检测肿瘤耐药性变异的检测剂制造技术

技术编号:15740123 阅读:49 留言:0更新日期:2017-07-02 05:45
本发明专利技术公开了一种检测肿瘤耐药性变异的检测剂,该检测剂包括分别针对EGFR基因及/或ALK基因的继发突变设计的第一检测剂、针对旁路激活基因的变异设计的第二检测剂以及针对驱动转换基因的变异设计的第三检测剂。从而更加全面而具有针对性的检测由EGFR或者ALK驱动的肿瘤用药后产生的耐药性变异性质,使治疗更具有针对性,减少耐药性。

Detection agent for detecting variation in tumor resistance

The invention discloses a detection agent for detecting tumor drug resistance mutations, including the detection agent were secondary to EGFR gene and / or ALK gene mutation detection agent, according to the design of the first second detection agent bypass activation gene variant design and variant design for driving the third conversion gene detection agent. Therefore, it is more comprehensive and targeted to detect the variability of drug resistance caused by tumor driven by EGFR or ALK, so that treatment can be more targeted and reduce drug resistance.

【技术实现步骤摘要】
检测肿瘤耐药性变异的检测剂
本专利技术涉及生物
,特别是涉及一种检测肿瘤耐药性变异的检测剂。
技术介绍
肿瘤是一组由肿瘤驱动基因所致的恶性疾病,具有高发病率、高死亡率的特征。较为常见的肿瘤驱动基因例如有ALK基因、EGFR基因、AKT1基因、CDK6基因等。近10年来,我国肿瘤的发病率快速增长,严重危害公众健康。临床研究发现,约87%的患者已有可知驱动基因,其中约有81%驱动基因已有明确的靶向抑制剂,66%患者可接受已上市药物的个体化靶向治疗。然而,肿瘤治疗过程中遇到的最大挑战是治疗耐药的问题。靶向治疗导致耐药这一点已经被临床实践证实,因此,迫切需要从源头上搞清楚肿瘤为什么会耐药,才能真正的“对症下药”,从而尽可能的延缓耐药。然而肿瘤时时刻刻在动态变化,不断诞生出新肿瘤细胞,其中就包括一些变异的后代,因此可以说耐药是“肿瘤进化”的结果。以肺腺癌为例,与其他肿瘤相比,肺腺癌显得比较“单纯”一点,肺腺癌主要由EGFR和ALK两个占主要优势驱动基因引起,可通过小分子靶向药TKI在肿瘤细胞内阻断与之相关的信号通道造成肿瘤细胞凋亡。然而,针对EGFR和ALK开发的第一代靶向药TKI,尽管开始治疗效果明显,但往往用不到一年就产生耐药了,而靶向药PFS的耐药周期更短。肿瘤治疗后耐药的情况是普遍存在的,因此有必要通过耐药基因检测识别耐药变异形式,因为只有研究清楚耐药分子机制,才能使治疗更具有针对性,减少耐药性。然而,传统的检测肿瘤耐药性变异的检测剂较为片面,无法针对性的检测由肿瘤驱动基因EGFR或ALK驱动的肿瘤用药后产生的耐药性。
技术实现思路
基于此,有必要提供一种检测肿瘤耐药性变异的检测剂,针对性的用于检测由肿瘤驱动基因EGFR或者由肿瘤驱动基因ALK驱动的肿瘤用药后产生的耐药性变异形式。一种检测肿瘤耐药性变异的检测剂,用于检测由EGFR基因或ALK基因驱动的肿瘤用药后产生的耐药性变异,包括第一检测剂、第二检测剂以及第三检测剂;所述第一检测试剂包括EGFR突变检测剂和/或ALK突变检测剂,所述EGFR突变检测剂用于检测所述EGFR基因的继发突变,所述ALK突变检测剂用于检测所述ALK基因的继发突变;所述第二检测剂用于检测旁路激活基因的变异,变异后的所述旁路激活基因能够旁路激活EGFR信号通路或者ALK信号通路;所述第三检测剂用于检测驱动转换基因的变异,所述驱动转换基因为除所述EGFR和所述ALK以外的肿瘤驱动基因。在一个实施方式中,所述EGFR突变检测剂包括T790M突变检测剂、C797S突变检测剂、L798Q突变检测剂以及L844V突变检测剂,所述T790M突变检测剂用于检测所述EGFR基因的T790M突变,所述C797S突变检测剂用于检测所述EGFR基因的C797S突变,所述L798Q突变检测剂用于检测所述EGFR基因的L798Q突变,所述L844V突变检测剂用于检测所述EGFR基因的L844V突变;及/或,所述ALK突变检测剂包括I1151T突变检测剂、C1156Y突变检测剂、F1174L突变变检测剂、L1196M突变变检测剂、G1202R突变变检测剂以及G1269A突变变检测剂,所述I1151T突变检测剂用于检测ALK基因的I1151T突变,所述C1156Y突变检测剂用于检测所述ALK基因的C1156Y突变,所述F1174L突变检测剂用于检测所述ALK基因的F1174L突变,所述L1196M突变检测剂用于检测所述ALK基因的L1196M突变,所述G1202R突变检测剂用于检测所述ALK基因的G1202R突变,所述G1269A突变检测剂用于检测所述ALK基因的G1269A突变。