用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组、应用、产品及方法技术

本发明专利技术提供了一种用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组、应用、产品及方法，涉及生物技术领域，本发明专利技术提供的用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组，能够用于检测免疫抑制剂代谢能力、免疫调节剂代谢能力、抗炎药代谢能力、TNF抑制剂代谢能力、B细胞调节剂代谢能力、IL‑6抑制剂代谢能力、降尿酸剂代谢能力和排尿酸药代谢能力，该引物组针对风湿免疫疾病常见药物代谢相关的主要突变位点进行设计，可以对风湿免疫疾病常见药物代谢相关的位点突变实现特异性检测，准确性高，能够极大的缩短检测周期，同时降低检测成本。

Primer set, application, products and methods of SNP sites related to drug metabolism in rheumatic immune diseases

The invention provides a primer group, application, product and method for detecting the SNP site related to the drug metabolism ability of rheumatic immune disease, which relates to the field of biotechnology. The invention provides an inducer group for detecting the SNP site related to the drug metabolism ability of rheumatic immune disease, which can be used for detecting the metabolism ability of immunosuppressants, the metabolism ability of immunomodulators, and anti-inflammatory This primer group is designed for the main mutation sites related to the common drug metabolism of rheumatic immune diseases. It can specifically detect the site mutations related to the common drug metabolism of rheumatic immune diseases High accuracy, can greatly shorten the detection cycle, while reducing the cost of detection.

【技术实现步骤摘要】
用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组、应用、产品及方法
本专利技术涉及生物
，尤其是涉及一种用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组、应用、产品及方法。
技术介绍
风湿免疫病是一大类疾病的总称，临床上最常见的主要包括类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、强直性脊柱炎、痛风等。风湿免疫疾病是迁延反复的疾病，多数患者需要在相当长时间内带病生存，且绝大部分病种目前尚无根治方法，治疗以通过药物控制病情、维持临床缓解、提高生存质量为目的。但可惜的是，即使在指南标准药物治疗方案下规律治疗，其疾病的控制率和缓解率依然很低。尽管近几十年来随着人们对改善病情的抗风湿药(DMARDs药物)的认识及其在临床上广泛应用于类风湿性关节炎与系统性红斑狼疮的治疗，其疾病的缓解率也明显提高，但是在临床用药中仍存在一个突出的问题：个体间药物应答存在差异，相同的药物对于不同的人群起到的作用不尽一致。风湿免疫疾病患者的基因多态性会导致药物疗效和不良反应发生个体差异，而药物基因组学研究可以通过对患者基因的筛查，制订个体化给药方案，提高疗效，降低其不良反应发生率。目前主要是以PCR为基础的检测手段，诸如ARMS-PCR，荧光定量PCR、数字PCR等，上述检测方法虽然操作简便、快速，且数据分析简单，但由于其通量的限制，难以满足临床对多基因、多位点检测的需求。而高通量检测，如高通量测序技术等，虽然解决了通量的限制，但成本较高、周期较长，且需要专业的实验操作及数据分析人员，因此应用于临床检测的普适性较差。综上，目前市场上与风湿免疫疾病个体化用药相关的检测无法综合全面的评估风湿免疫疾病常见药物在治疗中的有效性和安全性。因此，需要一种经济、快速、易操作的风湿免疫疾病个体化用药相关的检测方法，以为不同风湿免疫疾病患者个体制定相应的用药方案，以达到精准的用药和治疗需求。有鉴于此，特提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术的第一个目的在于提供一种用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组，以至少缓解现有技术中存在的技术问题之一。本专利技术的第二个目的在于提供上述引物组在制备风湿免疫疾病个体化用药检测的产品中的应用。本专利技术的第三个目的在于提供一种用于风湿免疫疾病个体化用药检测的产品，以缓解现有技术中缺少通量高、易操作且成本低的针对风湿免疫疾病个体化用药进行检测的产品的技术问题。本专利技术的第四个目的在于提供一种检测风湿免疫疾病个体化用药的相关SNP位点的方法，以缓解现有的检测方法通量较低或操作繁琐、价格昂贵等技术问题。本专利技术提供了一种用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组，所述药物代谢能力包括：免疫抑制剂代谢能力、免疫调节剂代谢能力、抗炎药代谢能力、TNF抑制剂代谢能力、B细胞调节剂代谢能力、IL-6抑制剂代谢能力、降尿酸剂代谢能力、排尿酸药代谢能力。进一步的，所述用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点包括：rs1042597、rs1045642、rs1051266、rs1057910、rs1061622、rs10919563、rs11265618、rs1142345、rs116855232、rs137852327、rs1495741、rs1799930、rs1799931、rs1800460、rs1800462、rs1800584、rs1800629、rs1801131、rs1801133、rs1801274、rs1801280、rs2032582、rs2231142、rs2234693、rs2267076、rs3731722、rs3957356、rs396991、rs4244285、rs4329505、rs4646487、rs4673993、rs4802101、rs7254579、rs72554664、rs72554665、rs7574865、rs762551、rs767455、rs776746、rs9262570、rs9263726、rs9340799及AMEL。进一步的，所述引物组的序列如SEQIDNO.1-90所示，或者与SEQIDNO.1-90具有至少85％的同一性。进一步的，所述引物组还包括SEQIDNO.91-135所示的延伸引物，或者与SEQIDNO.91-135具有至少85％的同一性的延伸引物。本专利技术还提供了上述的引物组在制备风湿免疫疾病个体化用药检测的产品中的应用。本专利技术还提供了一种用于风湿免疫疾病个体化用药检测的产品，包括上述的用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组。进一步的，所述产品包括用于检测SNP位点的试剂和/或设备；优选地，所述设备包括采用MassARRAY对SNP位点核苷酸进行检测的设备。另外，本专利技术还提供了一种检测风湿免疫疾病个体化用药的相关SNP位点的方法，应用上述的用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组对待测样本DNA中SNP位点的核苷酸进行检测。进一步地，应用上述的用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组对待测样本DNA进行PCR扩增反应及碱基延伸反应，然后应用MassARRAY对反应产物进行检测，确定待测样本DNA中SNP位点的核苷酸；优选地，所述检测风湿免疫疾病个体化用药的相关SNP位点的方法还包括在碱基延伸反应前对PCR扩增的产物去磷酸化；优选地，所述检测风湿免疫疾病个体化用药的相关SNP位点的方法还包括在碱基延伸反应后对反应产物纯化，然后再采用MassARRAY检测反应产物。进一步地，将所述引物组分为如下2组：I组包括检测rs1045642、rs1051266、rs1142345、rs116855232、rs137852327、rs1495741、rs1799930、rs1799931、rs1800462、rs1800584、rs1801133、rs2032582、rs2231142-1、rs2234693、rs2267076、rs3957356、rs4673993、rs7254579、rs72554665、rs762551、rs776746和rs9340799的引物组；II组包括检测rs1042597、rs1057910、rs1061622、rs10919563、rs11265618、rs1800460、rs1800629、rs1801131、rs1801274、rs1801280、rs2231142-2、rs3731722、rs396991、rs4244285、rs4329505、rs4646487、rs4802101、rs72554664、rs7574865、rs767455、rs9262570、rs9263726和AMEL的引物组。相比于现有技术，本专利技术具有如下有益效果：本专利技术提供的用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组，能够用于检测免疫抑制剂代谢能力、免疫调节剂代谢能力、抗炎药代谢本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组，其特征在于，所述药物代谢能力包括：免疫抑制剂代谢能力、免疫调节剂代谢能力、抗炎药代谢能力、TNF抑制剂代谢能力、B细胞调节剂代谢能力、IL-6抑制剂代谢能力、降尿酸剂代谢能力和排尿酸药代谢能力。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点的引物组，其特征在于，所述药物代谢能力包括：免疫抑制剂代谢能力、免疫调节剂代谢能力、抗炎药代谢能力、TNF抑制剂代谢能力、B细胞调节剂代谢能力、IL-6抑制剂代谢能力、降尿酸剂代谢能力和排尿酸药代谢能力。


