一种快速DNA产物凝胶回收方法技术

技术编号:13069798 阅读:104 留言:0更新日期:2016-03-24 04:56
本发明专利技术属于分子生物学领域,具体涉及一种快速DNA产物凝胶回收方法,将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下,切除多余部分,直接放入4层硅胶膜柱中;在室温下,13000rpm离心2min,收集管中即为DNA溶液。主要解决了主流DNA回收方法时间长、经济成本高等问题。将DNA回收实验的操作时间压缩至2min内完成,单次回收成本降低到原来的1/10。不仅大大简化操作流程,而且降低了时间成本和经济成本。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域,具体涉及一种快速DNA产物凝胶回收方法
技术介绍
在基因克隆等多种DNA测序实验中,需要纯化回收聚合酶链式反应(PCR)扩增的特异性产物进行测序与分析。常用鉴定PCR扩增产物的方法是琼脂糖凝胶电泳,相应地对于凝胶电泳分离的DNA片段进行回收也有多种方法,目前最常用的有低熔点琼脂糖凝胶回收和试剂盒柱回收法。相对于以前传统的胶纯化回收方法来说,此两种方法的操作相对简单,但成本相对较高操作也比较繁琐和复杂。实验室最为常用的DNA回收方法是试剂盒柱回收法,如Universal DNA纯化回收试剂盒(天根生化科技有限公司)法。该试剂盒采用独特的缓冲体系和离心吸附柱,既可从TAE或TBE琼脂糖凝胶中回收DNA片段,又可用于直接纯化PCR产物,能够满足多种实验需要。溶胶液PC中含有pH指示剂,可根据颜色来判断溶胶状态。使用该产品可回收100 bp-8kb大小的DNA片段,回收率可达80%。虽然该试剂盒操作并不复杂,回收效率中上,但其回收操作时长在20-30 min,单次回收成本6-8元人民币。多数分子实验室需要进行大量的DNA回收实验,若使用现有的试剂盒法回收,需要耗费很高的时间成本和经济成本。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种快速DNA产物凝胶回收方法,主要解决了主流DNA回收方法时间长、经济成本高等问题。将DNA回收实验的操作时间压缩至2 min内完成,单次回收成本降低到原来的1/10。不仅大大简化操作流程,而且降低了时间成本和经济成本。为实现上述目的,本专利技术采用如下技术方案: 采用4层硅胶膜柱过滤回收DNA片段,一步即可完成回收实验,用时仅需2 min。回收方法如下: 切胶:将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下(尽可能切除多余部分),直接放入4层硅胶膜柱中; 离心回收:在室温下,13000 rpm离心2 min,收集管中即为DNA溶液。本专利技术的优点在于: 1、本专利技术在2min内完成DNA片段回收实验,大大缩减了操作的时间成本; 2、本专利技术单次回收经济成本不到1元人民币,相对实验室常用的DNA回收试剂盒来说成本不足其1/10,大大降低了 DNA回收实验的经济成本; 3、本专利技术操作极其简单,一步即可完成DNA回收实验。【附图说明】图1 两种方法回收2K DNA Marker 2000 bp和500 bp片段结果,M:2K DNA Marker(购自全式金生物技术有限公司)10 yL ;1-4:使用本专利技术方法回收2K DNA Marker (10yL)2000 bp和500 bp片段结果,重复2次;5-6:使用Universal DNA纯化回收试剂盒(购自天根生化科技有限公司)回收2K DNA Marker (10 yL) 2000 bp和500 bp片段结果。图2 两种方法回收 15K DNA Marker 15000 bp、5000 bp 和 lOOObp 片段结果,Μ:15Κ DNA Marker (购自宝生物工程有限公司)10 μ L ; 1-3:使用本专利技术方法回收15K DNAMarker (10 yL) 15000 bp、5000 bp 和 lOOObp 片段结果;4_6:使用 Universal DNA 纯化回收试剂盒(购自天根生化科技有限公司)回收15K DNA Marker (10 yL) 15000 bp,5000bp和lOOObp片段结果。图3 两种方法回收 PCR 产物结果,M:2K DNA Marker,1:PCR 产物 A1 (20 μ L),2:试剂盒回收PCR产物Al,3:PCR产物A2(20 yL),4:本专利技术方法回收PCR产物A2。