【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】靶向共同抗原的抗原结合蛋白相关申请的交叉引用本申请要求于2017年8月18日提交的美国临时申请第62/547,146号,和于2017年11月3日提交的美国临时申请第62/581,368号的权益,所述申请出于所有目的通过引用整体并入本文。序列表本申请含已经以ASCII格式电子提交的序列表,所述序列表通过引用整体并入本文。所述ASCII副本创建于2018年8月16日,名称为40698PCT_CRF_sequencelisting.txt,大小为1,591,443字节。
技术介绍
为了提供针对病原体的抗原特异性保护,免疫系统采用两种类型的免疫应答,即体液免疫应答和细胞免疫应答,它们分别通过B淋巴细胞和T淋巴细胞对病原体抗原进行特异性识别。由于T淋巴细胞是细胞免疫的抗原特异性效应子,因此T淋巴细胞在人体防御细胞内病原体(如病毒、细胞内细菌、支原体和细胞内寄生虫)介导的疾病中起着核心作用,T淋巴细胞通过直接细胞溶解被这类病原体感染的细胞来起作用。T淋巴细胞应答的特异性由T细胞受体(TCR)赋予并由其激活。T细胞受体是无性繁殖系地分布在个体T淋巴细胞上的抗原特异性受体,其抗原特异性库是经由体细胞基因重排机制产生的,类似于涉及产生抗体基因库的机制。T细胞受体包含跨膜分子的异二聚体,其主要类型由α-β多肽二聚体和γ-δ多肽二聚体的较小子集构成。T淋巴细胞受体亚单位包括在胞外结构域中类似于免疫球蛋白的可变和恒定区、具有促进α和β链配对的半胱氨酸的短铰链区、跨膜以及短胞质区。TCR触发的信号转导是通过CD3-ζ间接介导的,CD ...
【技术保护点】
1.一种分离的抗原结合蛋白(ABP),其与人白细胞抗原(HLA)-肽靶标特异性结合,其中所述HLA-肽靶标包括与HLA I类分子复合的HLA-限制性肽,其中所述HLA-限制性肽位于所述HLA I类分子的α1/α2异二聚体部分的肽结合槽中,并且其中:/na.所述HLA I类分子是HLA亚型A*02:01,并且所述HLA-限制性肽由序列LLASSILCA组成,/nb.所述HLA I类分子是HLA亚型A*01:01,并且所述HLA-限制性肽由序列EVDPIGHLY组成,/nc.所述HLA I类分子是HLA亚型B*44:02,并且所述HLA-限制性肽由序列GEMSSNSTAL组成,/nd.所述HLA I类分子是HLA亚型A*02:01,并且所述HLA-限制性肽由序列GVYDGEEHSV组成,/ne.所述HLA I类分子是HLA亚型*01:01,并且所述HLA-限制性肽由序列EVDPIGHVY组成,或者/nf.所述HLA I类分子是HLA亚型HLA-A*01:01,并且所述HLA-限制性肽由序列NTDNNLAVY组成。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170818 US 62/547,146;20171103 US 62/581,3681.一种分离的抗原结合蛋白(ABP),其与人白细胞抗原(HLA)-肽靶标特异性结合,其中所述HLA-肽靶标包括与HLAI类分子复合的HLA-限制性肽,其中所述HLA-限制性肽位于所述HLAI类分子的α1/α2异二聚体部分的肽结合槽中,并且其中:
a.所述HLAI类分子是HLA亚型A*02:01,并且所述HLA-限制性肽由序列LLASSILCA组成,
b.所述HLAI类分子是HLA亚型A*01:01,并且所述HLA-限制性肽由序列EVDPIGHLY组成,
c.所述HLAI类分子是HLA亚型B*44:02,并且所述HLA-限制性肽由序列GEMSSNSTAL组成,
d.所述HLAI类分子是HLA亚型A*02:01,并且所述HLA-限制性肽由序列GVYDGEEHSV组成,
e.所述HLAI类分子是HLA亚型*01:01,并且所述HLA-限制性肽由序列EVDPIGHVY组成,或者
f.所述HLAI类分子是HLA亚型HLA-A*01:01,并且所述HLA-限制性肽由序列NTDNNLAVY组成。
2.根据权利要求1所述的分离的ABP,其中所述HLA-限制性肽的长度在约5至15个氨基酸之间。
3.根据权利要求2所述的分离的ABP,其中所述HLA-限制性肽的长度在约8至12个氨基酸之间。
4.根据前述权利要求中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括抗体或其抗原结合片段。
5.根据权利要求4所述的分离的ABP,其中所述HLAI类分子是HLA亚型A*02:01,并且所述HLA-限制性肽包括序列LLASSILCA。
6.根据权利要求5所述的分离的ABP,其中所述ABP包括CDR-H3,所述CDR-H3包括SEQIDNO:3025-3032中的任一个所示的序列。
7.根据权利要求5或6所述的分离的ABP,其中所述ABP包括CDR-L3,所述CDR-L3包括SEQIDNO:3043-3050中的任一个所示的序列。
8.根据权利要求5至7中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自scFv的CDR-H3和CDR-L3,所述scFv命名为G7R3-P1C6、G7R3-P1G10、1-G7R3-P1B4、2-G7R4-P2C2、3-G7R4-P1A3、4-G7R4-B5-P2E9、5-G7R4-B10-P1F8或B7(G7R3-P3A9)。
9.根据权利要求5至8中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自scFv的所有三个重链CDR和所有三个轻链CDR,所述scFv命名为G7R3-P1C6、G7R3-P1G10、1-G7R3-P1B4、2-G7R4-P2C2、3-G7R4-P1A3、4-G7R4-B5-P2E9、5-G7R4-B10-P1F8或B7(G7R3-P3A9)。
10.根据权利要求5至9中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括选自SEQIDNO:2994-3001的VH序列。
11.根据权利要求5至10中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括选自3002-3009的VL序列。
12.根据权利要求5至11中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自scFv的VH序列和VL序列,所述scFv命名为G7R3-P1C6、G7R3-P1G10、1-G7R3-P1B4、2-G7R4-P2C2、3-G7R4-P1A3、4-G7R4-B5-P2E9、
