3周、4周、5周、6周、7周、8周、9周、10周、11周、12周，或至少1个月、2个月、3个月、4个月、5个月、6个月、7个月、8个月、9个月、10个月、11个月、12个月，或至少1年、2年、3年、4年、5年、6年、7年、8年、9年、10年、11年、12年)内不存在癌症的复发、重现和/或转移。在一些实施方案中，所述有益应答包括阳性癌症预后。在一些实施方案中，所述有益应答包括不存在对癌症疗法或疗法组合的一种或多种毒性应答和/或副作用(例如，一种或多种可测量的毒性应答和/或副作用)。在一些实施方案中，所述目标应答谱来自表现出或先前表现出对癌症的一种或多种有害和/或无益应答的一个或多个目标受试者。在一些实施方案中，所述目标应答谱包括刺激性抗原的数量与抑制性抗原的数量的比率小于5:1、2:1、1.5:1、1.4:1、1.2:1、1.1:1、0.9:1、0.8:1、0.7:1、0.6:1、0.5:1、0.25:1、0.125:1、0.01:1或0.001:1。在一些实施方案中，所述有害和/或无益应答包括对癌症疗法或疗法组合的阴性临床应答和/或未能应答。在一些实施方案中，所述有害和/或无益应答包括缺乏癌症的清除，例如与缺乏癌症的清除相关的一种或多种临床测量的水平。在一些实施方案中，所述有害和/或无益应答包括癌症的至少一种复发、重现和/或转移。在一些实施方案中，所述有害和/或无益应答包括阴性癌症预后。在一些实施方案中，所述有害和/或无益应答包括对癌症疗法或疗法组合的一种或多种毒性应答和/或副作用(例如，一种或多种可测量的毒性应答和/或副作用)。在一些实施方案中，所述方法还包括选择用于起始癌症疗法或癌症疗法组合的候选受试者。在一些实施方案中，所述方法还包括选择用于继续癌症疗法或癌症疗法组合的候选受试者。在一些实施方案中，所述方法还包括如果所述受试者应答谱包括刺激性抗原的数量与抑制性抗原的数量的比率为至少100:1、50:1、20:1、10:1、5:1、2:1、1.5:1、1.4:1、1.2:1、1.1:1、0.9:1、0.8:1、0.7:1、0.6:1或0.5:1，则选择所述受试者作为候选受试者。在一些实施方案中，所述方法还包括选择用于修改癌症疗法的候选受试者。在一些实施方案中，所述方法还包括选择用于中止或不起始癌症疗法的候选受试者。在一些实施方案中，所述方法还包括如果所述受试者应答谱包括刺激性抗原的数量与抑制性抗原的数量的比率小于5:1、2:1、1.5:1、1.4:1、1.2:1、1.1:1、0.9:1、0.8:1、0.7:1、0.6:1、0.5:1、0.25:1、0.125:1、0.01:1或0.001:1，则选择所述受试者作为用于修改、中止和/或不起始癌症疗法的候选受试者。在一些实施方案中，所述方法还包括向所述候选受试者施用所述癌症疗法或癌症疗法的组合。在一些实施方案中，所述方法还包括修改施用于所述候选受试者的癌症疗法。在一些实施方案中，所述方法还包括对所述候选受试者中止或不起始所述癌症疗法。本公开的另一个方面包括一种将受试者鉴定为癌症疗法的候选者的方法，所述方法包括：a)获得、提供或产生包含细菌细胞或珠粒的文库，所述细菌细胞或珠粒包含多种肿瘤抗原，其中所述文库的每个细菌细胞或珠粒包含不同的肿瘤抗原；b)使所述细菌细胞或珠粒与来自所述受试者的抗原呈递细胞(APC)接触，其中所述APC使所述细菌细胞或珠粒内化；c)在适于通过由一种或多种APC呈递的肿瘤抗原激活淋巴细胞的条件下，使所述APC与来自所述受试者的淋巴细胞接触；d)例如通过评估(例如，检测或测量)一种或多种免疫介质的表达和/或分泌水平(例如，相对于对照增加或降低的水平)来确定一种或多本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种将受试者鉴定为癌症疗法的候选者的方法，所述方法包括：/na)获得、提供或产生包含细菌细胞或珠粒的文库，所述细菌细胞或珠粒包含多种肿瘤抗原，其中所述文库的每个细菌细胞或珠粒包含不同的肿瘤抗原；/nb)使所述细菌细胞或珠粒与来自所述受试者的抗原呈递细胞(APC)接触，其中所述APC使所述细菌细胞或珠粒内化；/nc)在适于通过由一种或多种APC呈递的肿瘤抗原激活淋巴细胞的条件下，使所述APC与来自所述受试者的淋巴细胞接触；/nd)例如通过评估(例如，检测或测量)一种或多种免疫介质的表达和/或分泌水平(例如，相对于对照增加或降低的水平)来确定一种或多种淋巴细胞是被由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原激活还是对由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原没有应答；/ne)将一种或多种肿瘤抗原鉴定为刺激性抗原和/或抑制性抗原；以及/nf)产生代表所述受试者应答谱的刺激性抗原与抑制性抗原的数量的比率；以及/ng)将所述受试者应答谱与目标应答谱进行比较，以选择所述受试者作为用于起始、继续、修改、中止或不起始癌症疗法的候选受试者。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20181029 US 62/752,288;20190104 US 62/788,313;20191.一种将受试者鉴定为癌症疗法的候选者的方法，所述方法包括：
a)获得、提供或产生包含细菌细胞或珠粒的文库，所述细菌细胞或珠粒包含多种肿瘤抗原，其中所述文库的每个细菌细胞或珠粒包含不同的肿瘤抗原；
b)使所述细菌细胞或珠粒与来自所述受试者的抗原呈递细胞(APC)接触，其中所述APC使所述细菌细胞或珠粒内化；
c)在适于通过由一种或多种APC呈递的肿瘤抗原激活淋巴细胞的条件下，使所述APC与来自所述受试者的淋巴细胞接触；
d)例如通过评估(例如，检测或测量)一种或多种免疫介质的表达和/或分泌水平(例如，相对于对照增加或降低的水平)来确定一种或多种淋巴细胞是被由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原激活还是对由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原没有应答；
e)将一种或多种肿瘤抗原鉴定为刺激性抗原和/或抑制性抗原；以及
f)产生代表所述受试者应答谱的刺激性抗原与抑制性抗原的数量的比率；以及
g)将所述受试者应答谱与目标应答谱进行比较，以选择所述受试者作为用于起始、继续、修改、中止或不起始癌症疗法的候选受试者。


