山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记及其应用制造技术

本发明专利技术提供了山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记，位于山羊ZBP1基因的第一内含子中，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，在该序列的第249bp处存在一处C>T碱基突变、在第852bp处存在一个C>T碱基突变、在第1777bp处存在一个G>A碱基突变、在第2463bp处存在一个C>T碱基突变；本发明专利技术还提供了山羊ZBP1基因与产羔数性状关联的SNP检测试剂盒，包括如SEQ ID NO.6～13所示的引物对；如SEQ ID NO.14～17所示的SNaPshot单碱基延伸引物。本发明专利技术为山羊产羔数性状的分子标记辅助育种提供了由4个SNP位点组成的新的单倍型分子育种标记。

Haplotype markers associated with litter size in the first intron of zbp1 gene and their application

【技术实现步骤摘要】
山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记及其应用
本专利技术涉及山羊分子标记筛选
，尤其涉及山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记及其应用。
技术介绍
产羔性状是山羊的最重要的经济性状之一。提高每胎的产羔数对于山羊而言是提升生产经济效益的重要措施。应用基因组学方法的研究能在整个基因组的水平去筛选出与山羊重要经济性状相关的候选基因和分子标记，使研究人员能够更深入的理解山羊性状的遗传机理。由于山羊产羔数是低遗传力性状，通过常规的育种方法很难在短期内获得较大遗传进展，随着应用基因组学、分子生物学和分子遗传学理论技术的不断发展，遗传标记技术可以较好的解决这一难题，并能有效的加快山羊产羔数性状的选择进展，可对我国山羊产业的可持续发展将带来巨大的经济效益。单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)标记指由基因组单核苷酸变异引起的DNA序列多态性，包括碱基转换、颠换、单碱基插入或缺失等，被公认为是最新的第三代DNA分子标记。根据SNP在基因中的位置可分为基因编码区SNP(本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记，其特征在于，所述的单倍型标记位于山羊ZBP1基因第一内含子的部分DNA序列中，所述单倍型标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为2463bp；所述单倍型标记包括：/nZBP1 g.352C>T位点的分子标记：即在SEQ ID NO.1所示序列中第249bp处存在一处C>T碱基突变；/nZBP1 g.955C>T位点的分子标记：即在SEQ ID NO.1所示序列中第852bp处存在一处C>T碱基突变；/nZBP1 g.1880G>A位点的分子标记：即在SEQ ID NO.1所示序列...

【技术特征摘要】
1.一种山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记，其特征在于，所述的单倍型标记位于山羊ZBP1基因第一内含子的部分DNA序列中，所述单倍型标记的核苷酸序列如序列表SEQIDNO.1所示，该序列长度为2463bp；所述单倍型标记包括：
ZBP1g.352C>T位点的分子标记：即在SEQIDNO.1所示序列中第249bp处存在一处C>T碱基突变；
ZBP1g.955C>T位点的分子标记：即在SEQIDNO.1所示序列中第852bp处存在一处C>T碱基突变；
ZBP1g.1880G>A位点的分子标记：即在SEQIDNO.1所示序列中第1777bp处存在一处G>A碱基突变；
ZBP1g.2566T>C位点的分子标记：即在SEQIDNO.1所示序列中第2463bp处存在一处T>C碱基突变。


2.如权利要求1所述的单倍型标记，其特征在于，所述ZBP1g.352C>T位点的分子标记的序列如SEQIDNO.2所示；所ZBP1g.955C>T位点的分子标记的序列如SEQIDNO.3所示；所述ZBP1g.1880G>A位点的分子标记的序列如SEQIDNO.4所示；所述ZBP1g.2566T>C位点的分子标记的序列如SEQIDNO.5所示。


3.如权利要求1所述的单倍型标记，其特征在于，所述序列SEQIDNO.1的第249bp处的C或T的碱基多态性位点，表现为CC、CT或TT三种基因型，其中C为优势等位基因。


4.如权利要求1所述的单倍型标记，其特征在于，所述序列SEQIDNO.1的第852bp处的C或T的碱基多态性位点，表现为CC、CT或TT三种基因型，其中C为优势等位基因。


5.如权利要求1所述的单倍型标记，其特征在于，所述序列SEQIDNO.1的第1777bp处的G或A的碱基多态性位点，表现为GG、GA或AA三种基因型，其中G为优势等位基因。


6.如权利要求1所述的单倍型标记，其特征在于，所述序列SEQIDNO.1的第2463bp处的C或T的碱基多态性位点，表现为CC、CT或TT三种基因型，其中T为优势等位基因。


7.权利要求1-6任一所述的单倍型标记在山羊产羔数性状标记辅助选择...

【专利技术属性】
技术研发人员：陶虎，陈明新，张年，杨娟，熊琪，李晓锋，索效军，杨前平，刘洋，田宏，张鹤山，熊军波，张凤，
申请(专利权)人：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：湖北;42