血浆DNA的建库方法和建库试剂盒技术

技术编号:21538111 阅读:67 留言:0更新日期:2019-07-06 18:37
本发明专利技术提供了一种血浆DNA的建库方法和建库试剂盒。其中,该建库方法包括:对血浆DNA进行末端修复及加A,得到修复DNA;采用带有唯一标签序列的接头对修复DNA依次进行接头连接和PCR扩增,得到血浆DNA的测序文库。通过采用带有唯一标签序列的接头对修复加A后的血浆DNA进行接头连接进而构建成血浆DNA的测序文库,这样形成的文库便于在后期对测序数据分析的时候,根据唯一标签序列将建库扩增或测序扩增所产生的重复,与血浆DNA中真实的重复片段区分出来,进而去除扩增重复而保留血浆碎片DNA本身存在的重复,使得来源于血浆DNA的有效数据量得以提升,从而一定程度上提高了血浆DNA的建库效率。

Method and kit for library construction of plasma DNA

【技术实现步骤摘要】
血浆DNA的建库方法和建库试剂盒
本专利技术涉及血浆DNA建库领域,具体而言,涉及一种血浆DNA的建库方法和建库试剂盒。
技术介绍
随着技术进步和人们对肿瘤和遗传病认识的深入,传统技术已经不能满足精准诊断的需求。精准诊断越来越依赖二代测序技术解决问题,二代技术也不断进步,测序通量越来越多,测序成本越来越低。目前市场主流二代测序仪主要有三家公司,分别是Illumina各型号测序仪,华大智造(MGI)测序仪和life公司的测序仪。Illumina的测序仪和华大智造的测序仪建库过程都是依赖T-A克隆的方式建库,区别在于Illumina是Y型接头,华大智造中间鼓泡型互补接头,这两种接头都能充分利用连接产物。Life的接头是平端连接,连接产物只有1/2模板是被测序仪测序,同时Life的测序仪对连续的碱基测序质量不高,一些精确应用受到限制。外周血中的血浆是血液的一部分,血液经过低速离心可以分成三部分,主要部分是上层血浆和下层红细胞,中间是白细胞层。基因组DNA主要集中在白细胞中,血浆中含有碎片DNA,DNA碎片是体内细胞凋亡的代谢产物,DNA碎片的长度是缠绕核小体的核酸片段长度及倍数,说明DNA本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于MGI测序平台的血浆DNA的建库方法,所述建库方法包括:对血浆DNA进行末端修复及加A,得到修复DNA;采用带有唯一标签序列的接头对所述修复DNA依次进行接头连接和PCR扩增,得到所述血浆DNA的测序文库。

【技术特征摘要】
1.一种基于MGI测序平台的血浆DNA的建库方法,所述建库方法包括:对血浆DNA进行末端修复及加A,得到修复DNA;采用带有唯一标签序列的接头对所述修复DNA依次进行接头连接和PCR扩增,得到所述血浆DNA的测序文库。2.根据权利要求1所述的建库方法,所述带有唯一标签序列的接头采用A1所示的第一Y接头和B1所示的第二Y接头的混合接头;A1:第一Y接头B1:第二Y接头其中,N为A、T、C或G,所述第一Y接头中的NNNNN序列与所述第二Y接头中的NNNNNN序列均代表所述唯一标签序列;优选地,所述唯一标签序列包括下表1所示的16个所述第一Y接头的5bp标签序列和16个所述第二Y接头的6bp标签序列:表1:接头序号5bp标签序列接头序号6bp标签序列MGI-5bp-15'Phos-GCTAG-3'MGI-6bp-15'Phos-GACGAT-3'MGI-5bp-25'Phos-GAGCA-3'MGI-6bp-25'Phos-GCTCTT-3'MGI-5bp-35'Phos-AGCGT-3'MGI-6bp-35'Phos-CGGAAT-3'MGI-5bp-45'Phos-CTCCA-3'MGI-6bp-45'Phos-GCATGA-3'MGI-5bp-55'Phos-TGGAC-3'MGI-6bp-55'Phos-CATCAC-3'MGI-5bp-65'Phos-CAAGC-3'MGI-6bp-65'Phos-GACATC-3'MGI-5bp-75'Phos-TCGTG-3'MGI-6bp-75'Phos-CTAGTC-3'MGI-5bp-85'Phos-GTACG-3'MGI-6bp-85'Phos-CGATCG-3'MGI-5bp-95'Phos-CGAGT-3'MGI-6bp-95'Phos-CATTGC-3'MGI-5bp-105'Phos-GCACT-3'MGI-6bp-105'Phos-CTGATG-3'MGI-5bp-115'Phos-TACCG-3'MGI-6bp-115'Phos-CAACTG-3'MGI-5bp-125'Phos-GTCAG-3'MGI-6bp-125'Phos-CTCTGT-3'MGI-5bp-135'Phos-GACTC-3'MGI-6bp-135'Phos-GCCTAT-3'MGI-5bp-145'Phos-TGTCC-3'MGI-6bp-145'Phos-GCCTTA-3'MGI-5bp-155'Phos-ACCGA-3'MGI-6bp-155'Phos-...

【专利技术属性】
技术研发人员:唐守运曲艳汪彪胡玉刚郑文莉吴强
申请(专利权)人:纳昂达南京生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:江苏,32

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