一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记，所述萝卜抗根肿病QTL有5个位点，分别是RsCr1、RsCr2、RsCr3、RsCr4和RsCr5，所述分子标记的正向引物和反向引物序列分别为SEQ ID NO.1和2。本发明专利技术还公开了此SSR分子标记的获得方法，包括以下步骤：简化基因组测序，萝卜高密度SNP遗传图谱的构建，萝卜F3家系抗根肿病表型鉴定，萝卜抗根肿病QTL分析，SSR分子标记的开发及筛选。可直接利用本发明专利技术提供的SSR分子标记鉴定萝卜的抗根肿病和分子标记辅助育种，在萝卜根肿病防治研究中具有重要意义。

A SSR Molecular Marker Linked to the QTL of Radish Resistance to Root Swollen Disease and Its Application

The present invention discloses a SSR molecular marker linked to radish root swelling disease resistance QTL. The radish root swelling disease resistance QTL has five loci, namely RsCr1, RsCr2, RsCr3, RsCr4 and RsCr5. The sequence of the positive and reverse primers of the molecular marker are SEQ ID NO.1 and 2, respectively. The invention also discloses the method for obtaining the SSR molecular marker, including the following steps: simplified genome sequencing, construction of high-density SNP genetic map of radish, identification of root swelling resistance phenotype of F3 family of radish, analysis of root swelling resistance QTL of radish, development and screening of SSR molecular markers. The SSR molecular marker provided by the invention can be directly used to identify the resistance of radish to radish root swelling disease and molecular marker assisted breeding, which is of great significance in the prevention and control of radish root swelling disease.

【技术实现步骤摘要】
一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记及应用
本专利技术涉及分子生物学领域，特别涉及与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记及其应用。
技术介绍
近年来，根肿病(Clubrootdisease)在我国东北地区、西南地区、长江中上游等地均有发现，并且发病区域有进一步扩大的趋势。我国大部分十字花科作物产区受到了根肿病的危害。根肿病现已成为我国芸薹属作物的主要病害之一。在世界各地每年因根肿病的危害导致芸薹属作物减产多达10％-15％(Dixon，2009)。我国萝卜根肿病发病日渐严重。萝卜根肿病的防治已刻不容缓。总结国内外根肿病的防治一般有作物轮作，栽培抗病品种，化学药剂，生物药剂，或者这几种方法综合使用。Cathcart等(2006)报道了油菜与谷物和豆类3年的轮作可以有效的防治油菜根肿病发病造成的减产，也有油菜与谷物进行2年的轮作报道(Hartman2012).氟啶胺和氰霜唑可以有效的防治十字花科根肿病，可减轻大白菜根肿病的发病(Townley&Fox，2003；Mitanietal.2003；Gossenetal.2013)。现有的生物防治、化学防治、农业防治措施虽然在本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记，其特征在于：所述萝卜抗根肿病QTL有5个位点，分别是RsCr1、RsCr2、RsCr3、RsCr4和RsCr5；所述SSR分子标记为fold92946_4806，所述分子标记的正向引物和反向引物序列分别为SEQ ID NO.1和2。

【技术特征摘要】
1.一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记，其特征在于：所述萝卜抗根肿病QTL有5个位点，分别是RsCr1、RsCr2、RsCr3、RsCr4和RsCr5；所述SSR分子标记为fold92946_4806，所述分子标记的正向引物和反向引物序列分别为SEQIDNO.1和2。2.根据权利要求1所述的一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记，其特征在于：所述RsCr1位于第8条连锁群，物理位置为16609003-27278934，RsCr2、RsCr3、RsCr4和RsCr5位于第9条连锁群，物理位置分别为9721983-10350983、10350983-12019236、12031702-12575858、12999688-22628845。3.根据权利要求1所述的一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记，其特征在于：所述SSR分子标记位于第9条染色体上。4.一种与萝卜抗根肿病QTL连锁的SSR分子标记的开发方法，其特征在于：包括以下步骤：S1、简化基因组测序：萝卜抗病材料BJJ和感病材料XNQ杂交，F1代自交获得F2群体及其F2:3家系，利用CTAB方法提取F2群体及亲本幼嫩叶片的DNA，采用RAD-seq进行基因组测序；S2、萝卜高密度SNP遗传图谱的构建：测序后数据经质控、数据过滤、对比到参考基因组及亲本间多态性筛选获得SNP位点，使用Joinmap4.0软件进行遗传图谱的构...

【专利技术属性】
技术研发人员：甘彩霞，邓晓辉，崔磊，袁伟玲，於校青，
申请(专利权)人：湖北省农业科学院经济作物研究所，
类型：发明
国别省市：湖北,42