【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于检测浆细胞恶病质的方法相关申请的交叉引用本申请要求2017年7月21日提交的美国临时申请号62/535,419的权益和优先权，所述美国临时申请的内容在此通过引用并入。序列表的通过引用并入在2018年7月16日创建且大小为276KB的命名为“LBIO-002_001WOSeqListing.txt”的文本文件的内容在此以其整体通过引用并入。专利
本专利技术涉及浆细胞恶病质(plasmacelldyscrasia)的检测。专利技术背景多发性骨髓瘤是末期B-谱系或浆细胞的不可治愈的血液系统恶性肿瘤。这种克隆性浆细胞恶性肿瘤占所有癌症病例的~2%和血液系统恶性肿瘤的近似10%。其为弥漫性B-细胞淋巴瘤和慢性淋巴细胞性白血病之后的第三大最常见的B细胞恶性肿瘤。发病率估计为(在美国为~1/100,000发病率)。在2017年，由该疾病导致超过12,500例死亡。65岁以上的患者占诊断的那些的>80%；与白人相比，黑人中的发病率增加两倍。在过去五十年中，该疾病的发病率显著上升。此外，在过去二十...
【技术保护点】
1.用于检测有此需要的受试者中的浆细胞恶病质的方法，其包括：/n通过使来自受试者的测试样品与特异性检测至少32种生物标志物的表达的多种试剂接触来确定来自所述测试样品的至少32种生物标志物的表达水平，其中所述至少32种生物标志物包括
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170721 US 62/5354191.用于检测有此需要的受试者中的浆细胞恶病质的方法，其包括：
通过使来自受试者的测试样品与特异性检测至少32种生物标志物的表达的多种试剂接触来确定来自所述测试样品的至少32种生物标志物的表达水平，其中所述至少32种生物标志物包括ASXL1、BHLHE40、BTG2、COPA、FBXW7、GNA13、IL8、JMJD1C、LARS2、MALAT1、MBNL1、MCL1、NFKBIZ(2种剪接变体)、NR4A1(2种剪接变体)、PDE4B、P1AS2、PRKAA1(2种剪接变体)、SCYL2(2种剪接变体)、SMARCD2、SP1(2种剪接变体)、SRSF5、TAGAP、TANK、TLE4、TSC22D3、UBE2J1和至少一种持家基因；
将ASXL1、BHLHE40、BTG2、COPA、FBXW7、GNA13、IL8、JMJD1C、LARS2、MALAT1、MBNL1、MCL1、NFKBIZ(2种剪接变体)、NR4A1(2种剪接变体)、PDE4B、P1AS2、PRKAA1(2种剪接变体)、SCYL2(2种剪接变体)、SMARCD2、SP1(2种剪接变体)、SRSF5、TAGAP、TANK、TLE4、TSC22D3和UBE2J1各自的表达水平针对所述至少一种持家基因的表达水平归一化，由此获得ASXL1、BHLHE40、BTG2、COPA、FBXW7、GNA13、IL8、JMJD1C、LARS2、MALAT1、MBNL1、MCL1、NFKBIZ(2种剪接变体)、NR4A1(2种剪接变体)、PDE4B、P1AS2、PRKAA1(2种剪接变体)、SCYL2(2种剪接变体)、SMARCD2、SP1(2种剪接变体)、SRSF5、TAGAP、TANK、TLE4、TSC22D3和UBE2J1各自的归一化表达水平；
将各归一化表达水平输入算法以生成评分；
比较所述评分与第一预定截止值；和
产生报告，其中当所述评分等于或大于所述第一预定截止值时，所述报告鉴定受试者中存在浆细胞恶病质，或者当所述评分低于所述第一预定截止值时，确定受试者中不存在浆细胞恶病质，其中所述第一预定截止值在0至100的标度上为20。
2.权利要求1的方法，其中所述浆细胞恶病质是意义未确定的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)或骨髓瘤。
