一种新的多肽——锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57和编码这种多肽的多核苷酸制造技术

技术编号:2598989 阅读:149 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了一种新的多肽-锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57,编码此多肽的多核苷酸和经DNA重组技术产生这种多肽的方法。本发明专利技术还公开了此多肽用于治疗多种疾病的方法,如各种肿瘤,神经系统疾病,血液性恶性疾病,发育紊乱症,HIV感染等。本发明专利技术还公开了抗此多肽的拮抗剂及其治疗作用。本发明专利技术还公开了编码这种新的锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57的多核苷酸的用途。(*该技术在2020年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物
,具体地说,本专利技术描述了一种新的多肽——锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本专利技术还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。锌指蛋白为生物体内编码锌离子介导的核苷酸结合蛋白多基因家族中的成员,其在生物体内具有十分重要的生理学功能,参与调控各种基因在生物体内的转录与表达。研究发现,锌指蛋白按其锌指结构的不同主要分为以下几种不同的类型C2H2构型、C2C2构型、CCCH构型、CCHC构型、C3H构型、C3HC4构型(DaiKS et al.,1998)。人们已从酵母、果蝇、鼠及人等多种生物体中分离得到了各种不同构型的锌指蛋白,其中含C2H2构型的锌指蛋白构成人类基因组中分布最广的一类基因,在生物体内参与调控多种负生长因子的转录与表达,其通常在胚胎发育及生殖细胞的发育过程中起重要的调控作用。C2H2型锌指蛋白家族的成员按其蛋白结构的不同还可分为不同的蛋白家族,如C2H2型锌指蛋白Kruppel家族即是其中的一类。所有的锌指蛋白Kruppel家族的成员氨基酸序列中均含有28-30个氨基酸长的保守的指重复序列(F/Y)XCXXCXXXFXXXXXLXXHXXXHTGEKP,其中一些特定的氨基酸残基位点为高度保守的。这一序列在很多不同的锌指蛋白中均含有多个拷贝,其拷贝数不同(锌指个数不同)则功能也不同。研究发现,许多锌指蛋白Kruppel家族成员的锌指结构域相互连接区域也是高度保守的,这一区域通常含有下列序列His-Thr-Gly-Gly-Lys-Pro-(Tyr,Phe)-X-Cys,其中组氨酸与半胱氨酸为金属离子的结合位点,而X为可变氨基酸残基。这一区域对于锌指结构的形成是必需的,指结构的数量将直接影响锌指蛋白与不同长度的DNA结合,且多指结构与复合物的结合稳定性有关。对C2H2型锌指蛋白Kruppel家族的成员进行研究发现,该蛋白家族的成员按其构型的不同还可分为不同的蛋白亚家族,如该蛋白家族的成员中约有三分之一的成员其蛋白序列的N末端含有KRAB盒结构,这些蛋白即构成了一独立的蛋白亚家族----Kruppel锌指蛋白KRAB亚家族。近年,人们又发现,锌指蛋白Kruppel家族中约有8个成员的蛋白序列中不含有KRAB盒结构,却在其蛋白序列的C末端含有保守的SCAN盒结构,这些蛋白构成了一新的锌指蛋白亚家族----Kruppel锌指蛋白SCAN亚家族。该蛋白亚家族的成员与KRAB蛋白亚家族的成员相似,在生物体内作为一种转录抑制子调控着相关组织基因的转录与表达,其突变或表达异常,亦与生物体内各种相关的发育及代谢紊乱型疾病的发生密切相关。1997年,Lee等人从人中克隆得到了三个新的锌指蛋白Kruppel家族的成员ZNF165、ZNF193及ZNF192,这三个锌指蛋白与已知的锌指蛋白家族的成员不同,其蛋白序列中不含有KRAB等锌指蛋白亚家族的特征性序列片段,但其氨基酸序列的C末端含有一保守的SCAN盒结构。研究发现,在锌指蛋白Kruppel家族中还有另外五个成员亦具有相似的结构特征,它们构成了一独立的锌指蛋白亚家族,即Kruppel型锌指蛋白SCAN亚家族。该亚家族中的成员在生物体内亦作为一种转录抑制因子调控着相关组织基因的转录与表达。该蛋白家族中的成员在人的各种组织中均有表达,但在成人的睾丸及卵巢组织中高表达,它们很可能在生殖细胞发育及胚胎早期发育过程中起重要的调控作用,其突变或表达异常通常与一些生殖系统发育紊乱性疾病、胚胎发育紊乱症、相关组织的肿瘤及癌症等疾病的发生密切相关。本专利技术的人的基因与已知人锌指蛋白ZFP192在蛋白水平上有41%的同一性和57%的相似性,且与ZFP192相似,其蛋白序列的C末端亦含有锌指蛋白SCAN亚家族的特征性结构域---SCAN结构域及C2H2型锌指蛋白Kruppel家族的特征性结构域---C2H2型锌指结构域。基于以上各点,故认为本专利技术的新基因为人锌指蛋白SCAN亚家族中的新成员,命名为锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57。