嗜热链球菌CRISPR-Cas9系统识别的人CXCR4基因的靶序列和sgRNA及其应用技术方案

技术编号:12851046 阅读:99 留言:0更新日期:2016-02-11 15:47
本发明专利技术属于基因工程领域,公开了一种源自嗜热链球菌的CRISPR-Cas9系统识别的靶序列,其序列如SEQ ID NO:1-63中任意一个的第n-20位所示且n=1-5。本发明专利技术还公开了序列为5’-识别序列-招募Cas9蛋白的序列-3’的sgRNA及其编码DNA分子,识别序列对应的DNA序列与靶序列相同。本发明专利技术还公开了一种CRISPR-Cas9系统,包括Cas9蛋白和sgRNA和/或携带有Cas9蛋白的编码序列和sgRNA的编码序列的载体。本发明专利技术还公开了CRISPR-Cas9系统在编辑CXCR4基因和制备用于HIV感染的药物中的应用。本发明专利技术可以实现CXCR4基因的编辑,使得细胞无法被HIV感染。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因工程领域,涉及嗜热链球菌CRISPR_Cas9系统识别的靶序列和 sgRNA及它们的相关应用。
技术介绍
获得性免疫缺陷综合征(acquired immunodeficiency syndrome,AIDS)又称艾滋 病,是一种危害性极大的传染病。自发现的三十多年来,AIDS已累计导致两千余万人死亡, 一直是一个巨大的公众健康难题,影响着全球3, 530万人的生活。AIDS是由人类免疫缺陷 病毒(Human Immunodeficiency Virus,HIV)感染引起的,HIV是一种感染人类免疫系统细 胞的慢病毒,属反转录病毒的一种,又称为艾滋病毒。HIV可分为HIV-1和HIV-2两种亚型, HIV-1的致病力强,是引起艾滋病的主要病原体。 ⑶4+T细胞是HIV-1病毒感染过程的首要靶点,随后研究又发现仅有⑶4分子并不 能介导HIV-1病毒的侵入,同时还需要一种或几种辅助受体(coreceptor)。1996年证实, 趋化因子受体CXCR4和CCR5是HIV-1病毒感染的辅助受体。其中,趋化因子CCR5,作为G 蛋白親联受体(G-protein coupled receptor,GPCR)超家族的细胞膜蛋白,是HIV-1入侵 机体细胞的主要辅助受体之一。CCR5主要在静止期记忆性T淋巴细胞、单核细胞和未成熟 的树突状细胞的膜上表达,是HIV-1入侵人体时重要的辅助受体,它作为HIV-1入侵机体细 胞的主要辅助受体之一,在治疗艾滋病研究中是一个重要的药物靶点。 其中,趋化因子受体CXCR4是趋化因子基质细胞衍生因子-1(CXCL12)的特异受 体。CXCL12对淋巴细胞有强烈的趋化作用。CXCR4主要表达于单核细胞、中性粒细胞、淋巴 细胞和PHA激活的T细胞,它是由352个氨基酸组成的GPCR,具有七次穿膜结构。CXCR4分 胞内区、跨膜区和胞外区。胞外区包括N端和3个胞外环,其中有两个潜在的糖基化位点和 四个半胱氨酸残基。其中的第二个胞外环对受体活性显示了重要的作用。CXCR4的糖基化位 点的作用是可遮盖与病毒包膜蛋白结合位点,但点突变对辅助受体活性并无太大影响。跨 膜区含一些脯氨酸残基,胞内区包括三个胞内环和富含丝氨酸和苏氨酸的高度保守序列, 并有一个G蛋白结合保守区。受体与配体结合后可能被磷酸化,并与G蛋白偶联。CXCR4参 与体内多种生理机制,包括参与造血功能,胚胎发育,及肿瘤迀移等,也是HIV-1入侵机体 细胞的主要辅助受体之一,在治疗艾滋病研究中是一个重要的药物靶点。 目前对艾滋病的治疗手段主要是控制HIV-1病毒的感染以及阻碍AIDS的发展,称 为高效抗逆转录病毒治疗法(highly active antiretroviral therapy,HAART),包括一系 列抑制病毒各个繁殖阶段的化合物。HAART是能很大程度上减少细胞内病毒的繁殖和血浆 病毒血症的发生,但对于新的宿主细胞不被HIV-1感染没有作用。为了从源头上预防健康 的细胞被HIV-1感染,新的治疗方案需要彻底地破坏病毒的入侵途径,因而以CCR5为靶点 的HIV-1受体拮抗剂越来越受关注,主要有趋化因子衍生物、非肽类小分子化合物、单克隆 抗体、肽类化合物等。