3.权利要求1或2的方法，其中所述至少一种持家基因选自ALG9、SEPN、YWHAQ、VPS37A、PRRC2B、DOPEY2、NDUFB11、ND4、MRPL19、PSMC4、SF3A1、PUM1、ACTB、GAPD、GUSB、RPLP0、TFRC、MORF4L1、18S、PPIA、PGK1、RPL13A、B2M、YWHAZ、SDHA、HPRT1、TOX4和TPT1。
4.权利要求1-3中任一项的方法，其具有大于90%的灵敏度。
5.权利要求1-4中任一项的方法，其具有大于90%的特异性。
6.权利要求1-5中任一项的方法，其中所述至少32种生物标志物中的至少一种是RNA、cDNA或蛋白。
7.权利要求6的方法，其中当所述生物标志物是RNA时，将RNA逆转录以产生cDNA，并检测产生的cDNA表达水平。
8.权利要求1-7中任一项的方法，其中通过在所述生物标志物和标记的探针或引物之间形成复合物来检测所述生物标志物的表达水平。
9.权利要求6的方法，其中当所述生物标志物是蛋白时，通过在所述蛋白和标记的抗体之间形成复合物来检测所述蛋白。
10.权利要求9的方法，其中标记物是荧光标记物。
11.权利要求6的方法，其中当所述生物标志物是RNA或cDNA时，通过在所述RNA或cDNA与标记的核酸探针或引物之间形成复合物来检测所述RNA或cDNA。
12.权利要求11的方法，其中标记物是荧光标记物。
13.权利要求11的方法，其中在所述RNA或cDNA和所述标记的核酸探针或引物之间的复合物是杂交复合物。
14.权利要求1-13中任一项的方法，其中所述测试样品是血液、血清、血浆或瘤性组织。
15.权利要求1-14中任一项的方法，其中所述第一预定截止值源自从无瘤性疾病的受试者获得的多个参考样品。
16.权利要求15的方法，其中所述参考样品是血液、血清、血浆或非瘤性组织。
17.权利要求1-16中任一项的方法，其进一步包括用药物疗法治疗被鉴定为具有浆细胞恶病质的受试者。
18.权利要求1-17中任一项的方法，其中所述有此需要的受试者是被诊断具有浆细胞恶病质的受试者、具有至少一种浆细胞恶病质症状的受试者，或具有发展浆细胞恶病质的倾向或家族史的受试者。
19.权利要求1-18中任一项的方法，其中受试者是人。
20.权利要求1-19中任一项的方法，其中所述算法是XGB、RF、glmnet、cforest、CART、treebag、knn、nnet、SVM-径向、SVM-线性、NB、NNET、mlp或逻辑回归建模。
21.用于确定受试者中的浆细胞恶病质是稳定的还是进行性的方法，其包括：
通过使来自受试者的测试样品与特异性检测至少32种生物标志物的表达的多种试剂接触来确定来自所述测试样品的至少32种生物标志物的表达水平，其中所述至少32种生物标志物包括ASXL1、BHLHE40、BTG2、COPA、FBXW7、GNA13、IL8、JMJD1C、LARS2、MALAT1、MBNL1、MCL1、NFKBIZ(2种剪接变体)、NR4A1(2种剪接变体)、PDE4B、P1AS2、PRKAA1(2种剪接变体)、SCYL2(2种剪接变体)、SMARCD2、SP1(2种剪接变体)、SRSF5、TAGAP、TANK、TLE4、TSC22D3、UBE2J1和至少一种持家基因；
将ASXL1、BHLHE40、BTG2、COPA、FBXW7、GNA13、IL8、JMJD1C、LARS2、MALAT1、MBNL1、MCL1、NFKBIZ(2种剪接变体)、NR4A1(2种剪接变体)、PDE4B、P1AS2、PRKAA1(2种剪接变体)...
【专利技术属性】
技术研发人员：IM莫林，M基德，I德罗斯多夫，
申请(专利权)人：液体活检研究有限责任公司，
类型：发明
国别省市：圣基茨和尼维斯;KN
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