在一个实施方式中,所述T790M突变检测剂包括如SEQIDNo.1所示的核苷酸链;及/或,所述C797S突变检测剂包括如SEQIDNo.2所示的核苷酸链;及/或,所述L798Q突变检测剂包括如SEQIDNo.3所示的核苷酸链;及/或,所述L844V突变检测剂包括如SEQIDNo.4所示的核苷酸链;及/或,所述I1151T突变检测剂包括如SEQIDNo.5所示的核苷酸链;及/或,所述C1156Y突变检测剂包括如SEQIDNo.6所示的核苷酸链;及/或,所述F1174L突变检测剂包括如SEQIDNo.7所示的核苷酸链;及/或,所述L1196M突变检测剂包括如SEQIDNo.8所示的核苷酸链;及/或,所述G1202R突变检测剂包括如SEQIDNo.9所示的核苷酸链;及/或,所述G1269A突变检测剂包括如SEQIDNo.10所示的核苷酸链。在一个实施方式中,所述第一检测试剂还包括EGFR融合检测剂、ALK融合检测剂以及ALK扩增检测剂;所述EGFR融合检测剂用于检测所述EGFR基因与融合片段融合后形成的EGFR融合基因,所述EGFR融合检测剂针对7号染色体第55267769~55269109位点区域内的EGFR基因设计;所述ALK融合检测剂用于检测所述ALK基因与融合片段融合后形成的ALK融合基因,所述ALK融合检测剂针对2号染色体第29446129~29448537位点区域内的ALK基因设计;所述ALK扩增检测剂用于检测所述ALK基因扩增后形成的ALK扩增基因,所述ALK扩增检测剂针对2号染色体第29576606~30146457位点区域内的ALK基因设计。在一个实施方式中,所述EGFR融合检测剂包括如SEQIDNo.11~SEQIDNo.12所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述ALK融合检测剂包括如SEQIDNo.13~SEQIDNo.14所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述ALK扩增检测剂包括如SEQIDNo.15~SEQIDNo.16所示的核苷酸链中的至少一条。在一个实施方式中,所述第二检测剂包括MET扩增检测剂、IGF1R激活检测剂、FGFR1激活检测剂以及FGFR2激活检测剂;所述MET扩增检测剂用于检测MET基因扩增后形成的MET扩增基因,所述MET扩增检测剂针对7号染色体第116310403~116438428位点区域内的MET基因设计;所述IGF1R激活检测剂用于检测IGF1R激活后形成的IGF1R激活基因,所述IGF1R激活检测剂针对15号染色体第99192797~99500720位点区域内的IGF1R基因设计;所述FGFR1激活检测剂用于检测FGFR1激活后形成的FGFR1激活基因,所述FGFR1激活检测剂针对8号染色体第38268105~38328281位点区域内的FGFR1基因设计;所述FGFR2激活检测剂用于检测FGFR2激活后形成的FGFR2激活基因,所述FGFR2激活检测剂针对10号染色体第123239075~123353337位点区域内的FGFR2基因设计。在一个实施方式中,所述MET扩增检测剂包括如SEQIDNo.17~SEQIDNo.18所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述IGF1R激活检测剂包括如SEQIDNo.19~SEQIDNo.20所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述FGFR1激活检测剂包括如SEQIDNo.21~SEQIDNo.22所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述FGFR2激活检测剂包括如SEQIDNo.23~SEQIDNo.24所示的核苷酸链中的至少一条本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测肿瘤耐药性变异的检测剂,用于检测由EGFR基因或ALK基因驱动的肿瘤用药后产生的耐药性变异,其特征在于,包括第一检测剂、第二检测剂以及第三检测剂;所述第一检测试剂包括EGFR突变检测剂和/或ALK突变检测剂,所述EGFR突变检测剂用于检测所述EGFR基因的继发突变,所述ALK突变检测剂用于检测所述ALK基因的继发突变;所述第二检测剂用于检测旁路激活基因的变异,变异后的所述旁路激活基因能够旁路激活EGFR信号通路或者ALK信号通路;所述第三检测剂用于检测驱动转换基因的变异,所述驱动转换基因为除所述EGFR和所述ALK以外的肿瘤驱动基因。

