生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置制造方法及图纸

本发明专利技术涉及图像处理和神经科学领域，具体涉及一种生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置。旨在解决无法在生物组织相邻切片显微图像间寻找到真实可靠的对应点信息的问题。为此目的，本发明专利技术中提出了一种生物组织序列切片显微图像的配准方法，包括：获取生物组织序列切片显微图像中各相邻切片显微图像的对应点；调整所获取的各对应点的位置；依据调整后的各对应点的位置，对生物组织序列切片显微图像进行图像形变。通过本发明专利技术可以找到相邻切片显微图像之间真实可靠的对应点信息，从而保证了生物组织序列切片显微图像配准的精度。

【技术实现步骤摘要】
生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置
本专利技术涉及图像处理和神经科学领域，具体涉及一种生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置。
技术介绍
目前，基于电镜成像技术的生物组织序列切片显微图像三维重建方法主要包括序列断面成像方法和序列切片成像方法。其中，序列断面成像方法的步骤主要包括：将生物组织样品固定在电镜样品腔室内，在对其表明成像后通过钻石刀切削或采用离子束轰击的方式去除十纳米厚度的样品表面，再次对处理过的样品进行成像，重复上述过程直至获得所有样品的图像。通过上述成像方法获得的图像序列能够很容易进行配置，但是在成像过程中无法保留样品，进而无法对样品进行二次成像。序列切片成像方法是通过超薄切片机将生物组织样品切割为数十纳米厚度的切片，并收集在导电载体上，再放到电镜中进行成像。该方法能够保留切片并多次利用，且可以通过多台电镜并行成像的方式加速图像获取，相比于序列断面成像方法，序列切片成像方法更加适用于大样品块的高精度重建。但序列切片成像方法由于在制样、切片、收集和成像过程中会出现不同程度的组织形变，以及褶皱、撕裂等问题，因此需要更为复杂的配准算法将这些切片显微图像进行三维重建。序列本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种生物组织序列切片显微图像的配准方法，其特征在于，所述配准方法包括：获取生物组织序列切片显微图像中各相邻切片显微图像的对应点；调整所获取的各对应点的位置；依据所述调整后的各对应点的位置，对所述切片显微图像进行图像形变。

【技术特征摘要】
1.一种生物组织序列切片显微图像的配准方法，其特征在于，所述配准方法包括：获取生物组织序列切片显微图像中各相邻切片显微图像的对应点；调整所获取的各对应点的位置；依据所述调整后的各对应点的位置，对所述切片显微图像进行图像形变。2.根据权利要求1所述的配准方法，其特征在于，“获取所述生物组织序列切片显微图像中各相邻切片显微图像的对应点”包括采用SIFTflow算法获取各相邻层生物组织序列切片显微图像的对应点。3.根据权利要求2所述的配准方法，其特征在于，“采用SIFTflow算法获取各相邻层图像的对应点”具体包括：采用SIFTflow算法对两个相邻切片显微图像中的第一切片显微图像进行图像变形，并将变形后的第一切片显微图像与所述两个相邻切片显微图像中的第二切片显微图像进行匹配；在所述匹配后的第一切片显微图像和第二切片显微图像上分别设置网格，且所述第一切片显微图像和第二切片显微图像中对应网格的位置坐标相同；选取第一切片显微图像中与所述变形后的第一切片显微图像中网格顶点对应的位置点作为其对应点；以及，选取第二切片显微图像中网格顶点对应的位置点作为其对应点。4.根据权利要求1至3任一项所述的配准方法，其特征在于，“调整所获取的各对应点的位置”包括按照下式所示的方法调整所获取的各对应点的位置：其中，所述i为切片显微图像的序号，所述k和l分别为切片显微图像中对应点的序号，且l≠k，所述为第i个切片显微图像中的第k个对应点的位置坐标，所述为所述位置坐标的位移向量，所述E(w)为位移向量w的能量函数，所述α和β分别为常数。5.根据权利要求4所述的配准方法，其特征在于，“依据所述调整后的各对应点的位置，对所述生物组织序列切片显微图像进行图像形变”包括：采用移动最小二乘法对生物组织序列切片显微图像进行图像形变，具体包括：按照下式所示的方法获取切片显微图像中所述预设网格顶点在图像形变后的位置坐标：采用双线性插值法获取所述切片显微图像中除去预设网格顶点后所有对应点在图像性形变后的位置坐标；其中，所述v为图像形变之前切片显微图像中预设网格顶点的位置坐标，所述k为切片显微...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈曦，韩华，谢启伟，沈丽君，
申请(专利权)人：中国科学院自动化研究所，
类型：发明
国别省市：北京,11