确定HBV基因的整合信息的方法和系统技术方案

本发明专利技术涉及一种确定HBV基因的整合信息的方法，包括：从感染HBV的肝细胞中提取至少一条染色质，所述至少一个染色质包含第一区域和第二区域，所述第一区域包含HBV核苷酸片段；检测所述第一区域和所述第二区域之间的交互频率；和，基于所述交互频率，分析HBV基因在肝细胞基因组中的整合信息。通过本发明专利技术，能够提供一种能够在早期评估不同基因型的HBV患者中发生肝细胞癌等病程进展的风险的方法、系统和计算机可读介质。可读介质。

【技术实现步骤摘要】
确定HBV基因的整合信息的方法和系统


[0001]本专利技术涉及HBV领域，特别涉及通过确定HBV基因的整合信息从而确定受试者中的医疗状况发生风险的领域。

技术介绍

[0002]乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus，HBV)感染，尤其是慢性HBV感染是全球最为重要的公共卫生问题之一(Dienstag JL.Hepatitis B Virus infection.N Engl J Med 2008；359(14)：1486-1500)。慢性HBV感染可导致慢性乙型病毒性肝炎(Chronic hepatitis B，CHB)、肝硬化(Liver cirrhosis，LC)和原发性肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma，HCC)等一系列肝脏疾病(Liaw YF，Chu CM.Hepatitis B virus infection.Lancet 2009；373(9663)：582-592)。据报道，目前全球约有超过3.5亿的慢性乙型肝炎病毒感染者，这些感染者最终死于HBV感染相关肝脏疾病的风险可达15％～25％，全球每本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种确定HBV基因的整合信息的方法，包括：从感染HBV的肝细胞中提取至少一条染色质，所述至少一个染色质包含第一区域和第二区域，所述第一区域包含HBV核苷酸片段；检测所述第一区域和所述第二区域之间的交互频率；和基于所述交互频率，分析HBV基因在肝细胞基因组中的整合信息。2.权利要求1的方法，其中，所述肝细胞是人肝细胞。3.权利要求1或2的方法，其中，所述第一区域和第二区域位于同一染色质。4.权利要求1或2的方法，其中，所述第一区域和第二区域位于不同染色质。5.权利要求1至4中任一项所述的方法，其中，所述整合信息包括HBV核苷酸片段的序列。6.权利要求1至5中任一项所述的方法，其中，所述整合信息包括与HBV核苷酸片段交互频率高于规定值的至少一个肝细胞核苷酸序列。7.权利要求1至6中任一项所述的方法，其中，所述整合信息包括与HBV核苷酸片段交互频率最高的肝细胞核苷酸序列。8.权利要求1至7中任一项所述的方法，其中，所述HBV是选自A型、B型、C型、D型、E型、F型、G型、H型中的任一种HBV亚型。9.权利要求1至8中任一项所述的方法，其中，所述方法还包括：基于所述整合信息，预测发生肝细胞癌的风险。10.一种确定HBV基因的整合信息的系统，包括：提取装置，用于从感染HBV的肝细胞中提取至少一条染色质，所述至少一个染色质包含第一区域和第二区域，所述第一区域包含HBV核苷酸片段；检测装置，用于检测所述第一区域和所述第二区域之间的交互频率；和分析装置，用于基于所述交互频率，分析HBV基因在肝细胞基因组中的整合信息。11.权利要求10的系统，其中，所述肝细胞是人肝细胞。12.权利要求10或11的系统，其中，所述第一区域和第二区域位于同一染色质。13.权利要求10或11的系统，其中，所述第一区域和第二区域位于不同染色质。14.权利要求10至13中任一项所述的系统，其中，所述整合信息包括HBV核苷酸片段的序列。15.权利要求10至14中任一项所述的系统，其中，所述整合信息包括与H...

【专利技术属性】
技术研发人员：瞿镕，
申请(专利权)人：中以海德人工智能药物研发股份有限公司，
类型：发明
国别省市：