【技术特征摘要】
1.一种检测肿瘤耐药性变异的检测剂,用于检测由EGFR基因或ALK基因驱动的肿瘤用药后产生的耐药性变异,其特征在于,包括第一检测剂、第二检测剂以及第三检测剂;所述第一检测试剂包括EGFR突变检测剂和/或ALK突变检测剂,所述EGFR突变检测剂用于检测所述EGFR基因的继发突变,所述ALK突变检测剂用于检测所述ALK基因的继发突变;所述第二检测剂用于检测旁路激活基因的变异,变异后的所述旁路激活基因能够旁路激活EGFR信号通路或者ALK信号通路;所述第三检测剂用于检测驱动转换基因的变异,所述驱动转换基因为除所述EGFR和所述ALK以外的肿瘤驱动基因。2.根据权利要求1所述的检测肿瘤耐药性变异的检测剂,其特征在于,所述EGFR突变检测剂包括T790M突变检测剂、C797S突变检测剂、L798Q突变检测剂以及L844V突变检测剂,所述T790M突变检测剂用于检测所述EGFR基因的T790M突变,所述C797S突变检测剂用于检测所述EGFR基因的C797S突变,所述L798Q突变检测剂用于检测所述EGFR基因的L798Q突变,所述L844V突变检测剂用于检测所述EGFR基因的L844V突变;及/或,所述ALK突变检测剂包括I1151T突变检测剂、C1156Y突变检测剂、F1174L突变变检测剂、L1196M突变变检测剂、G1202R突变变检测剂以及G1269A突变变检测剂,所述I1151T突变检测剂用于检测ALK基因的I1151T突变,所述C1156Y突变检测剂用于检测所述ALK基因的C1156Y突变,所述F1174L突变检测剂用于检测所述ALK基因的F1174L突变,所述L1196M突变检测剂用于检测所述ALK基因的L1196M突变,所述G1202R突变检测剂用于检测所述ALK基因的G1202R突变,所述G1269A突变检测剂用于检测所述ALK基因的G1269A突变。3.根据权利要求2所述的检测肿瘤耐药性变异的检测剂,其特征在于,所述T790M突变检测剂包括如SEQIDNo.1所示的核苷酸链;及/或,所述C797S突变检测剂包括如SEQIDNo.2所示的核苷酸链;及/或,所述L798Q突变检测剂包括如SEQIDNo.3所示的核苷酸链;及/或,所述L844V突变检测剂包括如SEQIDNo.4所示的核苷酸链;及/或,所述I1151T突变检测剂包括如SEQIDNo.5所示的核苷酸链;及/或,所述C1156Y突变检测剂包括如SEQIDNo.6所示的核苷酸链;及/或,所述F1174L突变检测剂包括如SEQIDNo.7所示的核苷酸链;及/或,所述L1196M突变检测剂包括如SEQIDNo.8所示的核苷酸链;及/或,所述G1202R突变检测剂包括如SEQIDNo.9所示的核苷酸链;及/或,所述G1269A突变检测剂包括如SEQIDNo.10所示的核苷酸链。4.