一种基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法及探针技术

技术编号:21733390 阅读:55 留言:0更新日期:2019-07-31 18:09
本发明专利技术公开了一种基于CRISPR‑Cas13a的特异性核酸片段的检测方法,该方法的检测体系中含有:crRNA、Cas13a、探针;该方法的特征在于:所述的探针包含1段RNA序列,该RNA序列的两端分别连接1段DNA序列;所述探针上的核苷酸均进行硫代磷酸骨架的修饰,以在相邻核苷酸之间形成硫代磷酸酯键;所述RNA序列上的若干个核苷酸还进行了二甲氧基修饰,并且,所述的RNA序列上至少含有两个连续的未进行二甲氧基修饰的核苷酸。所述的DNA序列含有6个脱氧核糖核苷酸。所述的RNA序列含有为8‑12个核糖核苷酸。本发明专利技术设计的探针稳定高,荧光背景值低。

A Detection Method and Probe for Specific Nucleic Acid Fragments Based on CRISPR-Cas13a

【技术实现步骤摘要】
一种基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法及探针
本专利技术涉及分子生物
,具体涉及一种基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法及探针。
技术介绍
CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CRISPR/Cas系统中,CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列(clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeats)的简称,涉及细菌基因组中的独特DNA区域,也是储存病毒DNA片段从而允许细胞能够识别任何试图再次感染它的病毒的地方,CRISPR经转录产生的RNA序列识别入侵性病毒的遗传物质。Cas是CRISPR相关蛋白(CRISPR-associatedproteins,Cas)的简称,Cas蛋白像一把分子剪刀那样切割细菌基因组上的靶DNA。CRISPR-Cas系统是古菌和细菌的抵抗病毒和质粒侵染的重要免疫防御系统。CRISPR-Cas系统划分为两大类,第一大类CRISPR-Cas系统由多亚基组成的效应复合本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于CRISPR‑Cas13a的特异性核酸片段的检测方法,该方法用于非诊断目的的检测,该方法的检测体系中含有:crRNA、Cas13a、探针;所述的crRNA包含针对目的基因的靶点设计的向导序列;所述的Cas13a通过所述的crRNA识别目的基因上的靶点后,能够激活Cas13a的RNA酶活性,并对所述的探针进行切割,从而获得检测信号;该方法的特征在于:所述的探针包含1段RNA序列,该RNA序列的两端分别连接1段DNA序列;所述探针上的核苷酸均进行硫代磷酸骨架的修饰,以在相邻核苷酸之间形成硫代磷酸酯键;所述RNA序列上的若干个核苷酸还进行了二甲氧基修饰,并且,所述的RNA序列上至少含有两...

【技术特征摘要】
1.一种基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法,该方法用于非诊断目的的检测,该方法的检测体系中含有:crRNA、Cas13a、探针;所述的crRNA包含针对目的基因的靶点设计的向导序列;所述的Cas13a通过所述的crRNA识别目的基因上的靶点后,能够激活Cas13a的RNA酶活性,并对所述的探针进行切割,从而获得检测信号;该方法的特征在于:所述的探针包含1段RNA序列,该RNA序列的两端分别连接1段DNA序列;所述探针上的核苷酸均进行硫代磷酸骨架的修饰,以在相邻核苷酸之间形成硫代磷酸酯键;所述RNA序列上的若干个核苷酸还进行了二甲氧基修饰,并且,所述的RNA序列上至少含有两个连续的未进行二甲氧基修饰的核苷酸。2.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法,其特征在于,所述的DNA序列含有6个脱氧核糖核苷酸。3.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法,其特征在于,所述的RNA序列含有为8-12个核糖核苷酸。4.根据权利要求3所述的基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法,其特征在于,所述的RNA序列中,进行了二甲氧基修饰的核苷酸的个数为4个。5.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas13a的特异性核酸片段的检测方法,其特征在于,所述探针的序列为:ATCTTCGUCGCCCUGGCAT...

【专利技术属性】
技术研发人员:蔡微菁孙子豪
申请(专利权)人:常州桐树生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:江苏,32

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