中国南瓜转录组SSR分子标记引物及其应用制造技术

本发明专利技术提供中国南瓜转录组SSR分子标记引物及其应用，所述分子标记引物包含18对引物，其序列分别如SEQ ID NO.1‑36所示。利用Primer 3.0共设计出6489对SSR引物。从92对有效扩增引物中随机选择30对引物,对30个中国南瓜种质进行多态性验证分析，其中18对(占60%)引物表现稳定可重复的多态性。利用UPGMA作图，将30份供试材料分为2类。利用中国南瓜转录组数据进行SSR标记开发能获得较高频率的SSR位点，且类型丰富，为中国南瓜遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更丰富可靠的标记选择。

SSR Molecular Marker Primers of Pumpkin Transcriptome from China and Their Application

The present invention provides SSR molecular marker primers of Chinese pumpkin transcriptome and their applications. The molecular marker primers contain 18 pairs of primers whose sequences are shown as SEQ ID NO.1 36, respectively. A total of 6489 pairs of SSR primers were designed using Primer 3.0. Thirty pairs of primers were randomly selected from 92 pairs of valid amplification primers. The polymorphism of 30 Chinese pumpkin germplasms was verified and analyzed. Among them, 18 pairs (60%) showed stable and repeatable polymorphism. Using UPGMA mapping, 30 materials were divided into two categories. Using transcriptome data of Chinese pumpkin, SSR loci with high frequency and abundant types can be obtained, which provides more abundant and reliable marker selection for genetic diversity analysis and genetic map construction of Chinese pumpkin.

【技术实现步骤摘要】
中国南瓜转录组SSR分子标记引物及其应用
本专利技术属于生物
，具体涉及中国南瓜转录组SSR分子标记引物及其应用。
技术介绍
中国南瓜(CucurbitamoschataDuch.)为葫芦科(Cucurbitaceae)南瓜属(Cucurbitaspp.)中3个主要栽培种之一，起源于美洲大陆，16世纪中叶经东南亚传入中国。中国南瓜适应性强，分布地域广，产品营养丰富，是我国人民喜爱的传统蔬菜，在我国大范围的种植，是中国南瓜最大的生产和消费国。中国南瓜种类繁多，品质各异，多样化特点十分突出。对中国南瓜种质资源的遗传多样性研究，有利于中国南瓜种质资源的收集、保存、鉴定、创新和合理利用。DNA分子标记是鉴定种质资源遗传多样性的重要手段，也是一种重要的辅助育种技术。目前，为了从分子水平了解中国南瓜种质资源的遗传多样性，许多学者用RAPD、ISSR、SRAP、AELP等不同的分子标记方法对中国南瓜种质资源遗传多样性进行了研究。褚盼盼等利用RAPD分子标对70份来自我国不同地区的中国南瓜种质进行遗传多样性和亲缘关系分析，其聚类结果与形态特征有一定的相关性。云天海等应用ISSR和SRAP标记技本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.中国南瓜转录组SSR分子标记引物，其特征在于：所述分子标记引物包含18对引物，其序列分别如SEQ ID NO.1‑36所示。

【技术特征摘要】
1.中国南瓜转录组SSR分子标记引物，其特征在于：所述分子标记引物包含18对引物，其序列分别如SEQIDNO.1-36所示。2.如...

【专利技术属性】
技术研发人员：朱海生，王彬，叶新如，刘建汀，李永平，陈敏氡，林珲，温庆放，
申请(专利权)人：福建省农业科学院作物研究所，
类型：发明
国别省市：福建,35