2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述用于检测风湿免疫疾病的药物代谢能力的相关SNP位点包括：rs1042597、rs1045642、rs1051266、rs1057910、rs1061622、rs10919563、rs11265618、rs1142345、rs116855232、rs137852327、rs1495741、rs1799930、rs1799931、rs1800460、rs1800462、rs1800584、rs1800629、rs1801131、rs1801133、rs1801274、rs1801280、rs2032582、rs2231142、rs2234693、rs2267076、rs3731722、rs3957356、rs396991、rs4244285、rs4329505、rs4646487、rs4673993、rs4802101、rs7254579、rs72554664、rs72554665、rs7574865、rs762551、rs767455、rs776746、rs9262570、rs9263726、rs9340799及AMEL。


3.根据权利要求1或2所述的引物组，其特征在于，所述引物组的序列如SEQIDNO.1-90所示，或者与SEQIDNO.1-90具有至少85％的同一性。


4.根据权利要求3所述的引物组，其特征在于，所述引物组还包括SEQIDNO.91-135所示的延伸引物，或者与SEQIDNO.91-135具有至少85％的同一性的延伸引物，优选的，所述引物分为如下2组：
I组包括检测rs1045642、rs1051266、rs1142345、rs116855232、rs137852327、rs1495741、rs1799930、rs1799931、rs1800462、rs1800584、rs1801133、rs2032582、rs2231142-1、rs2234693、rs2267076、rs3957356、rs4673993、rs7254579、rs72554665、rs762551、rs776746和rs9340799的引物组；
II组包括检测AMEL、rs1042597、rs1057910、rs1061622、rs10919563、rs11265618、rs1800460、rs1800629、rs1801131、rs1801274、rs1801280、rs2231142-2、rs3731722、rs396991、rs4244285、rs4329505、rs4646487、rs4802...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵妍，李翔，陈珊珊，李小方，李杜衡，肖念清，任用，
申请(专利权)人：江苏先声医疗器械有限公司，南京先声医学检验有限公司，江苏先声医学诊断有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏;32