单核苷酸多态性rs7576984和rs2066802在检测结核易感性中的应用制造技术

本发明专利技术公开了STAT1基因单核苷酸多态性rs7576984和rs2066802在检测结核易感性中的应用。本发明专利技术所提供的应用为用于检测rs7576984位点或rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。本发明专利技术的发明专利技术人通过中国汉族人群病例对照研究发现STAT1‑rs7576984和rs2066802位点基因多态性与结核罹患风险之间存在显著的相关性。携带STAT1‑rs7576984CG基因型和STAT1“TA”单体型组成的双体型的人群在结核分枝杆菌感染时发病风险更高。本发明专利技术为炎性及免疫相关基因SNP与结核易感性之间的关联提供了新见解，对结核易感基因筛查与预防有重大价值。

Application of single nucleotide polymorphisms rs7576984 and rs2066802 in detection of susceptibility to tuberculosis

The present invention discloses the application of STAT1 gene single nucleotide polymorphisms rs7576984 and rs2066802 in detecting tuberculosis susceptibility. The invention provides the application of a substance for detecting single nucleotide polymorphisms of rs7576984 loci or rs2066802 loci in the preparation, evaluation, or evaluation of a product of the risk of tuberculosis in a person to be tested. The inventor China Han population control through the case study found that STAT1 rs7576984 and rs2066802 gene polymorphism and tuberculosis have significant correlation between risk. Carrying STAT1 genotype rs7576984CG and STAT1 \TA\ haplotype composed of two body crowd in Mycobacterium tuberculosis infection higher risk. The present invention provides new insights into the association between inflammatory and immune related genes, SNP, and susceptibility to tuberculosis, and is of great value for screening and preventing tuberculosis susceptible genes.

【技术实现步骤摘要】
单核苷酸多态性rs7576984和rs2066802在检测结核易感性中的应用
本专利技术属于生物医学领域，涉及STAT1基因单核苷酸多态性rs7576984和rs2066802在检测结核易感性中的应用，特别涉及STAT1基因单核苷酸多态性(SNP)rs7576984和rs2066802位点标志物在人群对结核病易感性筛查和评估中的应用。
技术介绍
结核病(Tuberculosis，TB)是一种严重威胁人类健康的全球性疾病，其已成为人类三大感染性疾病杀手之一。世界卫生组织全球结核病报告指出，大约1/3的人被结核分枝杆菌感染，其中仅有10％的感染者发病。这就意味着结核感染者是否发病与宿主-病原体之间的相互作用、环境、遗传等有着密切的关系。最近，许多研究证明结核风险与免疫系统和炎性反应相关基因的多态性有密切的联系。人类STAT1基因位于染色体2q32.2区，其编码产物是信号转导和转录激活因子1(STAT1)，该蛋白属于STAT蛋白家族。STAT通路在所有脊椎动物和一些早期的后生动物中是高度保守的，它能够通过简单而直接的方式把许多细胞因子的信号从细胞膜受体传导到细胞核内，该过程可以分为三个基本阶段：受体的激活、信号转导及靶基因表达。细胞因子可以导致其同源受体被Janus激酶(JAK)磷酸化、进而为细胞浆内的STAT提供对接位点；STAT蛋白被JAK磷酸化后形成同源/异源二聚体并从膜受体转运到细胞核内；STAT形成二聚体或更复杂的复合物结合到靶基因调控区域的保守DNA序列上、调控转录的起始和增强。研究结果表明结核分枝杆菌感染的B10R鼠巨噬细胞可以诱导不依赖于分枝杆菌吞噬作用的细胞凋亡，结核分枝杆菌可以诱导蛋白酪氨酸激酶(PTK)活化、JAK2/STAT1-α磷酸化和STAT1-α核易位。结核分枝杆菌感染激活JAK2/STAT1-alpha通路的发现表明结核分枝杆菌可能模仿巨噬细胞激活刺激。有研究已经确认STAT1突变会导致机体对结核分枝杆菌的易感性更高。随着基因组学的发展和结核分枝杆菌全基因组测序的完成，成千上万的单核苷酸多态性(SNP)位点从结核患者身上被鉴定。研究者利用这些数据绘制出结核分枝杆菌SNP系谱树并提出了结核分枝杆菌谱系的进化假说。尽管结核分枝杆菌SNP研究在方法学和基因组学上取得了举世瞩目的成就，但是中国人群STAT1基因SNP与结核感染风险之间的关系却依旧知之甚少。因此，确定中国人群STAT1基因的SNP并深入研究其与结核患病风险之间的关系显得非常有必要。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供STAT1基因单核苷酸多态性rs7576984和rs2066802在检测结核易感性中的应用。本专利技术所提供的应用具体可为三个，即应用A、应用B和应用C。应用A：用于检测rs7576984位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；应用B：用于检测rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质在制备诊断或辅助诊断待测人是否患有结核病的产品中的应用。其中，所述rs7576984位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191003857位核苷酸；所述rs7576984位点的核苷酸为C或A。所述rs2066802位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191009941位核苷酸；所述rs2066802位点的核苷酸为C或T。进一步，所述应用A为所述用于检测rs7576984位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(a1)或(a2)或(a3)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(a1)在共显性遗传模型下，所述rs7576984位点为CA基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs7576984位点为CC基因型的待测人；(a2)在显性遗传模式下，所述rs7576984位点为AA基因型或CA基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs7576984位点为CC基因型的待测人；(a3)在隐性遗传模式下，所述rs7576984位点为AA基因型的待测人患结核病的风险低于所述rs7576984位点为CA基因型或CC基因型的待测人。进一步，所述应用B为所述用于检测rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(b1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(b1)在共显性遗传模式下，所述rs2066802位点为CT基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs2066802位点为TT基因型的待测人。应用C：用于检测双体型M的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。单体型(Haplotype)是位于一条染色体特定区域的一组相互关联，并倾向于以整体遗传给后代的单核苷酸多态的组合。双体型为位于同源染色体上的单体型对。构成所述双体型M的单体型的单核苷酸多态组合依次如下：rs13029247位点和rs7576984位点。所述rs13029247位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191001932位核苷酸；所述rs13029247位点的核苷酸为C或T。所述rs7576984位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191003857位核苷酸；所述rs7576984位点的核苷酸为C或A。进一步，所述应用C为所述用于检测双体型M的物质以及记载有如下(c1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(c1)构成所述双体型M的2个单体型中有一个“TA”这种单体型的待测人患结核病的风险高于构成所述双体型M的2个单体型中没有“TA”这种单体型的待测人。本专利技术还保护一种产品，含有用于检测rs7576984位点的单核苷酸多态性的物质；所述产品具有评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的功能。其中，所述rs7576984位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191003857位核苷酸；所述rs7576984位点的核苷酸为C或A。在本专利技术中，所述用于检测rs7576984位点的单核苷酸多态性的物质具体为引物对甲或成套单链DNA分子甲；所述引物对甲由序列表中序列1所示的单链DNA和序列表中序列2所示的单链DNA组成；所述成套单链DNA分子甲由序列表中序列1所示的单链DNA、序列表中序列2所示的单链DNA和序列表中序列3所示的单链DNA组成。所述产品中，还可含有记载有如上(a1)或(a2)或(a3)所示内容的可读性载体。本专利技术还保护一种产品，含有用于检测rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质；所述产品具有评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的功能。其中，所述rs2066802位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191009941位核苷酸；所述rs2066802位点的核苷酸为C或T。在本专利技术中，所述用于检测rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质为引物对乙或成套单链DNA分子乙；所述引物对乙由序列表中序列4所示的单链DNA和序列表中序列5所示的单链DNA组成；所述成套单链DNA分子乙由序列表中序列4所示的单链DNA、序列表中序列5所示的单链DNA和序列表中序列6所示的单链DNA组成。所述产品中，还可含有记载有如上(b1)所示内容的可读性载体。本专利技术还保护一种产品，含有用本文档来自技高网...

