The invention discloses a highly affinity polypeptide sequence for porcine circovirus type 2 Cap protein and its application, and the polypeptide sequence is KWWQSWEW. Based on the crystal structure (PDB ID:3R0R) of porcine circovirus type 2 Cap protein, the present invention obtains a polypeptide sequence that can be specifically combined with porcine circovirus type 2 Cap protein through molecular docking virtual screening technology, and its polypeptide sequence is KWWQSWEW, that is, L6 13. The L6 Cap 13 was synthesized by solid-phase reaction and affinity was identified with the L6 protein of porcine circovirus type 2. The equilibrium dissociation constant KD between L6 13 13 and PCV2 Cap protein was 1.28 * 10
【技术实现步骤摘要】
针对猪圆环病毒2型Cap蛋白的高亲和性多肽序列及其应用
本专利技术涉及针对猪圆环病毒2型Cap蛋白的高亲和性多肽序列及其应用,属于多肽设计及靶标蛋白分离纯化领域。
技术介绍
随着科技的不断发展,基于结构的分子对接虚拟筛选技术,作为一种亲和肽理性设计和筛选的重要手段,已成为近年来研究的热点。该方法主要是借助于计算机软件的快速运算实现小分子多肽在靶标蛋白活性位点上的逐一对接,这些小分子多肽来自于事先准备好的虚拟肽库,然后经过连续优化靶标蛋白的空间构象、氨基酸残基侧链等方面,找到小分子多肽与靶标蛋白最优的结合构象,计算出小分子多肽与生物大分子蛋白相结合的方式与亲和力,并且对结果进行打分,根据打分结果挑选出最佳配体,然后将最佳配体进行体外实验验证和筛选。猪圆环病毒2型(procinecircovirustype2,PCV2)是造成猪圆环病毒相关性系统疾病(PCV2-systemicdisease,PCV2-SD)的首要病原,它常与其他病原混合感染引起猪的亚临床感染,对养猪业造成巨大的经济损失。PCV2为圆环病毒科圆环病毒属成员,是一种共价闭合、单股无囊膜的DNA病毒,基因 ...
【技术保护点】
1.针对猪圆环病毒2型Cap蛋白的高亲和性多肽序列,其特征在于,所述的多肽序列为KWWQSWEW。
【技术特征摘要】
1.针对猪圆环病毒2型Cap蛋白的高亲和性多肽序列,其特征在于,所述的多肽序列为KWWQSWEW。2.根据权利要求1所述的针对猪圆环病毒2型Cap蛋白的高亲和性多肽序列,其特征在于,包括以所述的多肽序列为核心,任何对该多肽序列所进行的相应调整或修饰;修饰材料包括但不局限于纳米材料、荧光材料、酶类、生物素...
【专利技术属性】
技术研发人员:张改平,王方雨,邓瑞广,邢广旭,郝俊芳,卢清侠,赵东,滕蔓,柴书军,贾蕊,张浩,
申请(专利权)人:河南省农业科学院,
类型:发明
国别省市:河南,41
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