用于扩增和检测淋病奈瑟氏菌的多核苷酸制造技术

本文公开了与经由核酸扩增测试(NAAT)检测淋病奈瑟氏菌(Neisseria gonorrhoeae)相关的引物和探针，例如以便扩增和确定测试样品中存在的淋病奈瑟氏菌核酸的存在。具体地，本公开内容描述了结合淋病奈瑟氏菌的小亚基rRNA(胞嘧啶(967)‑C(5))‑甲基转移酶或rsmB基因的引物和探针，用于经由环介导等温扩增(LAMP)和分子信标杂交的检测。

Polynucleotides for amplification and detection of Neisseria gonorrhoeae

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于扩增和检测淋病奈瑟氏菌的多核苷酸政府许可权本专利技术根据美国国防部(theDepartmentofDefense)授予的合同号HR0011-11-2-0006在政府支持下进行。政府具有本专利技术中的某些权利。相关申请的交叉引用本申请要求2016年11月10日提交的美国临时专利申请第62/420,496号的权益，其内容通过引用并入本文。专利
本专利技术涉及分子生物学和核酸化学的领域。本专利技术提供了用于检测病原体诸如淋病奈瑟氏菌(Neisseriagonorrhoeae)的方法和试剂，并且因此还涉及医学诊断和预测的领域。特别地，本专利技术涉及用于扩增和检测淋病奈瑟氏菌的多核苷酸和方法。专利技术背景淋病奈瑟氏菌(淋病的病原体(etiologicalagent))感染泌尿生殖道，淋病的临床征象通常与其他性传播疾病(STD)的临床征象重叠。感染(通常在女性中是无症状的)，如果不治疗，可以导致更严重的和永久性的健康相关并发症，诸如盆腔炎性疾病(PID)、慢性盆腔疼痛、输卵管性不孕症和危及生命的异位妊娠。在男性中，大多数尿道感染导致尿道炎，偶尔导致附睾炎，如果不治疗，附睾炎可以导致不育症本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种组合物，所述组合物包含选自由集合‑1至集合‑55组成的组的多核苷酸的集合。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.11.10 US 62/420,4961.一种组合物，所述组合物包含选自由集合-1至集合-55组成的组的多核苷酸的集合。2.如权利要求1所述的组合物，所述组合物还包含探针。3.如权利要求2所述的组合物，其中所述探针包含标记物。4.如权利要求3所述的组合物，其中所述探针是标记的多核苷酸。5.如权利要求3所述的组合物，其中所述探针是具有选自由SEQIDNO：72(MB6)、SEQIDNO：94(MB9)和SEQIDNO：101(MB16)组成的组的序列的标记的多核苷酸，并且所述多核苷酸的集合选自由以下组成的组：集合-8、集合-28和集合-45。6.如权利要求3所述的组合物，其中所述探针是具有选自由SEQIDNO：69(MB3)、SEQIDNO：70(MB4)、SEQIDNO：71(MB5)、SEQIDNO：95(MB10)、SEQIDNO：96(MB11)、SEQIDNO：97(MB12)和SEQIDNO：98(MB13)组成的组的序列的标记的多核苷酸，并且所述多核苷酸的集合选自由以下组成的组：集合-9、集合-10、集合-11、集合-12、集合-29、集合-30、集合-31、集合-32、集合-46、集合-47、集合-48和集合-49。7.如权利要求3所述的组合物，其中所述探针是具有选自由SEQIDNO：99(MB14)和SEQIDNO：100(MB15)组成的组的序列的标记的多核苷酸，并且所述多核苷酸的集合选自由以下组成的组：集合-57、集合-58、集合-59、集合-60、集合-61、集合-62、集合-64、集合-65、集合-66、集合-67、集合-68、集合-69、集合-71、集合-72、集合-73、集合-74、集合-75和集合-76。8.如权利要求3所述的组合物，其中所述探针是具有选自由SEQIDNO：35(MB1)、SEQIDNO：36(MB2)、SEQIDNO：92(MB7)和SEQIDNO：93(MB8)组成的组的序列的标记的多核苷酸，并且所述多核苷酸的集合选自由以下组成的组：集合-1、集合-2、集合-3、集合-4、集合-5、集合-6、集合-19、集合-20、集合-21、集合-22、集合-23、集合-24、集合-25、集合-26、集合-39、集合-40、集合-41、集合-42、集合-43、集合-56、集合-63和集合-70。9.如权利要求3-8中任一项所述的组合物，其中所述标记物是荧光团。10.如权利要求9所述的组合物，其中所述荧光团共价附接至所述多核苷酸的末端。11.根据权利要求9-10中任一项所述的组合物，其中所述探针是包含猝灭剂的分子信标。12.如权利要求11所述的组合物，其中所述荧光团是FAM，并且所述猝灭剂是BHQ1。13.如权利要求12所述的组合物，其中所述荧光团是ATTO565或Alexa594，并且所述猝灭剂是BHQ1或BHQ2。14.一种分子信标，所述分子信标包含荧光团、猝灭剂和多核苷酸，其中所述多核苷酸选自由以下组成的组：SEQIDNO：35、SEQIDNO：36、SEQIDNO：69至SEQIDNO：72和SEQIDNO：92至SEQIDNO：101。15.如权利要求14所述的分子信标，其中所述荧光团是FAM，并且所述猝灭剂是BHQ1。16.如权利要求14所述的组合物，其中所述荧光团是ATTO565或Alexa594，并且所述猝灭剂是BHQ1或BHQ2。17.一种检测测试样品中的淋病奈瑟氏菌(Neisseriagonorrhoeae)的方法，所述方法包括：(a)从所述测试样品提取核酸；(b)通过使步骤(a)中提取的核酸与包含链置换DNA聚合酶和序列特异性引物集合的反应混合物反应来扩增靶序列，其中所述序列特异性引物集合选自由集合-1至集合-55组成的组；以及(c)检测步骤(b)的扩增产物的存在或不存在；其中所述扩增产物的存在指示所述测试样品中淋病奈瑟氏菌的存在。18.如权利要求17所述的方法，其中步骤(b)中所述靶序列的扩增在约60℃和67℃之间进行少于30分钟。19.如权利要求17或18所述的方法，其中所述扩增步骤进行少于15分钟。20.如权利要求19所述的方法，其中所述扩增步骤进行少于9分钟。21....

【专利技术属性】
技术研发人员：安德里亚·C·迪登，马淑媛，赫迪亚·曼玛尔，
申请(专利权)人：达丽斯生物医学公司，
类型：发明
国别省市：美国,US