5-G7R4-B10-P1F8或B7(G7R3-P3A9)。
13.根据权利要求5至12中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP经由所述限制性肽LLASSILCA的残基1-5中的任何一个或多个与所述HLA-肽靶标结合。
14.根据权利要求4所述的分离的ABP,其中所述HLAI类分子是HLA亚型HLA-A*01:01,并且所述HLA-限制性肽包括序列NTDNNLAVY。
15.根据权利要求14所述的分离的ABP,其中所述ABP包括CDR-H3,所述CDR-H3包括SEQIDNO:2902-2933中的任一个所示的序列。
16.根据权利要求14或15所述的分离的ABP,其中所述ABP包括CDR-L3,所述CDR-L3包括SEQIDNO:2971-2993中的任一个所示的序列。
17.根据权利要求14至16中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自scFv的CDR-H3和CDR-L3,所述scFv命名为G2-P2E07、G2-P2E03、G2-P2A11、G2-P2C06、G2-P1G01、G2-P1C02、G2-P1H01、G2-P1B12、G2-P1B06、G2-P2H10、G2-P1H10、G2-P2C11、G2-P1C09、G2-P1A10、G2-P1B10、G2-P1D07、G2-P1E05、G2-P1D03、G2-P1G12、G2-P2H11、G2-P1C03、G2-P1G07、G2-P1F12、G2-P1G03、G2-P2B08、G2-P2A10、G2-P2D04、G2-P1C06、G2-P2A09、G2-P1B08、G2-P1E03、G2-P2A03、G2-P2F01、G2-P1H11或G2-P1D06。
18.根据权利要求14至17中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自scFv的所有三个重链CDR和所有三个轻链CDR,所述scFv命名为G2-P2E07、G2-P2E03、G2-P2A11、G2-P2C06、G2-P1G01、G2-P1C02、G2-P1H01、G2-P1B12、G2-P1B06、G2-P2H10、G2-P1H10、G2-P2C11、G2-P1C09、G2-P1A10、G2-P1B10、G2-P1D07、G2-P1E05、G2-P1D03、G2-P1G12、G2-P2H11、G2-P1C03、G2-P1G07、G2-P1F12、G2-P1G03、G2-P2B08、G2-P2A10、G2-P2D04、G2-P1C06、G2-P2A09、G2-P1B08、G2-P1E03、G2-P2A03、G2-P2F01、G2-P1H11或G2-P1D06。
19.根据权利要求14至18中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括选自2781-2815的VH序列。
20.根据权利要求14至19中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括选自2816-2850的VL序列。
21.根据权利要求14至20中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自scFv的VH序列和VL序列,所述scFv命名为G2-P2E07、G2-P2E03、G2-P2A11、G2-P2C06、G2-P1G01、G2-P1C02、G2-P1H01、G2-P1B12、G2-P1B06、G2-P2H10、G2-P1H10、G2-P2C11、G2-P1C09、G2-P1A10、G2-P1B10、G2-P1D07、G2-P1E05、G2-P1D03、G2-P1G12、G2-P2H11、G2-P1C03、G2-P1G07、G2-P1F12、G2-P1G03、G2-P2B08、G2-P2A10、G2-P2D04、G2-P1C06、G2-P2A09、G2-P1B08、G2-P1E03、G2-P2A03、G2-P2F01、G2-P1H11或G2-P1D06。
22.根据权利要求14至21中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP经由所述限制性肽NTDNNLAVY的残基6-9和HLA亚型等位基因A*0101的残基157-160与所述HLA-肽靶标结合。
23.根据权利要求14至22中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP经由所述限制性肽NTDNNLAVY的残基3-8与所述HLA-肽靶标结合。
24.根据权利要求1至4中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分。
25.根据权利要求24所述的抗原结合蛋白,其中所述TCR或其抗原结合部分包括TCR可变区。
26.根据权利要求24或25所述的抗原结合蛋白,其中所述TCR或其抗原结合部分包括一个或多个TCR互补决定区(CDR)。
27.根据权利要求24至26中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述TCR包括α链和β链。
28.根据权利要求24至27中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述TCR包括γ链和δ链。
29.根据上述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白是嵌合抗原受体(CAR)的一部分,其包括:包括抗原结合蛋白的胞外部分;和胞内信号传导结构域。
30.根据权利要求29所述的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白包括scFv,并且所述胞内信号传导结构域包括ITAM。
31.根据权利要求29或30所述的抗原结合蛋白,其中所述胞内信号传导结构域包括CD3-ζ(CD3)链的ζ链的信号传导结构域。
32.根据权利要求29至31中任一项所述的抗原结合蛋白,其进一步包括连接所述胞外结构域和所述胞内信号传导结构域的跨膜结构域。
33.根据权利要求32所述的抗原结合蛋白,其中所述跨膜结构域包括CD28的跨膜部分。
34.根据权利要求29至33中任一项所述的抗原结合蛋白,其进一步包括T细胞共刺激分子的胞内信号传导结构域。
