紫菜DNA指纹图谱及建立方法和应用技术

一种紫菜ＤＮＡ指纹图谱，其特征在于：为由“１”和“０”组成的句子，通过数码１００１１０００００１，１００１０１０１００１，１０１１１１０１０００，１０１１１００１１０１，１００１１０００１０１，１０１１１１０１１００，１０１１００１０１００，１００１０００００００，１００１０１００１００，１０１１０００００００，１００１０１０１０１０，１１０１１０００００１，０１００１００１００１，１００１００１１０１０，１００１１００１０１１，１００００１０００００，１００１０１０００００，１００１０００１０００，１００１０１１００００，１００１０１１１０００，１０１１０１０００１０，００１００００００００，１０１１１１０００００，０００１０１０００００，１００００１０１１００，１００１１００１００１及０００１１０００１０１以阵列形式表现出来。（*该技术在2023年保护过期，可自由使用*）

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及种子鉴定技术，具体地说是一种紫菜DNA指纹图谱及建立方法和应用。
技术介绍
紫菜(Porphyra)是我国最重要的海藻资源之一，年产值居各种经济海藻之首，我国紫菜总产量居世界首位。但是紫菜外形表征简单，可用于种质鉴定的特征有限，因此，只根据形态特征对紫菜叶状体进行种质鉴定有一定困难。紫菜的自由丝状体是二倍体阶段，是进行遗传和育种研究的主要材料，但是自由丝状体无法从外观、形态进行鉴定，专门以自由丝状体为材料研究紫菜种质鉴定的文章还很少。随着分子生物学研究水平的快速发展，分子标记技术已经广泛地应用于植物的遗传研究，分子标记辅助育种已经在水稻、小麦和棉花等重要经济作物的研究和生产中得到应用，并取得明显的经济效益。其中RAPD技术操作方便，是一种实用有效的分子标记技术，已经用于藻类的遗传多样性分析，在海带、紫菜、裙带菜和江蓠等研究中已有报道，但是建造DNA指纹图谱、并利用DNA指纹图谱技术进行种质鉴定目前尚未见有研究报道。另外，DNA指纹分析技术在法医鉴定上已被认为是最有力的方法，在粮食作物种子鉴定方面也已广泛应用，但在海藻种质鉴定方面尚未被应用。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种能用于种质鉴定的紫菜DNA指纹图谱及建立方法和应用。为了实现上述目的，本专利技术技术方案如下紫菜DNA指纹图谱，为由“1”和“0”组成的句子，通过数码10011000001，10010101001，10111101000，10111001101，10011000101，10111101100，10110010100，10010000000，10010100100，10110000000，10010101010，11011000001，01001001001，10010011010，10011001011，10000100000，10010100000，10010001000，10010110000，10010111000，10110100010，00100000000，10111100000，00010100000，10000101100，10011001001及000110001011以阵列形式表现出来；其中所述数字“1”表示图谱中某个位置上有扩增带存在，数字“0”表示在某个位置上没有扩增条带存在。其紫菜DNA指纹图谱的建立方法，按如下步骤操作1)紫菜细胞系的DNA的提取及纯化；2)用获得高纯度紫菜DNA为模板进行RAPD分析；3)选择有代表性的多态性RAPD扩增11条条带，根据这11条条带的有、无构建供试材料DNA指纹图谱；其中所述紫菜各个细胞系取其自由丝状体阶段；DNA指纹图谱中每个紫菜材料都有其特异的DNA指纹，可以与其它供试材料逐个区分开来；所述RAPD扩增中采用的引物为OPJ-18、OPC-04和OPX-06；所述紫菜细胞系优选为条斑紫菜(P.yezoensis)，坛紫菜(P.haitanensis)，少精紫菜(P.oligospermatangia)，甘紫菜(P.tenera)，半叶紫菜(P.katadai.var.hemiphylla)，列紫菜(P.seriata)或生活史特异的贝壳紫菜(P.tenuipedalis)；所述紫菜自由丝状体可以为条斑紫菜(P.yezoensis)，坛紫菜(P.haitanensis)，少精紫菜(P.oligospermatangia)，甘紫菜(P.tenera)，半叶紫菜(P.katadai.var.hemiphylla)，列紫菜(P.seriata)，生活史特异的贝壳紫菜(P.tenuipedalis)或野生紫菜(P.oligospermatangia和P.katadai var.hemiphylla)。