2.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括通过包括以下的方法产生所述目标应答谱：
h)使所述细菌细胞或珠粒与来自目标受试者的抗原呈递细胞(APC)接触，其中所述APC使所述细菌细胞或珠粒内化；
i)在适于通过由一种或多种APC呈递的肿瘤抗原激活淋巴细胞的条件下，使所述APC与来自所述目标受试者的淋巴细胞接触；
j)例如通过评估(例如，检测或测量)一种或多种免疫介质的表达和/或分泌水平(例如，相对于对照增加或降低的水平)来确定一种或多种淋巴细胞是被由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原激活还是对由一种或多种APC呈递的一种或多种肿瘤抗原没有应答；
k)将一种或多种肿瘤抗原鉴定为刺激性抗原和/或抑制性抗原；以及
l)产生代表所述目标应答谱的刺激性抗原与抑制性抗原的数量的比率。


3.如权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述目标应答谱来自表现出或先前表现出对癌症的至少一种有益应答的一个或多个目标受试者。


4.如权利要求3所述的方法，其中所述目标应答谱包括刺激性抗原的数量与抑制性抗原的数量的比率为至少100:1、50:1、20:1、10:1、5:1、2:1、1.5:1、1.4:1、1.2:1、1.1:1、0.9:1、0.8:1、0.7:1、0.6:1或0.5:1。


5.如权利要求3所述的方法，其中所述有益应答包括对癌症疗法或疗法组合的阳性临床应答。


6.如权利要求3所述的方法，其中所述有益应答包括对癌症的自发应答。


7.如权利要求3所述的方法，其中所述有益应答包括癌症的清除，例如与癌症的清除相关的一种或多种临床测量的水平。


8.如权利要求3所述的方法，其中所述有益应答包括例如在限定的时间段(例如，至少1周、2周、3周、4周、5周、6周、7周、8周、9周、10周、11周、12周，或至少1个月、2个月、3个月、4个月、5个月、6个月、7个月、8个月、9个月、10个月、11个月、12个月，或至少1年、2年、3年、4年、5年、6年、7年、8年、9年、10年、11年、12年)内不存在癌症的复发、重现和/或转移。


9.如权利要求3所述的方法，其中所述有益应答包括阳性癌症预后。


10.如权利要求3所述的方法，其中所述有益应答包括不存在对癌症疗法或疗法组合的一种或多种毒性应答和/或副作用(例如，一种或多种可测量的毒性应答和/或副作用)。


11.如权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述目标应答谱来自表现出或先前表现出对癌症的一种或多种有害和/或无益应答的一个或多个目标受试者。


12.如权利要求11所述的方法，其中所述目标应答谱包括刺激性抗原的数量与抑制性抗原的数量的比率小于5:1、2:1、1.5:1、1.4:1、1.2:1、1.1:10.9:1、0.8:1、0.7:1、0.6:1、0.5:1、0.25:1、0.125:1、0.01:1或0.001:1。


13.如权利要求11所述的方法，其中所述有害和/或无益应答包括对癌症疗法或疗法组合的阴性临床应答和/或未能应答。


14.如权利要求11所述的方法，其中所述有害和/或无益应答包括缺乏癌症的清除，例如与缺乏癌症的清除相关的一种或多种临床测量的水平。


15.如权利要求11所述的方法，其中所述有害和/或无益应答包括癌症的至...

【专利技术属性】
技术研发人员：J·B·弗利切纳，J·R·多布森，
申请(专利权)人：健诺西生物科学公司，
类型：发明
国别省市：美国;US