弥漫性大B细胞淋巴瘤分子分型试剂盒及分型装置制造方法及图纸

技术编号:25513586 阅读:77 留言:0更新日期:2020-09-04 17:06
本发明专利技术公开了一种弥漫性大B细胞淋巴瘤分子分型试剂盒及分型装置,属于癌症诊断和分子生物学领域。本发明专利技术的试剂盒和分型装置,通过检测CCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因等基因的表达量进行分型,为进一步完善、改进弥漫性大B细胞淋巴瘤分型诊断提供了新的工具,应用前景良好。

【技术实现步骤摘要】
弥漫性大B细胞淋巴瘤分子分型试剂盒及分型装置
本专利技术涉及癌症诊断和分子生物学领域。
技术介绍
中国癌症统计数据显示(ChenW,ZhengR,BaadePD,etal.CancerstatisticsinChina,2015.CaCancerJClin,2016,66(2):115-132.),2015年我国淋巴瘤新病例数达到约8.82万人,在常见恶性肿瘤中排第10。淋巴瘤根据瘤细胞可分为非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkinlymphoma,NHL)和霍奇金淋巴瘤(Hodgkinlymphoma,HLHL)两类。NHL发病率远高于HL,是HL的5倍左右,约占总人群肿瘤病例的3%。在过去的几十年中,国际癌症研究中心资料显示:NHL发病率持续升高而HL发病率有所下降。弥漫性大B细胞淋巴瘤(DiffuseLargeB-CellLymphoma,DLBCL)是目前最常见的非霍奇金淋巴瘤,约占30%~40%,且新发病率有逐年增加的趋势。2008年WHO分类将弥漫性大B细胞淋巴瘤定义为:大的肿瘤性B淋巴细胞呈弥漫性生长,肿瘤细胞的核与正常组织细胞的核相近或大于组织细胞的核,细胞大小不小于正常淋巴细胞的两倍。根据肿瘤细胞起源不同,可将弥漫性大B细胞淋巴分为两种分子亚型:一种称为生发中心B细胞样DLBCL(germinalcenterBcell-likeDLBCL,GCB型),此亚型因与正常生发中心B细胞表达的基因标志相同而得名;另一种亚型称为活化B细胞样DLBCL(activatedBcell-likeDLBCL,ABC型),此亚型表达的基因型与促有丝分裂刺激后外周血B细胞相似。研究发现,DLBCL分子亚型是独立于临床参数的预后评价指标,联合化疗CHOP方案对于各亚型的疗效存在显著差别,其中,ABC型和GCB型的5年生存率分别为31%和59%,GCB型的5年生存率明显好于ABC型。因此,快速、准确地检测确认弥漫性大B细胞淋巴瘤的分子分型,对患者治疗方案的确定以及预后都非常重要。全基因组表达谱分型是DLBCL分子分型的金标准,由于其要求新鲜肿瘤组织,需同时检测成千上万个基因的表达,存在实验技术复杂、对样本要求高、费用昂贵、操作过程复杂、对操作人员要求高等一系列的问题,严重限制了其在临床上的使用,无法广泛应用于广大的分子病理实验室。目前临床上较多常用免疫组化方法检测CD10、BCL6和IRF4三种抗体进行DLBCL分子分型。由于采用的抗体数量较少,该方法无法准确区分ABC型和GCB型。与基因表达谱分析结果比较,符合率约为70%,在实际临床应用中存在检出率低、灵敏度低、结果重复性差等问题。
技术实现思路
本专利技术要解决的问题是:提供检出率高、灵敏度高、结果重复性好的弥漫性大B细胞淋巴瘤分子分型工具,包括试剂盒和分型装置。本专利技术的技术方案如下:一种弥漫性大B淋巴瘤分子分型试剂盒,它包括检测如下20个基因中的一个或多个基因的表达水平的试剂:CCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因。如前述的分型试剂盒,它还包括检测如下10个基因中的一个或多个基因的表达水平的试剂:AICDA基因、BATF基因、BLNK基因、IGHM基因、SH3BP5基因、BCL6基因、LMO2基因、LRMP基因、MME基因、MYBL1基因。如前述的分型试剂盒,所述试剂为检测所述基因转录的RNA的量的试剂;优选的,为高通量测序试剂、基因芯片试剂或定量PCR试剂。如前述的分型试剂盒,所述试剂为检测所述基因表达蛋白的量的试剂;进一步的,所述试剂为抗体、抗体片段、亲和蛋白或核酸适配体。检测如下20个基因中任意一个或多个基因的表达水平的相关试剂在制备弥漫性大B淋巴瘤分子分型试剂盒中的用途:CCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因。如前述的用途,所述试剂盒还包括检测如下10个基因中的一个或多个基因的表达水平的试剂:AICDA基因、BATF基因、BLNK基因、IGHM基因、SH3BP5基因、BCL6基因、LMO2基因、LRMP基因、MME基因、MYBL1基因。如前述的用途,所述试剂为检测所述基因转录的RNA的量的试剂。如前述的用途,所述试剂为检测所述基因表达蛋白的量的试剂,进一步的,所述试剂为抗体、抗体片段、亲和蛋白或核酸适配体。一种弥漫性大B淋巴瘤分子分型装置,它包括:1)检测如下20个基因中1个或多个基因的表达水平的检测装置(例如:测序装置、基因芯片检测装置、qPCR检测装置等能检测基因表达水平的各种装置):CCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因;2)分析基因表达模式的分析装置;所述分析装置内置数据输入端口,用于接收前述检测装置的检测结果;所述分析装置内置了由机器学习算法构建的统计分析模型,用于判别弥漫性大B细胞淋巴瘤亚型。如前述的分型装置,它还包括检测如下10个基因中一个或多个基因的转录产物或翻译产物含量的检测装置:AICDA基因、BATF基因、BLNK基因、IGHM基因、SH3BP5基因、BCL6基因、LMO2基因、LRMP基因、MME基因、MYBL1基因。如前述的分型装置,所述机器学习算法为向量机、加权投票、K-最临近值、随机森林或相关性系数算法;优选的,为向量机算法。检测如下20个基因中任意一个或多个基因的表达水平的检测装置在制备弥漫性大B淋巴瘤分子分型装置中的用途:CCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因;所述分型装置还包括分析基因表达模式的分析装置;所述分析装置内置数据输入端口,用于接收前述检测装置的检测结果;所述分析装置内置了由机器学习算法本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种弥漫性大B淋巴瘤分子分型试剂盒,其特征在于:它包括检测如下20个基因中的一个或多个基因的表达水平的试剂:/nCCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因。/n

