【技术实现步骤摘要】
一种产假尿苷工程菌及其应用
本专利技术涉及生物
,具体涉及一种产假尿苷工程菌及其应用。
技术介绍
1957年,DAVIS等在核糖体RNA(ribosomalRNA,rRNA)和转运RNA(transferRNA,tRNA)中首次发现一种与尿嘧啶核苷天然结构类似的异构体,其核糖不与尿嘧啶(Uridine,U)N1相连,而与C5相连,形成假尿嘧啶核苷(Pseudouridine,PU)。(DAVISFF,ALLENFW.Ribonucleicacidsfromyeastwhichcontainafifthnucleotide[J].JBiolChem,1957,227(2):907-915.)尿苷通过假尿苷合酶从核糖糖碱基裂解并重新连接生成C-C糖苷键,异构化成假尿苷。尿嘧啶核苷与假尿嘧啶核苷化学结构式如式1所示。作为核苷尿苷的一种异构体,假尿苷存在于除信使RNA外的许多类RNA中,包括tRNA和rRNA。假尿苷是非编码RNA中含量最多的修饰核苷,通过稳定RNA结构来增强转移RNA和核糖体RNA的功能。假尿 ...
【技术保护点】
1.一种产假尿苷工程菌,其特征在于,利用基因工程技术在宿主菌中表达假尿苷合成相关的基因,得到可产假尿苷的基因工程菌。/n
【技术特征摘要】
1.一种产假尿苷工程菌,其特征在于,利用基因工程技术在宿主菌中表达假尿苷合成相关的基因,得到可产假尿苷的基因工程菌。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的宿主菌选自细菌、藻和真菌,优选为大肠杆菌,进一步,优选为大肠杆菌DH5α。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述假尿苷合成相关的基因为:腺苷酸激酶编码基因pumH、tRNA假尿苷合酶编码基因pumJ和HAD(卤代酸脱卤酶)蛋白家族水解酶编码基因pumD。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的编码基因pumH蛋白序列、编码基因pumJ蛋白序列和编码基因pumD蛋白序列均来源于链霉菌Streptomycessp.ID38640,分别为SEQIDNo.1所示的基因pumH蛋白序列、SEQIDNo.2所示的基因pumJ蛋白序列和SEQIDNo.3所示的基因pumD蛋白序列。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述的基因pumH、pumJ和pumD,其DNA序列均来源于链霉菌Streptomycessp.ID38640,序列分别如SEQIDNo.4所示的核苷酸序列、SEQIDNo.5所示的核苷酸序列和SEQIDNo.6所示的核苷酸序列。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的基因pumH、pumJ和pumD,其DNA序列按照大肠杆菌密码子偏好性进行优化,优化后的序列分别如SEQIDNo.7所示的核苷酸序列、SEQIDNo.8所示的核苷酸序列和SEQIDNo.9所示的核苷酸序列。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,包括对所述的密码子偏好性优化后的基因pumH、pumJ和pumD进行修饰,具体为pumH密码子优化后的核酸序列在起始密码子前连接启动子Ptrp序列,pumJ和pumD密码子优化后的核酸序列在起始密码子前连接RBS序列aaaggaggatatacat,修饰后序列分别如SEQIDNo.10所示的核苷酸序列、SEQIDNo.11所示的核苷酸序列和SEQIDNo.12所示的核苷酸序列。
8.根据权利要求1~7之一所述的产假尿苷工程菌的构建方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)pu...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈伟,郑玲辉,廖云娥,周敏,王雪峰,朱进伟,高祥,陈世敏,彭湘屏,石磊,
申请(专利权)人:浙江珲达生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:浙江;33
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