紫菜DNA指纹图谱用于紫菜的种质鉴定。本专利技术具有如下优点1.本专利技术创建了紫菜DNA指纹图谱，公开了用DNA指纹分析技术对紫菜进行种质鉴定的研究结果，其建立方法能从遗传本质上对紫菜进行种质鉴定，因此准确、可靠，具有法律效应。2.采用本专利技术，当DNA指纹图谱一旦建立以后，在对某个样品进行真实检测时，用目前广泛应用的快速、微量DNA提取法提取待测样品的DNA，用提取的DNA作为模板，进行RAPD分析，在几个小时内就可以知道该DNA指纹，因此，就能迅速判断出它的真实性。3.采用本专利技术构建该DNA指纹图谱所用的样品可以根据需要不断增加，并对指纹进行更新，以满足发展的需要。4.本专利技术建造了紫菜的DNA指纹图谱，并利用该DNA指纹图谱技术可对紫菜进行种质鉴定，这在海藻种质鉴定的应用方面开了一个先例。5.由于本专利技术DNA指纹图谱是用图的形式表式，看起来比较直观、易懂；并由于转换成了数码形式，便于计算机识读和分析。附图说明图1为本专利技术紫菜细胞系的DNA指纹图谱；其中其横坐标为分别为本专利技术一个实施例中采用的27个紫菜细胞系的编号(详见表1)；纵坐标为构建该DNA指纹图所用的11条条带编号。具体实施例方式下面结合附图和实施例对本专利技术作进一步详细说明。实施例1本实施例采用收集到的27个具有广泛代表性的紫菜细胞系为供试材料，用各个细胞系的自由丝状体提取DNA，进行RAPD分析，建立它们的DNA指纹图谱，再用于对这27个材料进行种质鉴定，并为其它海藻的种质鉴定提供一条可供借鉴的有效新途径。建立紫菜DNA指纹图谱的具体操作如下1、选用的实验材料本实施例采用如表1所示27个紫菜材料，其中条斑紫菜(P.yezoensis)15个，坛紫菜(P.haitanensis)6个，少精紫菜(P.oligospermatangia)2个，甘紫菜(P.tenera)1个，半叶紫菜(P.katadai.var.hemiphylla)1个，列紫菜(P.seriata)1个和生活史特异的贝壳紫菜(P.tenuipedalis)1个，选材以生产中广泛应用的优质紫菜为主，还包括一些野生紫菜(P.oligospermatangia和P.katadai var.hemiphylla)和一些从国外引进的紫菜材料，具有较好的代表性。本实施例以27个紫菜细胞系的自由丝状体为材料提取DNA，建立了对这27个供试紫菜细胞系进行种质鉴定的DNA指纹图谱。表1 紫菜细胞系的来源和特性种类 编号 特性 来源Y9101高产，耐高温，抗病性强 江苏连云港海区Ymg9602 Y9602的绿色突变体 江苏海洋水产研究所Y9430质优，丝状体成熟较难，单孢子少 江苏南通海区Y9502耐高温，抗逆性强，单孢子少 福建海区Y9830保持系 江苏南通海区Y92-1研究材料 国外引进Y94-1研究材料 国外引进条斑紫菜Y95-1研究材料 国外引进P.yezoensisYqd-2研究材料 江苏如东海区Ynt-6高产，适温广，抗逆性强 江苏连云港海区Ynt-8质优，适温广，抗逆性强，藻体薄 江苏海区Yqd-6研究材料 江苏如东海区Yqd-8研究材料 青岛海区Ysh-6Y92-1的绿色突变体 上海水大Y92-3研究材料 国外引进 H9208 优质，丝状体成熟 福建南日岛海区H9161 野生种的栽培种质 福建海区坛紫菜H182杂种 福建海区P.haitanensis Hqd-1 研究材料 浙江本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：翁曼丽，王斌，金德敏，马家海，许璞，柳波，
申请(专利权)人：中国科学院遗传与发育生物学研究所，中国科学院海洋研究所，
类型：发明
国别省市：