【具体实施方式】实施例1 本专利技术采用4层硅胶膜柱,离心回收DNA片段,一步完成回收。以该专利技术的方法与实验室最常见的Universal DNA纯化回收试剂盒(天根生化科技有限公司)方法做对比试验,回收2K DNA Marker (10 yL)2000 bp和500 bp片段。从回收结果上看,本方法和试剂盒回收后条带均比原条带弱,回收效率在60%~80%。与Universal DNA纯化回收试剂盒相比,本方法回收效率相对会低一些,但重复性很好。由于一般测序实验及DNA片段纯化回收的后续实验对DNA回收率的要求并不是很高,满足回收率40%都可达到后续实验要求。而本方法回收率可达60%~70%,满足后续实验要求。实施例2 为了进一步验证本方法在回收DNA大片段时的效果,使用本方法与Universal DNA纯化回收试剂盒对比回收15K DNA Marker中的15K、5K和IK DNA片段。从回收结果上看,本方法和试剂盒回收后条带均比原条带弱,回收效率在60%~80%。与Universal DNA纯化回收试剂盒相比,在回收5000 bp和1000 bp DNA片段时,本方法回收效率相对会低一些,但条带亮度说明回收产物满足后续实验;而在15000 bp DNA片段的回收上,回收试剂盒回收率明显降低,亮度稍低于本方法,说明本方法回收DNA大片段的效果好于回收试剂盒。从不同分子量DNA回收结果对比,本方法对不同分子量DNA片段的回收率相对稳定,不会因为分子量增大而降低回收率。从条带亮度来看,回收产物满足后续实验要求。实施例3 为了验证本方法满足后续实验的要求,我们使用本方法与Universal DNA纯化回收试剂盒对比回收某基因3’ RACE的PCR产物,并分别做了连接、转化和克隆测序。使用某基因3’ RACE引物,50 μ L体系扩增获得两管PCR产物。分别抽取20 μ L产物跑胶(1%琼脂糖凝胶),分别采用两种方法切胶回收。回收后将PCR产物与对应的胶回收产物同时上样跑胶。与Universal DNA纯化回收试剂盒相比,两种方法回收率相差无几,满足后续实验要求。将所得DNA溶液与回收试剂盒所得DNA溶液分别进行连接、转化(载体为pEASY-T5 Zero,感受态细胞使用Transl-Tl,均购自全式金生物技术有限公司),并进行测序。两种方法得到的DNA溶液均可进行连接、转化,转化效率一致,单克隆菌落生长状态一致。测序结果显示,所得基因序列一致,证明两种方法在克隆测序实验中效果相同。该方法已在本实验室进行的大量克隆测序及回收实验中得到验证,满足实验要求。以上所述仅为本专利技术的较佳实施例,凡依本专利技术申请专利范围所做的均等变化与修饰,皆应属本专利技术的涵盖范围。【主权项】1.一种快速DNA产物凝胶回收方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤: (1)切胶:将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下,切除多余部分,直接放入4层硅胶膜柱中; (2)离心回收:在室温下,13000rpm离心2 min,收集管中即为DNA溶液。【专利摘要】本专利技术属于分子生物学领域,具体涉及一种快速DNA产物凝胶回收方法,将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下,切除多余部分,直接放入4层硅胶膜柱中;在室温下,13000rpm离心2min,收集管中即为DNA溶液。主要解决了主流DNA回收方法时间长、经济成本高等问题。将DNA回收实验的操作时间压缩至2min内完成,单次回收成本降低到原来的1/10。不仅大大简化操作流程,而且本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种快速DNA产物凝胶回收方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:(1)切胶:将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下,切除多余部分,直接放入4层硅胶膜柱中;(2)离心回收:在室温下,13000 rpm离心2 min,收集管中即为DNA溶液。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:蒲小龙郭志雄潘东明潘腾飞叶如梦
申请(专利权)人:福建农林大学
类型:发明
国别省市:福建;35

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