【技术保护点】
应用，为如下应用A或应用B：应用A：用于检测rs7576984位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；应用B：用于检测rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.应用，为如下应用A或应用B：应用A：用于检测rs7576984位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；应用B：用于检测rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述rs7576984位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191003857位核苷酸；所述rs7576984位点的核苷酸为C或A；所述rs2066802位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191009941位核苷酸；所述rs2066802位点的核苷酸为C或T。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述应用A为所述用于检测rs7576984位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(a1)或(a2)或(a3)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(a1)在共显性遗传模式下，所述rs7576984位点为CA基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs7576984位点为CC基因型的待测人；(a2)在显性遗传模式下，所述rs7576984位点为AA基因型或CA基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs7576984位点为CC基因型的待测人；(a3)在隐性遗传模式下，所述rs7576984位点为AA基因型的待测人患结核病的风险低于所述rs7576984位点为CA基因型或CC基因型的待测人；所述应用B为所述用于检测rs2066802位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(b1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(b1)在共显性遗传模式下，所述rs2066802位点为CT基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs2066802位点为TT基因型的待测人。4.用于检测双体型M的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；构成所述双体型M的单体型的单核苷酸多态组合依次如下：rs13029247位点和rs7576984位点。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述rs13029247位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191001932位核苷酸；所述rs13029247位点的核苷酸为C或T；所述rs7576984位点为人类基因组2号染色体上自5’末端起第191003857位核苷酸；所述rs7576984位点的核苷酸为C或A。6.根据权利要求4或5所述的应用，其特征在于：所述应用为所述用于检测双体型M的物质以及记载有如下(c1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(c1)构成所述双体型M的2个单体型中有一个“TA”这种单体型的待测人患结核病的风险高于构成所述双体型M的2个单体型中...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴雪琼，龚文平，张俊仙，安慧茹，梁艳，阳幼荣，
申请(专利权)人：中国人民解放军第三〇九医院，
类型：发明
国别省市：北京,11