与水稻紫叶鞘基因PSH1(t)连锁的分子标记及其获得方法和应用技术

本发明专利技术公开了与水稻紫叶鞘基因ＰＳＨ１（ｔ）连锁的分子标记及其获得方法和应用，属于分子遗传学领域。提取水稻无紫叶鞘品种香粳９４０７、紫叶鞘品种ＲＩ５１及其杂交获得的Ｆ↓［２］分离群体单株ＤＮＡ。利用３６０对ＳＳＲ分子标记对上述两个亲本进行ＰＣＲ产物多态性筛选，然后依次对Ｆ↓［２］有紫叶鞘和无紫叶鞘ＤＮＡ混合池，Ｆ↓［２］群体的各个体筛选紫叶鞘基因连锁的分子标记。在第１染色体上构建了紫叶鞘基因ＰＳＨ１（ｔ）的分子遗传图谱。通过紫叶鞘主基因的分子标记来检测紫叶鞘品种ＲＩ５１及其衍生品种（系）中是否含有该基因，大大提高紫叶鞘水稻的选择效率。本发明专利技术专用于水稻紫叶鞘基因的筛选，并用于克隆紫叶鞘基因ＰＳＨ１（ｔ）的研究。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
与水稻紫叶鞘基因ＰＳＨ１（ｔ）连锁的分子标记，其特征在于，　用标记引物ＲＭ７２０２　左端引物序列为：ＡＡＣＧＴＧＧＡＧＧＣＴＣＣＴＴＴＴＴＣ　右端引物序列为：ＴＴＧＣＴＡＴＴＡＧＴＴＧＧＴＧＧＧＧＣ　标记引物ＲＭ７３１８　左端引物序列为：ＣＣＡＴＡＧＣＴＧＣＧＴＧＡＴＴＣＴＣＣ　右端引物序列为：ＡＧＡＴＧＡＡＡＣＴＧＧＣＡＣＧＴＧＴＧ　标记引物ＲＭ３４７５　左端引物序列为：ＧＴＣＧＧＴＴＴＧＣＣＴＡＧＴＴＧＡＧＣ　右端引物序列为：ＴＴＣＣＴＣＧＧＴＧＴＡＴＧＧＧＴＣＴＣ　标记引物ＲＭ４８８　左端引物序列为：ＣＡＧＣＴＡＧＧＧＴＴＴＴＧＡＧＧＣＴＧ　右端引物序列为：ＴＡＧＣＡＡＣＡＡＣＣＡＧＣＧＴＡＴＧＣ　标记引物ＲＭ３１４３　左端引物序列为：ＡＧＣＣＴＧＧＡＴＡＡＧＡＴＧＧＴＴＣＧ　右端引物序列为：ＣＧＡＧＡＡＧＡＣＣＣＡＧＴＴＴＣＴＧＣ　标记引物ＲＭ８２６０　左端引物序列为：ＡＡＴＣＴＡＡＣＧＴＴＴＧＡＣＴＡＴＣＣＡＴＣ　右端引物序列为：ＴＣＴＡＣＣＡＧＴＡＣＴＣＣＣＴＴＣＡＣＣ　标记引物ＲＭ２４６　左端引物序列为：ＧＡＧＣＴＣＣＡＴＣＡＧＣＣＡＴＴＣＡＧ　右端引物序列为：ＣＴＧＡＧＴＧＣＴＧＣＴＧＣＧＡＣＴ　标记引物ＲＭ１２８　左端引物序列为：ＡＧＣＴＴＧＧＧＴＧＡＴＴＴＣＴＴＧＧＡＡＧＣＧ　右端引物序列为：ＡＣＧＡＣＧＡＧＧＡＧＴＣＧＣＣＧＴＧＣＡＧ　扩增水稻基因组ＤＮＡ获得的多态性片段大小约为１５７ｂｐ、１０３ｂｐ、１５０ｂｐ、１７７ｂｐ、９８ｂｐ、１９２ｂｐ、１１６ｂｐ和１５７ｂｐ，即为水稻紫叶鞘基因ＰＳＨ１（ｔ）连锁的分子标记ＲＭ７２０２标记、ＲＭ７３１８标记、ＲＭ３４７５标记、ＲＭ４８８标记、ＲＭ３１４３标记、ＲＭ８２６０标记、ＲＭ２４６标记和ＲＭ１２８标记，其中标记Ｍ４８８，ＲＭ８２６０，ＲＭ３４７５位于ＰＳＨ１（ｔ）靠近短臂的一侧，与ＰＳＨ１（ｔ）的遗传距离分别为７．１ｃＭ、５．８ｃＭ和２．０ｃＭ；标记ＲＭ７２０２，ＲＭ７３１８，ＲＭ３１４３，ＲＭ２４６和ＲＭ１２８位于ＰＳＨ１（ｔ）的另一侧，与ＰＳＨ１（ｔ）的遗传距离分别为１．１ｃＭ、１．４ｃＭ，４．９ｃＭ、５．８ｃＭ和１８．９ｃＭ，离ＰＳＨ１（ｔ）基因最近的两侧标记分别为ＲＭ３４７５和ＲＭ７２０２。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：姚方印，李广贤，姜明松，王文英，李润芳，张晓东，丁汉风，
申请(专利权)人：山东省农业科学院高新技术研究中心，
类型：发明
国别省市：88[中国|济南]