根据权利要求1所述的检测肿瘤耐药性变异的检测剂,其特征在于,所述第一检测试剂还包括EGFR融合检测剂、ALK融合检测剂以及ALK扩增检测剂;所述EGFR融合检测剂用于检测所述EGFR基因与融合片段融合后形成的EGFR融合基因,所述EGFR融合检测剂针对7号染色体第55267769~55269109位点区域内的EGFR基因设计;所述ALK融合检测剂用于检测所述ALK基因与融合片段融合后形成的ALK融合基因,所述ALK融合检测剂针对2号染色体第29446129~29448537位点区域内的ALK基因设计;所述ALK扩增检测剂用于检测所述ALK基因扩增后形成的ALK扩增基因,所述ALK扩增检测剂针对2号染色体第29576606~30146457位点区域内的ALK基因设计。5.根据权利要求4所述的检测肿瘤耐药性变异的检测剂,其特征在于,所述EGFR融合检测剂包括如SEQIDNo.11~SEQIDNo.12所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述ALK融合检测剂包括如SEQIDNo.13~SEQIDNo.14所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述ALK扩增检测剂包括如SEQIDNo.15~SEQIDNo.16所示的核苷酸链中的至少一条。6.根据权利要求1所述的检测肿瘤耐药性变异的检测剂,其特征在于,所述第二检测剂包括MET扩增检测剂、IGF1R激活检测剂、FGFR1激活检测剂以及FGFR2激活检测剂;所述MET扩增检测剂用于检测MET基因扩增后形成的MET扩增基因,所述MET扩增检测剂针对7号染色体第116310403~116438428位点区域内的MET基因设计;所述IGF1R激活检测剂用于检测IGF1R激活后形成的IGF1R激活基因,所述IGF1R激活检测剂针对15号染色体第99192797~99500720位点区域内的IGF1R基因设计;所述FGFR1激活检测剂用于检测FGFR1激活后形成的FGFR1激活基因,所述FGFR1激活检测剂针对8号染色体第38268105~38328281位点区域内的FGFR1基因设计;所述FGFR2激活检测剂用于检测FGFR2激活后形成的FGFR2激活基因,所述FGFR2激活检测剂针对10号染色体第123239075~123353337位点区域内的FGFR2基因设计。7.根据权利要求6所述的检测肿瘤耐药性变异的检测剂,其特征在于,所述MET扩增检测剂包括如SEQIDNo.17~SEQIDNo.18所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述IGF1R激活检测剂包括如SEQIDNo.19~SEQIDNo.20所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述FGFR1激活检测剂包括如SEQIDNo.21~SEQIDNo.22所示的核苷酸链中的至少一条;及/或,所述FGFR2激活检测剂包括如SEQIDNo.23~SEQIDNo.24所示的核苷酸链中的至少一条。8.根据权利要求1所述的检测肿瘤耐药性变异...

【专利技术属性】
技术研发人员:严令华韩宁宁
申请(专利权)人:常州桐树生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:江苏,32

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