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老芒麦不同组织的荧光定量内参基因及其引物与应用制造技术

技术编号:22212169 阅读:35 留言:0更新日期:2019-09-29 22:39
本发明专利技术提供老芒麦不同组织的荧光定量内参基因,为TBP2和PP2A,其核苷酸序列分别为序列表SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2。上述2个内参基因序列均来自老芒麦转录组序列,比其他物种上的通用内参基因具有更高的特异性和稳定性。同时这2个内参基因是筛选出的,是老芒麦在不同组织中最稳定的内参基因,数据真实可靠,可为后期深入挖掘老芒麦功能基因奠定基础。本发明专利技术不仅解决了现有老芒麦基因表达分析中没有内参基因的现状,也能够提高检测效率和检测结果的可信度。本发明专利技术的2个内参基因均为新开发的基因,不仅丰富了植物内参基因的数量,还能为在其它小麦族和披碱草属植物上的相关研究提供参考。

Fluorescence Quantitative Internal Reference Genes in Different Tissues of Old Mangosteen and Their Primers and Applications

【技术实现步骤摘要】
老芒麦不同组织的荧光定量内参基因及其引物与应用
本专利技术属于植物分子生物学
,具体涉及老芒麦不同组织的荧光定量内参基因及其引物与应用。
技术介绍
老芒麦(ElymussibiricusL.)是一种多年生、自花授粉的禾本科牧草,它作为披碱草属的模式种,在北半球的温带地区多有分布。我国的老芒麦种质资源也非常丰富,在国内许多省区都有分布。由于其具有适应性强、草品质高、适口性好等优点,常被用于人工草地建植和生态恢复工程中。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)因其具有快捷、高效、灵敏等优点,已成为检测基因表达水平的有效工具。然而该方法也容易受到RNA质量(纯度和完整性)、cDNA合成效率、反应参数等因素的影响,因此通过使用内参基因可以有效提高数据的准确性。大量研究表明内参基因的稳定性在不同物种、不同组织、不同发育时期及不同处理条件下有所差异,不通过筛选而直接使用内参基因很可能会得到相反或错误的结论。因此,在特定试验条件下筛选适用于某一物种的内参基因是获得准确的实时荧光定量PCR结果的基础。目前,关于老芒麦不同组织中基因特异表达的研究较少。因此开展老芒麦在不同组织中内参基因筛选工作,可以促进老芒麦优良品质基因的开发。
技术实现思路
本专利技术的主要目的是针对现有技术的不足,提供一种适用于老芒麦在不同组织中稳定表达的内参基因,该基因能够满足实时荧光定量检测老芒麦目的基因表达水平的要求,提高了老芒麦基因表达分析研究的稳定性和可靠性。本专利技术同时还提供一种上述内参基因的专用引物及其应用。本专利技术提供老芒麦不同组织的荧光定量内参基因,所述内参基因为TBP2和PP2A,所述内参基因TBP2的核苷酸序列如下,其中,第1062-1481位为CDS序列:TAAGTCCCGCCCCCATCTCTCATGTTCCCCGGCCGGCGGTGGGTTCCGTCGGCGGCCCCCCTTGCTCCCTTTGCCAGGTTTGACTTGACAGAGCGAGGTGTTGCTGAATTGGGCGCGGGCGATTTGGTGGACGGGCATAGCTCGGTTTGATCTGATTTGGGGGTTTGGATTTCAAAGAGGGAAGGGTATAGAAGTTTCTAGAGACCGACCAAATGAAATCATAAATCTGATAAGATTCATGATACTTTTTTCACTGAAAACTGGATTAATAAACCAATGCAGAGGTTTGGTTCAGATGAAAAAGTAAATATCGAGGTTGGAATGCATATGAATGCCTCTTCCAAAGAGGGAAGGGGATAGGGGTTTCTTGAGACCGATCAAATGATACCATAAATCTGATGAGATTCATGATGCTTGGATTACTGAAAACTACATTAATAAACAGATATTGAGGTTGGGTTCAGATAAAAGTAAATATTGAGGTTAGCGGGGTCATAATCTGTTTCGGAGGTCACTCGACTTGAAATTCATGCCACGGTCTGGCTTAATTTCTCTGGAACTCATATTCATGGTACTTTGAATGCTGAACTGAGGGGGTTGACTGGGGGTGAAAGGTTCAGATGAGCTACTAACAGTTTGGACAGAAAAAGATAGGTTAGTGCAAATGGCATGTGCAGTTCTTTCTGCTGTTCATTGCCAGCACTTAAAATGGGCCATTCTGATCTACATTTGCGTTTACTTGCTCTGCAGTTAGTCTGACATGCCAAGTTATCCACTTTGTGCAAACTTGGTCTGGTCCGTGCAGCGTGTTCTAATTCGCTGGACATTTTACTGTGCTGCAATGTTGCGTTTTGGGCGCGATAGTGTTTTGTGATGTGGCCCGTTTTCCTGCCCAAGTACAAGATTTTAACACTCCTTGGTGTACTCTGCTTTCTTGTGTTTGATCTGATGACAGGAATATTGTGTCGACGGTGAACCTGGACTGTAAATTGGACCTGAAAGCAATAGCTCTCCAGGCACGCAATGCAGAGTATAACCCCAAGCGTTTTGCTGCTGTTATCATGCGGATAAGAGAACCAAAAACTACAGCATTGATATTTGCTTCAGGAAAAATGGTTTGCACTGGAGCAAAAAGTGAACAGCAATCTAAACTTGCAGCTAGAAAGTATGCTCGTATAATCCAGAAGCTTGGCTTTCCTGCAAAATTCAAGGACTTCAAGATCCAAAATATTGTTGCCTCTTGTGATGTCAAATTCCCTATCAGGCTTGAGGGCCTTGCATATTCTCACGGTGCTTTCTCAAGTTATGAGCCAGAGCTATTTCCTGGTCTGATTTACCGGATGAGGCAGCCAAAGATTGTCCTCCTAATTTTCGTTTCAGGCAAGATTGTTCTGACTGGTGCAAAGGTGAGAGAAGAGACATACACTGCCTTCGAGAACATATATCCTGTCCTCACAGAGTTCAGAAAAGTGCAGCAATGATGGTATAATTCCTGCGAGTGCATGTTTAATGGACATTCCTATGTTGAGAATAGGATAGGAAATGCCATGTTCCATTGGCAAGTTGGGCCACTAAAGGTGGATTTGTCCTTTTTGCTGCCCAGTGCCTCTGGTGCTTGTTCTATTTTTGTTTGCGGTGGTTTTTGGCCTACGACGAGTGGTTACTCTGAGAAATTAATAGTGAAGATGCCGTTCCCTTGTGTGCAGGTGGTGACTTTGGAAGTAAGCAGAATTGAAGATACTGTTGCTTGCTGCCTGCTCCAAGCTCAGCCCCACAAAGTGTAGGCATAGCCCTTTCTCAGCTCTTTGGAGATACTGTCCATCCAATTTGGTGCAGCTGTTGTCGTAATCGACTCTTTGAGTCTTTTCTTGTGATGGATCATGGTTGATCATCATAGGTCTATTCTAGTATCCATTGTTCATGGACAGTCGTTATCACTTGCGACGCTCTGTGGAAATCAAGTAAAACCCAAGCAGATTTTTGCCCCTGGATTCTAGAGCCTTTTTCTGAATGCCACCTGATGATGGGAAGGCCGGCAACCTGATGTATATGTACTCCTTAAGAAGTGGACTTCATTTTAGGCTAAACAGTAAAAAGGAAAATTTGTACTTTGTTCATTTTTCTGCATTTGTTGTATCTGCTGGACCATGGCCTGCCTTTATCTTCATTTTTTCAACCAGAAAATCCGCAGTGAAAACAATGGTAGAGTTATAAAAACC。所述内参基因PP2A的核苷酸序列如下,其中,第181-1644位为CDS序列:ATCCCGTGTGGTGCCTTTAC本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.老芒麦不同组织的荧光定量内参基因,其特征在于:所述内参基因为TBP2和PP2A,所述内参基因TBP2的核苷酸序列为序列表SEQ ID NO.1,所述内参基因PP2A的核苷酸序列为序列表SEQ ID NO.2。

【技术特征摘要】
1.老芒麦不同组织的荧光定量内参基因,其特征在于:所述内参基因为TBP2和PP2A,所述内参基因TBP2的核苷酸序列为序列表SEQIDNO.1,所述内参基因PP2A的核苷酸序列为序列表SEQIDNO.2。2.根据权利要求1所述的老芒麦不同组织的荧光定量内参基因,其特征在于:所述不同组织为植株的根、茎、叶、花或分蘖芽组织。3.权利要求1或2所述的老芒麦不同组织的荧光定量内参基因的特异性引物,其特征在于:所述内参基因TBP2的特异性引物对为:上游引物:CGGATGAGGCAGCCAAAGATTGT下游引物:TGTTCTCGAAGGCAGTGTATGTCTC;所述内参基因PP2A的特异性引物对为:上游引物:GTGATAATGAGGCTGAAGTGCGGAT下游引物:GCGAACATGCTGAGACGAATCTGA。4.权利要求1或2所述...

【专利技术属性】
技术研发人员:张俊超谢文刚张宗瑜郑玉莹王彦荣
申请(专利权)人:兰州大学
类型:发明
国别省市:甘肃,62

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