用于微量FFPE RNA样本评估的方法、试剂盒及应用技术

本申请公开了一种用于微量FFPE RNA样本评估的方法、试剂盒及应用。本申请的用于微量FFPE RNA样本评估方法，包括选取靶标片段，采用靶标片段的特异性引物和探针，对微量FFPE RNA样本进行实时荧光PCR；并采用标准曲线进行相对定量，获得靶标片段的相对浓度和丰度，以此评估微量FFPE RNA样本的可用性。本申请的方法，打破目前主流检测工具2100Bioanalyzer的局限，采用实时荧光PCR和标准曲线进行相对定量，判断其样本质量，与2100Bioanalyzer方法相比，本申请的方法可直接展示靶标片段的丰度和可用性情况，并且，无需额外购买昂贵的毛细管电泳分析设备，成本更低，更易推广和普及。

【技术实现步骤摘要】
用于微量FFPERNA样本评估的方法、试剂盒及应用
本申请涉及核酸样本质量检测领域，特别是涉及一种微量FFPERNA样本质量检测的方法、试剂盒及应用。
技术介绍
随着新一代测序技术NGS的蓬勃发展，转录组测序技术已成为研究基因表达的主要手段。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的必然纽带，是基因功能及结构研究的基础和出发点。通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在特定状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。疾病研究和病理分析中，经手术、穿刺及内窥镜钳取等方式获取的新鲜组织样本离开机体后，经固定、脱水、石蜡包埋等步骤制成石蜡块，称为福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-FixedandParaffin-Embedded，缩写FFPE)样本。FFPE样本再经切片、染色等步骤用于病理形态学诊断。制成的FFPE样本由于其性质稳定，在室温条件下可长期贮存，是病案存档及疾病诊断证据的最有效手段，也是疾病相关分析的主要材料来源。采用FFPE样本进行分子生物学检测是辅助诊断及实现个体化医疗的主要手段。但提取自FFPE样本的RNA样本，本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于微量FFPE RNA样本评估的方法，其特征在于：包括选取靶标片段，采用所述靶标片段的特异性引物和探针，对待测的微量FFPE RNA样本进行实时荧光PCR检测；并采用标准曲线对所述实时荧光PCR检测的结果进行分析，获得所述微量FFPE RNA样本中，靶标片段的相对浓度和相对丰度，以此评估所述微量FFPERNA样本的可用性。

【技术特征摘要】
1.一种用于微量FFPERNA样本评估的方法，其特征在于：包括选取靶标片段，采用所述靶标片段的特异性引物和探针，对待测的微量FFPERNA样本进行实时荧光PCR检测；并采用标准曲线对所述实时荧光PCR检测的结果进行分析，获得所述微量FFPERNA样本中，靶标片段的相对浓度和相对丰度，以此评估所述微量FFPERNA样本的可用性。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述标准曲线由RNA标准品采用与所述微量FFPERNA样本相同的实时荧光PCR扩增获得。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于：所述RNA标准品为UHRR人标准品。4.根据权利要求1-3任一项所述的方法在前列腺癌的微量FFPERNA样本的质量评估中的应用。5.一种前列腺癌的微量FFPERNA样本评估的方法，其特征在于：包括选取前列腺癌的关键基因，采用所述关键基因的特异性引物和探针，对待测的微量FFPERNA样本进行实时荧光PCR检测；并采用标准曲线对所述实时荧光PCR检测的结果进行分析，获得所述微量FFPERNA样本中，前列腺癌相关的基因的相对浓度和相对丰度，以此评估所述微量FFPERNA样本的可用性。6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于：所述前列腺癌的关键基因包括GUSB基因和CDKN1A基因，所述实时荧光PCR检测为两个基因的多重实时荧光PCR。7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于：所述GUSB基因的特异性引物的上下游引物分别为SeqIDNo.1所示序列和SeqIDNo.2所示序列，GUSB基因的特异性探针为SeqIDNo.3所示序列；所述CDKN1A...

【专利技术属性】
技术研发人员：宗亮，陈翠，刘红笑，徐怀前，
申请(专利权)人：深圳华大基因股份有限公司，
类型：发明
国别省市：广东,44