并以此推断其与ZFP192相似,同为Kruppel锌指蛋白SCAN亚家族中的成员,并具有相似的生物学功能。该蛋白在生物体的各种组织均有表达,而在生殖系统细胞中表达量较高,该蛋白的突变或表达异常通常与生物体内一些生殖系统及早期胚胎发育紊乱性疾病、相关组织的肿瘤及癌症等疾病的发生密切相关。其还可用于诊断及治疗上述各种疾病。命名锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57由于如上所述锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用,而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白,因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57蛋白,特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾病诊断和/或治疗药的基础,因此分离其编码DNA是非常重要的。本专利技术的一个目的是提供分离的新的多肽——锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57以及其片段、类似物和衍生物。本专利技术的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。本专利技术的另一个目的是提供含有编码锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57的多核苷酸的重组载体。本专利技术的另一个目的是提供含有编码锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。本专利技术的另一个目的是提供生产锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57的方法。本专利技术的另一个目的是提供针对本专利技术的多肽——锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57的抗体。本专利技术的另一个目的是提供了针对本专利技术多肽——锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。本专利技术的另一个目的是提供诊断治疗与锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57异常相关的疾病的方法。本专利技术涉及一种分离的多肽,该多肽是人源的,它包含具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO:2氨基酸序列的多肽。本专利技术还涉及一种分离的多核苷酸,它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸;(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸;(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70%相同性的多核苷酸。更佳地,该多核苷酸的序列是选自下组的一种(a)具有SEQ ID NO:1中131-1687位的序列;和(b)具有SEQ ID NO:1中1-3752位的序列。本专利技术另外涉及一种含有本专利技术多核苷酸的载体,特别是表达载体;一种用该载体遗传工程化的宿主细胞,包括转化、转导或转染的宿主细胞;一种包括培养所述宿主细胞和回收表达产物的制备本专利技术多肽的方法。本专利技术还涉及一种能与本专利技术多肽特异性结合的抗体。本专利技术还涉及一种筛选的模拟、激活、拮抗或抑制锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57蛋白活性的化合物的方法,其包括利用本专利技术的多肽。本专利技术还涉及用该方法获得的化合物。本专利技术还涉及一种体外检测与锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57蛋白异常表达相关的疾病或疾病易感性的方法,包括检测生物样品中所述多肽或其编码多核苷酸序列中的突变,或者检测生物样品中本专利技术多肽的量或生物活性。本专利技术也涉本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种分离的多肽-锌指蛋白SCAN亚家族蛋白57,其特征在于它包含有:SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列的多肽、或其多肽的活性片段、类似物或衍生物。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:毛裕民谢毅
申请(专利权)人:上海博德基因开发有限公司
类型:发明
国别省市:31[中国|上海]

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