35.根据权利要求34所述的抗原结合蛋白,其中所述T细胞共刺激分子是CD28、4-1BB、OX-40、ICOS或其任意组合。
36.根据权利要求24至35中任一项所述的分离的ABP,其中所述HLAI类分子是HLA亚型A*02:01,并且所述HLA-限制性肽包括序列LLASSILCA。
37.根据权利要求36所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRαCDR3序列,所述TCRαCDR3序列是SEQIDNO:4277、4278、4279、4280或4281。
38.根据权利要求36或37所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβCDR3序列,所述TCRβCDR3序列是SEQIDNO:4291-4295中的任一个。
39.根据权利要求36至38中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自TCR克隆型ID#:TCR19、TCR21、TCR22、TCR18或TCR23中的任一个的αCDR3和βCDR3序列。
40.根据权利要求36至39中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα可变(TRAV)氨基酸序列、TCRα连接(TRAJ)氨基酸序列、TCRβ可变(TRBV)氨基酸序列、TCRβ多样性(TRBD)氨基酸序列以及TCRβ连接(TRBJ)氨基酸序列,其中所述TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列中的每一个与选自TCR克隆型ID#:TCR19、TCR21、TCR22、TCR18和TCR23的任一TCR克隆型的相应TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
41.根据权利要求36至40中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα恒定(TRAC)氨基酸序列。
42.根据权利要求36至41中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβ恒定(TRBC)氨基酸序列。
43.根据权利要求36至42中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括与SEQIDNO:4306-4310中的任一个具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的TCRαVJ序列。
44.根据权利要求36至43中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括与SEQIDNO:4321-4325中的任一个具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的TCRβV(D)J序列。
45.根据权利要求36至44中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRαVJ氨基酸序列和TCRβV(D)J氨基酸序列,其中所述TCRαVJ和所述TCRβV(D)J氨基酸序列中的每一个与选自TCR克隆型ID#:TCR19、TCR21、TCR22、TCR18和TCR23的任一TCR克隆型的相应TCRαVJ和TCRβV(D)J氨基酸序列具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
46.根据权利要求24至35中任一项所述的分离的ABP,其中所述HLAI类分子是HLA亚型A*01:01,并且所述HLA-限制性肽包括序列EVDPIGHLY。
47.根据权利要求46所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRαCDR3序列,其为SEQIDNO:4273-4276或3052-3350中的任一个。
48.根据权利要求46或47所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβCDR3序列,其为SEQIDNO:4287-4290或3351-3655中的任一个。
49.根据权利要求46至48中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自TCRID#:TCR101-TCR469、TCR2、TCR4、TCR53、TCR54或TCR101-TCR469中的任一个的αCDR3和βCDR3序列。
50.根据权利要求46至49中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα可变(TRAV)氨基酸序列、TCRα连接(TRAJ)氨基酸序列、TCRβ可变(TRBV)氨基酸序列、TCRβ多样性(TRBD)氨基酸序列以及TCRβ连接(TRBJ)氨基酸序列,其中所述TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列中的每一个与选自TCRID#:TCR101-TCR469、TCR2、TCR4、TCR53、TCR54或TCR101-TCR469的任一TCR克隆型的相应TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
51.根据权利要求46至50中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα恒定(TRAC)氨基酸序列。
52.根据权利要求46至50中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβ恒定(TRBC)氨基酸序列。
53.根据权利要求46至52中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括与SEQIDNO:3656-3961或4302-4305中的任一个具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的TCRαVJ序列。
54.根据权利要求46至53中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括与SEQIDNO:3962-4269或4317-4320中的任一个具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的TCRβV(D)J序列。
