基于生物信息学分析植物性食物过敏原线性表位的方法技术

本发明专利技术提供一种基于生物信息学分析植物性食物过敏原线性表位的方法，包括以下步骤：利用生物信息学数据库获取植物性食物过敏原的线性表位、氨基酸序列、二级结构和三级结构；利用生物信息学软件分析所述线性表位，包括其氨基酸组成及出现频率，在所述二级结构中的位置和在所述三级结构中的位置。本发明专利技术利用生物信息学数据库及软件分析植物性食物过敏原的氨基酸序列、二级结构和三级结构等，从而分析植物性食物过敏原线性表位与其高级结构的位置关系及特性，既快速准确又无需实验，对线性表位的深入研究有助于对食物致敏性的研究。

Analysis of linear epitopes of plant food allergens based on Bioinformatics

【技术实现步骤摘要】
基于生物信息学分析植物性食物过敏原线性表位的方法
本专利技术涉及食品安全检测
，尤其涉及一种基于生物信息学分析植物性食物过敏原线性表位的方法。
技术介绍
食物过敏是机体暴露于某种特定食物时出现的不良反应，即免疫系统对过敏原进行特异性免疫应答所致的可涉及全身不同器官的过敏反应。据流行病学调查全世界范围内婴幼儿的发病率已达到8％，成人达到5％。食物过敏大多是由IgE介导的I型超敏反应，可引发哮喘、腹泻、荨麻疹、过敏性皮炎等全身性多系统反应，甚至会产生休克危及生命，严重影响患者的生活质量。迄今为止，防止食物过敏最有效的途径是避免接触食物过敏原。但由于生产过程中的交叉反应增加了食品存在过敏原的可能性，食物过敏患者必须倍加小心才能免受其害。自然界中的食物过敏原种类繁多，主要来源于植物、动物和微生物，但是引起食物过敏性疾病的过敏原大多数来源于植物。到目前为止，世界卫生组织/国际免疫学会联合会(WHO/IUIS)过敏原命名小组委员会共鉴定了314种食物过敏原，其中有216种来源于植物。而联合国粮农组织(FAO)报道的八类过敏性食物中有四类是植物本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于生物信息学分析植物性食物过敏原线性表位的方法，其特征在于，包括以下步骤：/n(1)利用生物信息学数据库获取植物性食物过敏原的线性表位、氨基酸序列、二级结构和三级结构；/n(2)利用生物信息学软件分析所述线性表位，包括其氨基酸组成及出现频率，在所述二级结构中的位置和在所述三级结构中的位置。/n

【技术特征摘要】
1.一种基于生物信息学分析植物性食物过敏原线性表位的方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)利用生物信息学数据库获取植物性食物过敏原的线性表位、氨基酸序列、二级结构和三级结构；
(2)利用生物信息学软件分析所述线性表位，包括其氨基酸组成及出现频率，在所述二级结构中的位置和在所述三级结构中的位置。


2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述生物信息学数据库包括SDAP、PDB、Uniprot、NCBI和BLAST；
所述生物信息学软件包括Bioedit、Cn3D、DSSP、SWISS-MODEL、Spdbv、Pymol、ClustalW、pFind和DNAStar。


3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述线性表位不能直接获取时，通过以下方法预测获得：利用生物信息学软件分别筛选出所述植物性食物过敏原氨基酸序列中满足亲水性指数>0的区域、抗原指数>0的区域和表面可及性指数>1的区域，并利用可塑性分析筛选出具有柔性的区域，上述四个区域重叠的部分即为预测线性表位。


4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述三级结构不能直接...

【专利技术属性】
技术研发人员：车会莲，杨帅，李欣芮，陈成，范卓妍，张亚妮，贺晓云，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：北京;11