一种环脂肽类化合物生物合成基因簇及其激活方法与应用技术

本发明专利技术公开了一种环脂肽类化合物生物合成基因簇及其激活方法与应用。环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第2972‑101763位核苷酸序列所示。本发明专利技术的环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇相关的所有基因和蛋白信息，可以帮助人们理解环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成机制，为进一步遗传改造提高了材料和知识。另外本发明专利技术为通过操控调控基因激活沉默基因簇的表达提供了依据，并丰富了天然产物生物合成基因簇库，为药物先导化合物的发现提供了实体。

Biosynthesis gene cluster of cyclopeptide compound and its activation method and Application

The invention discloses a kind of biosynthesis gene cluster of cyclopeptide compound and its activation method and application. The biosynthetic gene cluster of cyclic lipopeptide compounds Totopotensamides, its nucleotide sequence is shown as SEQ ID NO.1 2972nd 101763 nucleotide sequence. All the gene and protein information related to the biosynthetic gene cluster of the cyclo lipopeptide compound Totopotensamides of the invention can help people understand the biosynthesis mechanism of the cyclic lipopeptide compound Totopotensamides, and improve the materials and knowledge for further genetic transformation. In addition, the present invention provides a basis for controlling the expression of gene silencing genes by activating the regulatory genes, and enriching the natural product biosynthetic gene cluster library, which provides entities for the discovery of drug leading compounds.

【技术实现步骤摘要】
一种环脂肽类化合物生物合成基因簇及其激活方法与应用
：本专利技术属于微生物基因工程领域，具体涉及一种环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇及其激活方法与应用。
技术介绍
：近年来，随着基因组测序技术发展和广泛应用，发现几乎每一株放线菌都有大量的次级代谢产物生物合成基因簇，然而大部分处于沉默的状态，还没有发现其编码的产物。通过改变发酵条件、核糖体工程、启动子工程、操控调控基因和组合生物合成等方法，能够激活沉默基因簇的表达，从而产生新的次级代谢产物。
技术实现思路
：本专利技术的目的是提供一种环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇及其激活方法与应用。本专利技术的环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇，是在分离自中国南海水深880米沉积物中的链霉菌Streptomycessp.SCSIO02999中发现，是一个PKS/NRPS杂合的生物合成基因簇，该基因簇全长92kb(其核苷酸序列如SEQIDNO.1的第2972-101763位核苷酸序列所示)且处于沉默的状态；通过操控其生物合成中的调控基因，激活了该基因簇的表达，并产生了本文档来自技高网...

【技术保护点】
环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第2972‑101763位核苷酸序列所示。

【技术特征摘要】
1.环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇，其核苷酸序列如SEQIDNO.1的第2972-101763位核苷酸序列所示。2.权利要求1所述的环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇在制备环脂肽类化合物Totopotensamides中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，敲除环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇中的totR5基因，激活环脂肽类化合物Totopotensamides生物合成基因簇，使其合成化合物TotopotensamideA。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，敲除链霉菌Streptomycessp.SCSIO02999的基因组中的环脂肽类化合物Totopotensamides生物合成基因簇中的totR5基因和xiaP基因，以及超表达totR1基因使链霉菌Streptomycessp.SCSIO02999产生化合物TotopotensamideA和化合物TotopotensamideC。5.一种环脂肽类化合物Totopotensamides生物合成基因簇的激活方法，其特征在于，敲除环脂肽类化合物Totopotensamides生物合成基因簇中的totR5基因，激活环脂肽类化合物Totopotensamides生物合成基因簇，使其合成化合物TotopotensamideA。6.根据权利要求5所述的激活方法，其特征在于，敲除链霉菌Streptomycessp.SCSIO02999的基因组中的环脂肽类化合物Totopotensamides生物合成基因簇中的totR5基因，以及敲除xiaP基因和/或totR3基因，使链霉菌Streptomycessp.SCSIO02999产生化合物TotopotensamideA。7.根据权利要求6所述的激活方法，其特征在于，在链霉菌Streptomycessp.SCSIO02999中超表达totR1基因。8.根据权利要求7所述的激活方法，其特征在于，敲除链霉菌Streptomycessp.SCSIO02999的基因组中的环脂肽类化合物Totopotensamides生物合成基因簇中的totR5基因和xiaP基因，以及超表达to...

【专利技术属性】
技术研发人员：张长生，陈瑞东，张庆波，谭彬，郑六眷，李慧贤，朱义广，
申请(专利权)人：中国科学院南海海洋研究所，
类型：发明
国别省市：广东,44