【技术特征摘要】
1.一种弥漫性大B淋巴瘤分子分型试剂盒,其特征在于:它包括检测如下20个基因中的一个或多个基因的表达水平的试剂:
CCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因。


2.如权利要求1所述的分型试剂盒,其特征在于:它还包括检测如下10个基因中的一个或多个基因的表达水平的试剂:
AICDA基因、BATF基因、BLNK基因、IGHM基因、SH3BP5基因、BCL6基因、LMO2基因、LRMP基因、MME基因、MYBL1基因。


3.如权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂为检测所述基因转录的RNA的量的试剂;优选的,为高通量测序试剂、基因芯片试剂或定量PCR试剂;
或,所述试剂为检测所述基因表达蛋白的量的试剂;进一步的,所述试剂为抗体、抗体片段、亲和蛋白或核酸适配体。


4.检测如下20基因中任意一个或多个基因的表达水平的相关试剂在制备弥漫性大B淋巴瘤分子分型试剂盒中的用途:
CCL22基因、DOCK10基因、FAM129C基因、FCMR基因、GPR183基因、JADE3基因、MIR155HG基因、MPEG1基因、NLRP7基因、P2RX5基因、TOX2基因、CD83基因、CILP基因、CR2基因、HOPX基因、RGCC基因、STAG3基因、TUBB2A基因、UCHL1基因和VPREB3基因。


5.如权利要求4所述的用途,其特征在于:所述试剂盒还包括检测如下10个基因中的一个或多个基因的表达水平的试剂:
AICDA基因、BATF基因、BLNK基因、IGHM基因、SH3BP5基因、BCL6基因、LMO2基因、LRMP基因、MME基因、MYBL1基因。


6.如权利要求4或5所述的用途,其特征在于:所述试剂为检测所述基因转录的RNA的量的试剂;优选的,为高通量测序试剂、基因芯片试剂或定量PCR试剂;
或,所述试剂为检测所述基因表达蛋白的量的试剂,进一步的,所述试剂为抗体、抗体片段、亲和蛋白或核酸适配体。
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【专利技术属性】
技术研发人员:徐清华孙益丰陈金影沃一昕罗正志王宏莹宋凯斌吴益旺胡林义
申请(专利权)人:杭州可帮基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:浙江;33

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