55.根据权利要求46至54中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRαVJ氨基酸序列和TCRβV(D)J氨基酸序列,其中所述TCRαVJ和所述TCRβV(D)J氨基酸序列中的每一个与选自TCRID#:TCR101-TCR469、TCR2、TCR4、TCR53和TCR54的任一TCR克隆型的相应TCRαVJ和TCRβV(D)J氨基酸序列具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
56.根据权利要求24至35中任一项所述的分离的ABP,其中所述HLAI类分子是HLA亚型B*44:02,并且所述HLA-限制性肽包括序列GEMSSNSTAL。
57.根据权利要求56所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRαCDR3序列,其为SEQIDNO:4284-4286或3138中的任一个。
58.根据权利要求56或57所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβCDR3序列,其为SEQIDNO:4298-4301中的任一个。
59.根据权利要求56至58中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自TCRID#:TCR29、TCR30、TCR32或TCR33中的任一个的αCDR3和βCDR3序列。
60.根据权利要求56至59中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα可变(TRAV)氨基酸序列、TCRα连接(TRAJ)氨基酸序列、TCRβ可变(TRBV)氨基酸序列、TCRβ多样性(TRBD)氨基酸序列以及TCRβ连接(TRBJ)氨基酸序列,其中所述TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列中的每一个与选自TCRID#:TCR29、TCR30、TCR32或TCR33的任一TCR克隆型的相应TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
61.根据权利要求56至60中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα恒定(TRAC)氨基酸序列。
62.根据权利要求56至61中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβ恒定(TRBC)氨基酸序列。
63.根据权利要求56至62中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括与SEQIDNO:4313-4316中的任一个具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的TCRαVJ序列。
64.根据权利要求56至63中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括与SEQIDNO:4328-4331中的任一个具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的TCRβV(D)J序列。
65.根据权利要求56至64中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRαVJ氨基酸序列和TCRβV(D)J氨基酸序列,其中所述TCRαVJ和所述TCRβV(D)J氨基酸序列中的每一个与选自TCRID#:TCR29、TCR30、TCR32或TCR33的任一TCR克隆型的相应TCRαVJ和TCRβV(D)J氨基酸序列具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
66.根据权利要求24至35中任一项所述的分离的ABP,其中所述HLAI类分子是HLA亚型A*02:01,并且所述HLA-限制性肽包括序列GVYDGEEHSV。
67.根据权利要求66所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRαCDR3序列,其为SEQIDNO:4282或4283。
68.根据权利要求66或67所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβCDR3序列,其为SEQIDNO:4296或4297。
69.根据权利要求66至68中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括来自TCR克隆型ID#:TCR26或TCR28的αCDR3和βCDR3序列。
70.根据权利要求66至68中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα可变(TRAV)氨基酸序列、TCRα连接(TRAJ)氨基酸序列、TCRβ可变(TRBV)氨基酸序列、TCRβ多样性(TRBD)氨基酸序列以及TCRβ连接(TRBJ)氨基酸序列,其中所述TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列中的每一个与TCRID#:TCR26或TCR28的相应TRAV、TRAJ、TRBV、TRBD和TRBJ氨基酸序列具有至少95%、96%、97%、98%、99%或100%的同一性。
71.根据权利要求66至70中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRα恒定(TRAC)氨基酸序列。
72.根据权利要求66至71中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括TCRβ恒定(TRBC)氨基酸序列。
73.根据权利要求66至72中任一项所述的分离的ABP,其中所述ABP包括与SEQIDNO:4311或4312具有至少95%、96%、97%、...
【专利技术属性】
技术研发人员:K·朱斯,W·布莱尔,B·布里克沙利文,J·巴斯比,M·A·巴斯比,M·斯科伯恩,R·耶冷斯凯,J·M·弗朗西斯,G·M·格罗特恩伯格,
申请(专利权)人:磨石肿瘤生物技术公司,
类型:发明
国别省市:美国;US
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