用于富集低频DNA突变的DNA探针及其应用制造技术

本发明专利技术提出了用于富集低频DNA突变的DNA探针及其应用。该探针具有如下序列的至少之一：1)SEQ ID NO:1～4所示的核苷酸序列，2)与1)相比具有至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少99％同一性的核苷酸序列。该探针可以同时或者分别对待测核酸样品中变异频率极低的突变EGFR S768I，EGFR L861Q，BRAF V600E进行特异性的富集，进而实现上述低频突变的特异性检测。

【技术实现步骤摘要】
用于富集低频DNA突变的DNA探针及其应用
本专利技术涉及生物
，具体地，本专利技术涉及用于富集低频DNA突变的DNA探针及其应用，更具体地，本专利技术涉及用于富集低频DNA突变的DNA探针、探针在制备试剂盒中的用途、试剂盒、富集低频DNA突变的方法以及检测低频DNA突变的方法。
技术介绍
肺癌有很高的发病率和死亡率，它的发病率在美国是第二位，在中国是第一位，死亡率在美国和中国都是第一位。除了吸烟者，很多从未吸烟的人因为遗传和环境的因素也患有肺癌。肺癌患者中有85-90％的病例是非小细胞肺癌。近年来经大量研究，科学家对于这一类肺癌患者所携带的基因突变情况也有了更为清楚的认识。研究表明，肺癌患者的EGFR基因编码区，主要是在外显子18-21上会发生突变，85％-90％的突变都是外显子19上的缺失突变和外显子21上L858R的点突变，这些突变与埃克替尼和吉非替尼等药物的临床疗效有关，即小分子酪氨酸激酶抑制剂能够竞争性抑制ATP与EGFR胞内酪氨酸激酶结构域的结合，进而影响酪氨酸残基的磷酸化，抑制EGFR下游信号转导。此外，一些在肺癌患者人群中低频出现的驱动突变，如EGFR基因20外本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种富集低频DNA突变的DNA探针，其特征在于，所述探针具有如下序列的至少之一：1)SEQ ID NO:1～4所示的核苷酸序列，2)与1)相比具有至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少99％同一性的核苷酸序列。

【技术特征摘要】
1.一种富集低频DNA突变的DNA探针，其特征在于，所述探针具有如下序列的至少之一：1)SEQIDNO:1～4所示的核苷酸序列，2)与1)相比具有至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少99％同一性的核苷酸序列。2.根据权利要求1所述的DNA探针，其特征在于，所述探针具有LNA修饰；任选地，所述探针具有SEQIDNO:1所示的核苷酸序列，从探针的5’端到3’端的方向，所述LNA修饰位于所述探针的第二位核苷酸、第四位核苷酸、第五位核苷酸、第六位核苷酸以及第八位核苷酸上；任选地，所述探针具有SEQIDNO:2所示的核苷酸序列，从探针的5’端到3’端的方向，所述LNA修饰位于所述探针的第三位核苷酸、第四位核苷酸、第五位核苷酸、第七位核苷酸以及第八位核苷酸上；任选地，所述探针具有SEQIDNO:3所示的核苷酸序列，从探针的5’端到3’端的方向，所述LNA修饰位于所述探针的第二位核苷酸、第三位核苷酸、第四位核苷酸、第五位核苷酸、第七位核苷酸、第九位核苷酸、第十位核苷酸以及第十一位核苷酸上；任选地，所述探针具有SEQIDNO:4所示的核苷酸序列，从探针的5’端到3’端的方向，所述LNA修饰位于所述探针的第二位核苷酸、第三位核苷酸、第五位核苷酸、第六位核苷酸、第七位核苷酸、第九位核苷酸、第十位核苷酸以及第十一位核苷酸上；任选地，所述探针5’端具有生物素标记；任选地，所述探针3’端具有磷酸修饰。3.根据权利要求1所述的DNA探针，其特征在于，所述探针具有SEQIDNO:1所示的核苷酸序列，所述探针用于富集EGFR基因20号外显子发生S7681突变的样本；任选地，所述探针具有SEQIDNO:2所示的核苷酸序列，所述探针用于富集EGFR基因21号外显子发生L861Q突变的样本；任选地，所述探针具有SEQIDNO:3或SEQIDNO:4所示的核苷酸序列，所述探针用于富集BRAF基因发生V600E突变的样本。4.权利要求1～3任一项所述的富集低频DNA突变的DNA探针在制备试剂盒中的用途，所述低频DNA突变为癌症相关突变，所述试剂盒用于诊断肺癌或指导用药。5.根据权利要求4所述的用途，其特征在于，...

【专利技术属性】
技术研发人员：林锐，濮悦，
申请(专利权)人：杭州瑞普基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：浙江,33