基于代谢物组的血液样本质量的测定方法和手段技术

本发明专利技术涉及一种用于评估血液制品样本质量的方法，包括测定所述样本中本发明专利技术的至少一个标记物组的标记物的值，比较测定的值与相应的参照，和评估所述血液制品样本的质量。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】本专利技术涉及一种用于评估血液制品样本质量的方法，所述方法包括测定所述样本中至少一个本专利技术的标记物组的标记物的值，比较测定的值与相应的参照值，和评估所述血液制品样本的质量。本专利技术还涉及用于评估血液制品样本的质量的装置和试剂盒，以及包含本专利技术的至少一个标记物组的至少标记物的特征值的数据集和包含所述数据集的数据存储介质。此外，本专利技术涉及提供足够质量的血液制品集合的方法，所述方法包括用于评估血液制品样本质量的方法的步骤。已经明确记载了存储在用于任何生物医学研究或用于治疗和/或诊断目的的生物库中的生物材料的值可能被预分析的混杂因素(其干扰样本组成)减少的事实(Aguilar-Mahecha等人(2012),PLoSONE7(6):e38290；Ahmed,FE(2011),AnalyticalMethods3:1029；Baechler等人(2004),GenesandImmunity5:3473)；Becker&Lockwood(2013),ClinicalBiochemistry46:861；Messaoudi等人(2013),ClinicaChimicaActa424:222；Greystoke等人(2008),AnnalsofOncology19:990；Hebels等人(2013),EnvironmentalHealthPerspectives121(4):480；Kamlage等人(2014)；ClinicalChemistry60:2:399；Odozze等人(2012),ClinicalBiochemistry45:464；Rai&Vitzthum(2006),ExpertRevProteomics3(4):409；Tuck等人(2009)JProteomeRes.8(1):113；Vaught等人(2011),JNatlCancerInstMonogr42:1；Yang等人Anal.Chem.85,2606；Yin等人(2013),ClinicalChemistry59(5):833)。例如，在代谢物分析(metaboliteprofiling)中使用的样本中，生物标记物识别和验证的潜力可以被预分析的混杂因素减少，其干扰样本代谢物组并可能导致不平衡的系统性偏差、增加的可变性、不稳定的效果和不能再现的结果。因此，决定性的是评估生物材料的质量，以确保代谢物分析或其它分析或诊断方法的质量和适用性。具体地，相关的混杂因素是血液、血浆或血清样本处理和存储的增加的时间和温度，离心规程、冷冻规程和其它预分析步骤的作用。对于生物库的质量保证和质量控制，有许多标准，例如ISO9001，ISO指南34，ISO17025等等(例如，见Carter2011,BiopreservationandBiobanking9(2):157-163；Elliott2008,IntJEpidemiology37:234-244)。为了评估生物材料的质量，目前测定生化标准参数，如样本中的核酸量和完整性、凝血活性的存在、或细胞组分、细胞完整性和细胞数目。但是，这样的标准参数评估将不适合所有样本的使用，并可能是成本密集的。有确保用于蛋白质组分析的样本质量的蛋白质生物标记物的报道(参见，例如，WO2012/170669)。此外，据报道，孵育影响血浆和血清样本的代谢物组分(Liu等人2010,AnalBiochem406:105-115；Fliniaux等人2011,JournalofBiomolecularNMR51(4):457-465；Boyanton2002,ClinicalChemistry48(12):2242-2247；Bernini等人2011,JournalofBiomolecularNMR49:231-243)。然而，尚没有用于评估生物材料质量的标准，但却非常需要。本专利技术的技术问题可以视为提供用于符合前述需要的手段和方法。通过权利要求和下文表征的实施方案解决技术问题。因此，本专利技术涉及用于评估血液制品样本的质量的方法，包括：a)测定所述样本中表1中的至少一组的标记物的值；b)比较步骤a)中测定的值与相应的参照值，和，c)评估所述血液制品样本的质量。本专利技术的方法优选是一种体外方法；相应地，该方法优选是离体进行的方法，即不在人体或动物体上实施。此外，本专利技术的方法可以包括除了上面明确提到的那些步骤之外的步骤。例如，进一步的步骤可以涉及，例如，计算步骤a)的两个或更多个生物标记物的样本内比率，或在步骤c)前或步骤c)中获得质量的额外指标。本专利技术的方法优选通过自动化辅助。例如，样本处理或预处理可以由机器人自动完成。数据处理和比较优选由适当的计算机程序和数据库辅助。如本文之前所描述的自动化允许以高通量方式使用本专利技术的方法。优选，用于评估血液制品样本质量的方法还包括为所述至少一组中的至少一个、优选所有标记物测定外部和/或内部标准。