外排体引导的癌症治疗制造技术

使用由外排体获得的信息监测患者治疗的系统和方法，其中在肿瘤外的生物流体中的外排体中跟踪从肿瘤中识别的治疗靶标。

Exosome-guided cancer treatment

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】外排体引导的癌症治疗本申请要求2016年6月21日提交的序列号为62/352753的美国临时专利申请的优先权。
本专利技术的领域是通过外排体监测癌症的治疗，尤其是通过外排体的蛋白质分析，其中蛋白质与已知为促使生长、转移和/或增殖的突变相关。专利技术背景背景描述包括可用于理解本专利技术的信息。本文提供的任何信息均不承认为是现有技术或与当前要求保护的专利技术相关，或者明确或暗含地引用的任何出版物不承认为是现有技术。本文中的所有出版物均通过引用并入，如同每个单独的出版物或专利申请被特别地和单独地指出通过引用并入。如果并入的参考文献中术语的定义或用法与本文提供的该术语的定义不一致或相反，则适用本文提供的该术语定义而不适用该术语在该参考文献中的定义。组学分析逐渐成为在治疗各种疾病、尤其是癌症时确定临床相关目标的工具。虽然组学分析能够提供对患病组织和潜在治疗选择的关键理解，但监测治疗进展或成功通常是不可行的，因为这种监测需要频繁地对患病组织重新取样。或者，在一些情况下，外排体可用作活组织切片的替代物，因为已知癌细胞大量排出外排体。例如，US8021847和US8476017教导了使用外排体作本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种监测患者治疗的方法，其包括：使用多个组学数据识别患者特异性疾病相关蛋白；确定第一外排体中所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量的至少一个，其中所述第一外排体是在治疗前从患者的生物流体中获得的；其中所述治疗靶向患者特异性疾病相关蛋白；确定第二外排体中所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量的至少一个，其中所述第二外排体是在治疗期间或治疗之后从患者的生物流体中获得的；基于第二外排体中患者特异性疾病相关蛋白的存在和量中的至少一个的确定来更新患者记录。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.06.21 US 62/352,7531.一种监测患者治疗的方法，其包括：使用多个组学数据识别患者特异性疾病相关蛋白；确定第一外排体中所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量的至少一个，其中所述第一外排体是在治疗前从患者的生物流体中获得的；其中所述治疗靶向患者特异性疾病相关蛋白；确定第二外排体中所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量的至少一个，其中所述第二外排体是在治疗期间或治疗之后从患者的生物流体中获得的；基于第二外排体中患者特异性疾病相关蛋白的存在和量中的至少一个的确定来更新患者记录。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个组学数据选自全基因组测序数据、外显子组测序数据、转录组测序数据和蛋白组测序数据。3.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述多个组学数据包括患病组织的组学数据和匹配的正常组织的组学数据。4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中使用途径分析算法来识别所述患者特异性疾病相关蛋白。5.根据权利要求4所述的方法，其中所述途径分析算法是PARADIGM。6.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述患者特异性疾病相关蛋白是过表达的蛋白或突变的蛋白。7.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述患者特异性疾病相关蛋白是激酶、受体、生长因子、转录因子或信号转导相关蛋白，其中所述治疗包括靶向激酶、受体、生长因子、转录因子或信号转导相关蛋白的化学疗法。8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述患者特异性疾病相关蛋白是患者和肿瘤特异性新表位，其中所述治疗包括靶向患者和肿瘤特异性新表位的免疫疗法。9.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其还包括分析在所述第一外排体和第二外排体的至少一个中存在的核酸的步骤，任选地其中所述核酸是双微染色体。10.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中使用质谱反应监测来确定所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量。11.根据权利要求10所述的方法，其中所述质谱反应监测选自选择反应监测、连续反应监测、多反应监测和平行反应监测。12.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中使用非特异性包埋和抗体介导的捕获中的至少一种来分离外排体。13.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物流体是全血、血清、血浆或尿液。14.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中重复确定所述第二外排体中所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量中的至少一个的步骤至少一次。15.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中更新患者记录的步骤包括修改治疗的建议。16.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个组学数据包括患病组织的组学数据和匹配的正常组织的组学数据。17.根据权利要求1所述的方法，其中使用途径分析算法来识别所述患者特异性疾病相关蛋白。18.根据权利要求17所述的方法，其中所述途径分析算法是PARADIGM。19.根据权利要求1所述的方法，其中所述患者特异性疾病相关蛋白是过表达的蛋白或突变的蛋白。20.根据权利要求1所述的方法，其中所述患者特异性疾病相关蛋白是激酶、受体、生长因子、转录因子或信号转导相关蛋白，其中所述治疗包括靶向激酶、受体、生长因子、转录因子或信号转导相关蛋白的化学疗法。21.根据权利要求1所述的方法，其中所述患者特异性疾病相关蛋白是患者和肿瘤特异性新表位，其中所述治疗包括靶向患者和肿瘤特异性新表位的免疫疗法。22.根据权利要求1所述的方法，其还包括分析在所述第一外排体和第二外排体的至少一个中存在的核酸的步骤，任选地其中所述核酸是双微染色体。23.根据权利要求1所述的方法，其中使用质谱反应监测来确定所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量。24.根据权利要求23所述的方法，其中所述质谱反应监测选自选择反应监测、连续反应监测、多反应监测和平行反应监测。25.根据权利要求1所述的方法，其中使用非特异性包埋和抗体介导的捕获中的至少一种来分离外排体。26.根据权利要求1所述的方法，其中所述生物流体是全血、血清、血浆或尿液。27.根据权利要求1所述的方法，其中重复确定所述第二外排体中所述患者特异性疾病相关蛋白的存在和量中的至少一个的步骤至少一次。28.根据权利要求1所述的方法，其中更新患者记录的步骤包括修改治疗的建议。29.一种选择用于监测治疗的外排体标志物的方法，其包括：使用多个组学数据识别患者特异性疾病相关蛋白，以及识别靶向所述患者特异性疾病相关蛋白的治疗组合物；确定外排体中所述患者...

【专利技术属性】
技术研发人员：派翠克·松吉翁，
申请(专利权)人：河谷控股IP有限责任公司，
类型：发明
国别省市：美国,US