经典的CCR5拮抗剂抑制R5嗜性的HIV-1感染细胞的机制是:它们 与CCR5结合后,使CCR5构象改变,导致CCR5的内源化作用(internalization)或者不利 于HIV-1的识别,阻断HIV-1与细胞膜蛋白的结合,导致HIV-1与CCR5在细胞表面的结合 减少,从而起到抗感染的作用。但不幸的是长期使用一种抑制剂,最终会使HIV-1产生耐 药性,随着耐药性的不断出现,使得现有的抗HIV-1药物难以达到理想的治疗效果。同时, CCR5拮抗剂还存在如下缺点,例如,天然趋化因子的半衰期短和存在潜在的诱导炎症应答 作用;非肽类小分子化合物不能下调受体表达;肽类化合物不稳定、易降解;单克隆抗体存 在人体对药物的不适应性、潜在的过敏反应等缺点。 近年来,随着革巴向基因编辑技术的一步步突破,从ZFN(zinc finger nuclease) 到后来的 TALEN(transcription activator-like effector nuclease)以及最新的 CRISPR-Cas9技术,为艾滋病的彻底治愈提供了新的希望。研究表明带有CCR5编码基因 32 个核苷酸缺失的实验者接触HIV但未检测到HIV感染,表明了 CCR5影响HIV病毒入侵细胞, 说明CCR5基因是一个可靠、高效和安全的治疗HIV的靶点,因此能够实现CCR5在基因组层 面上的敲除也是可靠、高效和安全的治疗HIV的方法。2008年,Sangamo成功地利用ZFNs 在CD4+T细胞上实现CCR5的敲除,然而ZFN靶向敲除CCR5的效率较低,人们期待找到更高 效的CCR5的敲除策略。 规律成族间隔短回文重复系统(clustered regularly interspaced short palindromic repeat,CRISPR-associated,CRISPR_Cas9)是一种具有核酸内切酶活性 的复合体,是细菌和古细菌在进化过程中形成的一种免疫防御体系,用以对抗外来病毒 和外源DNA入侵。CRI SPR-cas9系统通过整合外源DNA片段到CRISPR中,利用CRISPR RNA(CRISPR_derived RNA,crRNA)和反式作用 RNA (trans-activating RNA,tracrRNA)特 异性地识别靶向序列,并对序列靶位点进行切割。在没有模板的条件下,发生非同源重组末 端连接(Non-homologous end joining,NHEJ),NHEJ修复的过程中往往会产生DNA的插入 或缺失(indel),造成移码突变,导致基因敲除。或者是在有同源模板的情况下,可通过另一 条同源重组(homologous recombination,HR)的修复途径进行修复,可实现对革E1向基因的 精确编辑,如引入特异突变或定点转基因。现在已经把两种小RNA (crRNA和tracrRNA)融 合成一条RNA链,简称sgRNA(single guide RNA),因此,能够设计、制备出精确性和特异性 靶向目标基因的sgRNA成为CRISPR-Cas9基因敲除的关键。
技术实现思路
本专利技术的目的是克服现有技术的不足,提供一种嗜热链球菌CRISPR_Cas9系统识 别的靶序列以及精确特异地靶向人CXCR4基因的sgRNA和它们的有关应用。 因此,为了实现上述目的,第一方面,本专利技术提供了一种CRISPR_Cas9系统识别的 靶序列,所述靶序列如SEQ ID N0:1-63中任意一个的第n-20位所示且η = 1-5。 第二方面,本专利技术提供了一种sgRNA,该sgRNA的序列为:5'_识别序列-招募Cas9 蛋白的序列-3',其中,所述识别序列对应的DNA序列如SEQ ID N0:l-63中任意一个的第 n-20位所示且η = 1-5。 第三方面,本专利技术提供了编码第二方面所述的sgRNA的DNA分子。 第四方面,本专利技术提供了一种CRISP本文档来自技高网
...

【技术保护点】
一种CRISPR‑Cas9系统识别的靶序列,其特征在于,所述靶序列如SEQ ID NO:1‑63中任意一个的第n‑20位所示且n=1‑5。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:张竞方秦小平
申请(专利权)人:芜湖医诺生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:安徽;34

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1