【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】分离核酸的方法和试剂盒相关申请的交叉引用本申请根据35U.S.C.§119(e)要求均于2018年1月8日提交的美国专利申请序列号62/614,691和62/614,692的优先权权益。先前申请的公开内容被认为是本申请的一部分,并且通过引用整体并入本申请的公开内容中。
技术介绍
本专利技术总体上涉及用于从含有靶核酸和非靶核酸的宫颈内样品中分离靶核酸的方法和试剂盒,并且更具体地涉及对胎儿核酸的分析。背景信息DNA分离是分子生物学中已确立的方法。在此方法的过程中,细胞以整体被裂解并且DNA与基质结合,或者使用在有机和无机溶剂中不同的溶解度以去除细胞物质,例如蛋白质和干净DNA样品中不需要的其他组分。在某些情况下,外来DNA和/或不需要的DNA(例如,病毒/细菌/无细胞DNA)可与靶细胞共存。这种DNA可以进入或粘附在靶细胞群上,从而干扰基于下游DNA的分析,例如PCR、测序以及全基因组扩增。如果要分析的靶DNA存在于污染性DNA宿主以及目的细胞类型二者中,这特别具有挑战性。这种情况要求靶DNA具 ...
【技术保护点】
1.一种从细胞样品中分离靶核酸的方法,其包括:/na)在DNA结合膜或DNA结合基质上将所述细胞与含有至少一种酶的蛋白质混合物一起孵育以释出细胞核;/nb)洗涤所述DNA结合膜或所述DNA结合基质以去除非靶核酸;/nc)裂解所述细胞核以释放所述靶核酸;并且/nd)分离所述靶核酸。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20180108 US 62/614,691;20180108 US 62/614,6921.一种从细胞样品中分离靶核酸的方法,其包括:
a)在DNA结合膜或DNA结合基质上将所述细胞与含有至少一种酶的蛋白质混合物一起孵育以释出细胞核;
b)洗涤所述DNA结合膜或所述DNA结合基质以去除非靶核酸;
c)裂解所述细胞核以释放所述靶核酸;并且
d)分离所述靶核酸。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述靶核酸是胎儿核酸。
3.根据权利要求1所述的方法,其中非靶核酸是母体核酸、病毒核酸、微生物核酸、无细胞DNA或其组合。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述细胞是人的。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述细胞是母体细胞和/或胎儿细胞。
6.根据权利要求1所述的方法,其中样品是宫颈内样品。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述宫颈内样品包含非靶核酸、母体细胞以及胎儿细胞。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述样品包含约1-10个细胞、10-25个细胞、25-50个细胞、50-100个细胞、100-250个细胞、25-500个细胞、500-750个细胞、750-1000个细胞、1000-2500个细胞或2500-5000个细胞。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述蛋白质混合物包含消化细胞壁的蛋白酶。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述蛋白酶是胃蛋白酶。
11.根据权利要求1所述的方法,其中在非DNA结合条件下将所述细胞与所述蛋白质混合物一起孵育。
12.根据权利要求1所述的方法,其中裂解所述细胞核包括将所述细胞与裂解缓冲液一起孵育。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述裂解缓冲液可以是酶促的或非酶促的。
14.根据权利要求12所述的方法,其中所述裂解缓冲液包含蛋白酶K和/或胰蛋白酶。
15.根据权利要求1所述的方法,其中靶核酸结合至所述DNA结合膜或所述DNA结合基质。
16.根据权利要求1所述的方法,其中分离所述靶核酸包括从所述DNA结合膜或所述DNA结合基质洗脱所述核酸。
17.根据权利要求1所述的方法,其中所分离的靶核酸的非靶核酸污染少于约1%、2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%或少于约50%。
18.根据权利要求1所述的方法,其还包括通过DNA测序、PCR或全基因组扩增对所分离的靶核酸进行分析。
19.一种分析来自宫颈内样品的胎儿核酸的方法,其包括:
a)从所述宫颈内样品中分离胎儿细胞;
b)在DNA结合膜或DNA结合基质上将所述胎儿细胞与蛋白质混合物一起孵育以释出细胞核;
c)洗涤所述DNA结合膜或所述DNA结合基质以去除非靶核酸;
d)裂解所述细胞核以释放所述胎儿核酸;并且
e)分...
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