大白菜冷相关转录因子蛋白编码序列制造技术

技术编号:1722892 阅读:134 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
一种大白菜冷相关转录因子蛋白编码序列,其特征在于,包括:编码具有大白菜冷相关转录因子蛋白质活性的多肽的核苷酸序列,而且所述的核苷酸序列与SEQ  ID  NO.3中从核苷酸第70-456位的核苷酸序列有至少70%的同源性;或者所述的核苷酸序列能在45-55℃条件下与SEQ  ID  NO.3中从核苷酸第70-456位的核苷酸序列杂交。(*该技术在2023年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及的是一种蛋白编码序列,特别是一种大白菜冷相关转录因子蛋白编码序列,属于基因工程领域。
技术介绍
低温是限制我国作物地理分布和产量的重要因素,在生理上造成根系对叶片水分供应的减少,导致作物的生长延迟,严重地影响了作物的品质和产量。当植物受到低温胁迫后,植物体内的一些内源激素会发生显著的变化,从而进一步引发细胞骨架排列的改变,以便提高作物的抗低温的能力。当前,一些低温转录因子在提高作物抗低温胁迫方面起着重要作用,而且在试验中取得了良好的实验结果。为此,我们选定克隆低温转录因子作为提高作物抗低温胁迫的主攻方向。转录因子是一些能够与特定基因的转录区域结合并能诱导这些基因表达的特异蛋白,它往往调控的是很多基因或者是基因家族。甘蓝型油菜中的Bn26转录因子就是一个低温胁迫的转录因子,它能够明显地提高植物的抗低温能力。利用RACE(Rapid Amplificationof cDNA Ends,cDNA末端迅速扩增)PCR技术我们从大白菜中克隆了该基因,根据GeneBank的搜索结果,将该基因命名为冷相关转录因子。在对现有文献的分析中,虽然“Plant Physiol(植物生理学),1993,101171-177”对甘蓝型油菜的低温转录蛋白的功能已经做了充分肯定,指出该基因在低温胁迫下能够增强表达,但没有转基因植株的抗冷性鉴定的实验结果,至今尚未发现与本专利技术主题有密切联系文献的报道。
技术实现思路
本专利技术的目的在于克服现有技术中的不足,提供一种大白菜冷相关转录因子蛋白编码序列。本专利技术公开了与大白菜低温转录因子密切相关的蛋白的氨基酸序列以及大白菜冷相关转录因子基因的核酸序列,及其在利用转基因技术改良植物抗低温的应用。本专利技术是通过以下技术方案实现的在本专利技术所分离出的DNA分子,该分子包括编码具有大白菜冷相关转录因子蛋白质活性的多肽的核苷酸序列,而且所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核苷酸第70-456位的核苷酸序列有至少70%的同源性;或者所述的核苷酸序列能在45-55℃条件下与SEQ ID NO.3中从核苷酸第70-456位的核苷酸序列杂交。较佳地,所述的序列编码具有SEQ ID NO.3所示的氨基酸序列的多肽。更佳地,所述的序列具有SEQ ID NO.3中从核苷酸第70-456位的核苷酸序列。本专利技术分离出的大白菜低温转录因子相关蛋白质多肽,它包括具有SEQ ID NO.3氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段,或其活性衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO.3序列的多肽。本专利技术所提供的载体,它包含上述的DNA分子。一种核酸分子,它包含所述的DNA分子中8-100个连续核苷酸。本专利技术用上述载体转化的宿主细胞,它是真核细胞。在实例中该宿主细胞是拟南芥。在本专利技术中,“分离的”、“纯化的”DNA是指,该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来,还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组分分开,而且已经与在细胞中伴随其的蛋白质分开。在本专利技术中,术语“大白菜低温转录因子蛋白(或多肽)编码序列”指编码具有大白菜低温转录因子蛋白活性的多肽的核苷酸序列,如SEQ ID NO.3中第70-456位核苷酸序列及其简并序列。该简并序列是指,位于SEQ ID NO.3序列的编码框第70-456位核苷酸中,有一个或多个密码子被编码相同氨基酸的简并密码子所取代后而产生的序列。由于密码子的简并性,所以与SEQ ID NO.3中第70-456位核苷酸序列同源性低至约70%的简并序列也能编码出SEQ ID NO.3所述的序列。该术语还包括能在中度严紧条件下,更佳的在高度严紧条件下与SEQ ID NO.3中从核苷酸第70-456位的核苷酸序列杂交的核苷酸序列。该术语还包括与SEQ ID NO.3中从核苷酸第70-456位的核苷酸序列的同源性至少70%,较佳地至少80%,更佳地至少90%,最佳地至少95%的核苷酸序列。该术语还包括能编码具有与天然的大白菜低温转录因子相同功能的蛋白的SEQ ID NO.3中开放阅读框序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于)若干个(通常为1-90个,较佳地1-60个,更佳地1-20个,最佳地1-10个)核苷酸的缺失、插入和/或取代,以及在5’和/或3’端添加数个(通常为60个以内,较佳地为30个以内,更佳地为10个以内,最佳地为5个以内)核苷酸。在本专利技术中,术语“大白菜低温转录因子”指具有大白菜低温转录因子蛋白活性的SEQ ID NO.3序列的多肽。该术语还包括具有与天然大白菜低温转录因子相关相同功能的、SEQ ID NO.4序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于)若干个(通常为1-50个,较佳地1-30个,更佳地1-20个,最佳地1-10个)氨基酸的缺失、插入和/或取代,以及在C末端和/或N末端添加一个或数个(通常为20个以内,较佳地为10个以内,更佳地为5个以内)氨基酸。例如,在本领域中,用性能相近或相似的氨基酸进行取代时,通常不会改变蛋白质的功能。又比如,在C末端和/或N末端添加一个或数个氨基酸通常也不会改变蛋白质的功能。该术语还包括大白菜低温转录因子相关蛋白的活性片段和活性衍生物。本专利技术的大白菜低温转录因子多肽的变异形式包括同源序列、保守性变异体、等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧条件下能与大白菜低温转录因子相关DNA杂交的DNA所编码的蛋白、以及利用大白菜低温转录因子多肽的血清获得的多肽或蛋白。在本专利技术中,“大白菜低温转录因子保守性变异多肽”指与SEQ ID NO.3的氨基酸序列相比,有至多10个,较佳地至多8个,更佳地至多5个氨基酸性质相似或相近的氨基酸所替换而形成多肽。这些保守性变异多肽最好根据表1进行替换而产生。表1 表299% identity in 339 nt overlapQuery124 agcggcgtagccaagcagagcggcgttggcgccgtcagatttggccggaaaactgagctc 183||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||Sbjct107 agcggcgtagccaagcagagcggcgttggcgccgtcagatttggccggaaaactgagctc 166S G V A K Q S G V G A V R F G R K T E LQuery184 gttgtcgtcgctcagcgcaagaagtcgttgatctacgccgagaaaggtgatggaaacatt 243||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||Sbjct167 gttgtcgtcgctcagcgcaagaagtcgttgatctacgccgagaaaggtgatggaaacatt 226V V V A Q R K K S L I Y A E K G D G N IQuery244 ctcgatgacatcaatgaggccacaaagag本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李柱刚唐克轩赵凌侠孙小芬邱承祥
申请(专利权)人:上海交通大学
类型:发明
国别省市:

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