术语“外部标准”和“内部标准”是本领域技术人员公知的。在优选的实施方案中，本专利技术的方法另外包括以下步骤中的一个或多个：i)使所述血液制品样本与试剂接触，所述试剂特异性地与至少一个本专利技术的生物标记物相互作用，并测定所述生物标记物和特异性地与所述生物标记物相互作用的所述试剂之间形成的复合物的量；ii)使所述血液制品样本与酶接触，所述酶特异性地与至少一个本专利技术的生物标记物反应，并测定通过所述酶从所述生物标记物形成的产物的量；iii)使所述血液制品样本与试剂接触，所述试剂修饰至少一个生物标记物的化学结构，优选地，以形成所述生物标记物的非天然存在的衍生物，并检测所述衍生物；iv)在评估为质量不足的情况下，丢弃所述血液制品样本，和v)在评估为质量不足的情况下，从进一步的使用中排除所述血液制品样本。如本文所用，术语“质量”涉及本专利技术可以用于预期用途、或不可以用于预期用途的样本的性质。本专利技术样本的预期用途是本领域技术人员公知的，包括样本的任何诊断、治疗、非诊断、或非治疗用途。优选地，预期用途是非治疗用途；更优选地，预期用途是非治疗和非诊断用途。优选地，预期用途是体外用途。更优选地，预期用途是分析和/或实验用途。本专利技术样本的优选分析和/或实验用途是基因组分析中的用途、转录组分析中的用途、或蛋白质组分析中的用途。本专利技术样本的更优选的分析和/或实验用途是食物组学(foodomic)分析或脂质组分析中的用途。本专利技术样本的最优选的分析和/或实验用途是代谢物组中的用途和/或测定至少一个临床相关参数中的用途，优选包括临床化学、药代动力学研究、药效学研究、和/或分子诊断。在一个优选的实施方案中，预期用途是蛋白质组分析中的用途。因此，术语“足够的质量”涉及本专利技术样本的提供不被样本处理干扰的测量值的性质，即，优选地，含有与预期用途相关的，其浓度基本上是新鲜提取的样本中发现的浓度的一种或多种代谢物的性质。更优选地，足够的质量是以下性质：含有与预期用途相关的一种或多种代谢物，其浓度基本上是在根据标准规程处理的样本中发现的浓度。足够质量的样本允许恰当的分析，优选是因为相对于代谢物的量和代谢物的化学性质，组分不变化。优选地，用于血液制品样本处理的标准规程包括在室温下血液样本的抽取；在控制温度18℃至22℃下本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于评估血液制品样本质量的方法，包括：a)测定所述样本中表1中的至少一组的标记物的值；b)比较步骤a)中测定的值与相应的参考，和，c)评估所述血液制品样本的质量。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.03.26 EP 14161766.21.一种用于评估血液制品样本质量的方法，包括：a)测定所述样本中表1中的至少一组的标记物的值；b)比较步骤a)中测定的值与相应的参考，和，c)评估所述血液制品样本的质量。2.根据权利要求1所述的方法，其中在步骤a)中测定标记物(i)甘油-3-磷酸、甘油酸酯和鸟氨酸；(ii)甘油-3-磷酸、甘油酸酯和次黄嘌呤；(iii)甘油-3-磷酸、鸟氨酸和次黄嘌呤；或(iv)甘油酸酯、鸟氨酸和次黄嘌呤的量。3.根据权利要求1或2所述的方法，其中在步骤a)中测定表2中至少一组的标记物的值。4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中在步骤a)中测定表2中的组3，13，15，18，19或20中的至少一组的标记物的值。5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述测定标记物的值是测定所述标记物的量或测定从标记物的至少一个浓度值导出的计算值，优选地，测定至少两个生物标记物的浓度的比例。6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中通过使用多变量模型，优选逻辑回归模型将所述标记物的独立数值转换成组合值。7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法，其中所述步骤b)包括以下步骤b1)基于步骤a)中提及的所述标记物的测定值计算组合值，其中，优选地，在所述计算的组合值中，归于其重要性对标记物加权；和b2)从而，比较计算的组合值与参照组合值。8.根据权利要求1至6中任一项所述的方法，其中所述步骤b)包括以下步骤b1)比较步骤a)中测定的值与相应的参照，和基于所述比较计算组合值，其中，优选地，在所述计算的组合值中，归于其重要性对标记物加权；和b2)从而，比较计算的组合值与参照组合值。9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法，其中评估血液制品样本质量是确保所述血液制品样本没有受到以下任何混杂因素的影响(i)采血和从血细胞中分离血浆之间的延长的时间，(ii)采血和从血细胞中分离血浆之间的升高的温度，(iii)血浆存储的时间的延长，和(iv)血浆存储期间的...

【专利技术属性】
技术研发人员：B·卡姆朗格，O·施米茨，B·贝唐，P·沙茨，E·彼得，
申请(专利权)人：梅坦诺米克斯保健有限公司，
类型：发明
国别省市：德国;DE